JupyterLab中新建一個seruat分析環(huán)境

  1. 默認已經(jīng)安裝conda铣鹏，新建一個環(huán)境，名字叫seurat

    conda create -n seurat

  2. 進入環(huán)境

    source activate seurat

  3. 安裝seurat

    conda install -c conda-forge r-seurat

  4. 將這個環(huán)境加入jupyterLab, 為新的內(nèi)核起個名字seurat

    conda install -c conda-forge r-irkernel
conda install -c anaconda jupyter_client
cd R
# 進入R環(huán)境
> IRkernel::installspec(name = 'seurat', displayname = 'Seurat')

  5. 添加成功雾棺，可在jupyterlab中選擇相應(yīng)內(nèi)核白对。

此方法也可以應(yīng)用到添加其他R的內(nèi)核

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