linux環(huán)境下安裝miniconda軟件
minconda是什么寺谤,應(yīng)用領(lǐng)域
miniconda是condoa的組成一部分,它是專門化的軟件吮播,主要是應(yīng)用于生信領(lǐng)域的分析变屁。
在Linux環(huán)境下的安裝
直接輸入命令
小潔老師給的命令
wget https://repo.continuum.io/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
或者通過清華大學(xué)鏡像網(wǎng)站https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/
前加wget 直接獲取,該鏡像網(wǎng)站的優(yōu)點(diǎn)是下載速度非骋夂荩快粟关,因此備受關(guān)注,而通過直接官方網(wǎng)站下載的方式环戈,下載速度比較慢闷板。
下載完成后利用
bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
進(jìn)行軟件的安裝,在中間的過程中院塞,需按照相關(guān)知識(shí)進(jìn)行操作遮晚,當(dāng)最終出現(xiàn)Thank you installing miniconda3說明該軟件已安裝成功。
激活conda
輸入指令
source ~/.bashrc
是一步非常重要的步驟迫悠,激活完畢鹏漆,即完成該軟件的安裝。
使用
- conda list 查看當(dāng)前服務(wù)器上安裝的所有軟件列表
- conda search fastqc 搜索conda軟件
- conda install fastqc -y 安裝軟件fastqc