lncRNA命名的五種方式

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1.根據(jù)lncRNA與疾病的關系,比如:

CCAT1:Colon

cancerassociated transcript-1株依;

MIAT:myocardial

infarction associated transcript驱证,也叫RNCR2(retinal non-coding RNA2);

UCA1:Urothelial

carcinoma associated 1 ,

HULC:Highly

Upregulated in Liver Cancer恋腕。

2.根據(jù)lncRNA與周圍基因的位置抹锄,比如:

BACE1-AS:BACE1

antisense RNA;

HIF1A-AS2:LncRNAhypoxiainducible factor1alphaantisenseRNA-2

lincRNAHOTAIR:lincRNAHOXtranscript antisense RNA吗坚;

HOTTIP:lncRNA

HOXA transcript at the distal tip (HOTTIP)

而lncRNAasf的命名就直接是調(diào)控靶基因Fas的字母反過來祈远。

3.根據(jù)lncRNA與基因上下游的調(diào)控關系,比如:

BANCR:BRAF-regulatedlncRNA1商源,

ATB:lncRNA-activated

by TGF-β车份,

PANDA:P21-associated

noncoding RNA DNA damage-activated。

4.根據(jù)lncRNA參與的生物學功能牡彻,比如:

LincRNA-ROR:Long

Intergenic Non-Protein Coding RNA, Regulator Of

Reprogramming扫沼,

Xist:X-inactive-specific

transcript,

GAS5:growtharrest-specific5庄吼。

5.根據(jù)在細胞內(nèi)的定位缎除,比如:

Neat1:LncRNAnuclear-enrichedabundant transcript 1。

當然总寻,這是我們根據(jù)現(xiàn)在查到的分子進行總結(jié)的器罐,有的就直接使用我們前面提到的ENST,RP等ID來用渐行,也未嘗不可轰坊。

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