1.寫在前面的話
我對于R語言的學(xué)習(xí)盖矫，大概起步于三四年前唐瀑，科研上的畫圖確實離不開R群凶，畫圖很好看，特別在統(tǒng)計分析那一塊哄辣，R語言的優(yōu)勢是很大的请梢，一些R包的使用也非常方便快捷，但長時間不用還是會生疏力穗，很多東西都忘光了毅弧。今天像當(dāng)初學(xué)習(xí)的那樣，重溫一下R語言的入門吧
2. R語言的安裝
R在電腦上操作可以使用兩個平臺：一個是R 一個是RStudio当窗，都可以在相應(yīng)的官網(wǎng)上找到够坐。對于RStudio，之前也沒具體學(xué)習(xí)過崖面，下面也是基于RStudio記得學(xué)習(xí)筆記元咙。
- 先下載，這個官網(wǎng)上有巫员，不多說庶香。注意一下，電腦用戶名必須是英文的简识。
- 安裝完了后打開赶掖，RStudio還是相當(dāng)友好的，分為四個區(qū)域七扰。
左上：編輯你的代碼的 右上：可以看你的變量和對象的奢赂，還可以看歷史命令
左下：控制臺，查看程序運(yùn)行的情況 右下：可以查看一些包的幫助命令颈走，不用像R一樣膳灶，需要另外用help命令查看。 - 設(shè)置工作路徑立由，這個就是RStudio工作時轧钓，數(shù)據(jù)呀司致，輸出圖片存放的位置（具體可以查看生信星球）。
3.畫個熱圖瞧一瞧（以pheatmap包為例）聋迎。
install.packages("pheatmap") #加載pheatmap包
install.packages("RColorBrewer")#調(diào)個顏色
library(pheatmap) #library這個包
library(RColorBrewer) #library這個包
test<-read.table(choose.files(),head=T,row.names=1) #讀取數(shù)據(jù)
pheatmap(test,color=brewer.pal(9,"YlOrRd"),cluster_rows = FALSE,cluster_cols = FALSE)#畫圖
如下（這個實驗的數(shù)據(jù)看起來不太和諧，哎枣耀，有點累）：
4.png
