method:
1疤坝、序列的搜集
2兆解、系統(tǒng)發(fā)育分析和共線性
3、選擇壓力分析
4跑揉、功能分化分析（Ⅰ型锅睛，Ⅱ型）埠巨，用的軟件為DIVERGE.
5、熒光素酶活實驗
6现拒、WB實驗
7辣垒、胚胎發(fā)育時期的原位雜交
8、MO的knockdown實驗
conclusion：
本論文對斑馬魚NAMPT基因家族的兩個基因進行了研究印蔬，具體情況是勋桶，這兩個基因在魚類中存在兩個拷貝A 和 Ｂ，然而在四足類和哺乳類等中侥猬，只存在一個Ａ例驹，本論文，通過各種分析和實驗手段退唠，揭示：Ａ拷貝是在應對氧氣條件變化中鹃锈，發(fā)揮主要作用的拷貝，而Ｂ拷貝則承載著輔助的作用瞧预。亮點在于對這兩個基因進行了細致的各種分析：從基因的系統(tǒng)發(fā)育位置屎债，到基因在不同物種中的保守的共線性，對基因在不同物種中的氨基酸位點一致性垢油，以及通過選擇壓力分析了基因不同位點存在的選擇壓力盆驹。并把這些位點放在預測的蛋白質(zhì)三維結(jié)構上，而實驗方面卻沒有很大的突破滩愁，螢光素酶活躯喇，WB，原位雜交實驗都是普通的流程惊楼。對這個基因的表達玖瘸，位置秸讹，不同發(fā)育階段的表達做了一個細致的survey檀咙。敲除實驗也沒有發(fā)現(xiàn)明顯的拷貝之間的差異。但是好在所有該做的都做了璃诀，比較細致弧可。
啟示：
本論文告訴我們，如何做對于特定基因的分析劣欢。
TASK:
搜集這里面的數(shù)據(jù)棕诵，對分析部分做一下重復。重點集中在：
1）系統(tǒng)發(fā)育的構建（關注model凿将、不同方法的區(qū)別）校套；
2）選擇壓力分析（關注幾種模式including Branch，site, and Branch-site）
理解三種選擇壓力（balance牧抵、purify笛匙、positive selection）
3）了解一下基因分化的分析DIVERGE軟件侨把；
4）了解蛋白三維結(jié)構預測。以及不同的結(jié)構如何解釋妹孙。
5）共線性的分析方法（見簡書上其他人的分享TBtools）
