一、DNA電泳相關(guān):
1、DNA電泳緩沖液:
(1)Tris-乙酸(TAE)緩沖液:TAE較為常用,且價(jià)格低搪花,但其緩沖能力較弱。所以TAE電泳需要蠕動(dòng)泵使兩極貯液槽進(jìn)行液體循環(huán)嘹害,而且TAE需要經(jīng)常更新撮竿;且要加入EDTA,目的在于鰲合二價(jià)離子笔呀,抑制DNase幢踏,以保護(hù)DNA。
①?TAE使用液:
1×:40mmol/L ?Tris-乙酸
1mmol/L ? EDTA
②?TAE貯存液(每L):
50×:242g ????Tris堿
57.1ml ??冰乙酸
100ml 0.5mol/L EDTA(pH8.0)
(2)Tris-硼酸(TBE)緩沖液:
①?TBE使用液:
0.5×:0.045mol/L ?Tris-硼酸
1mmol/L ??? EDTA
②?TBE貯存液(每L):
5×:?54g ????Tris堿
27.5ml ??硼酸
20ml 0.5mol/L EDTA(pH8.0)
(3)Tris-磷酸(TPE)緩沖液:
①?TPE使用液:
1×:90mmol/L ?Tris-磷酸
2mmol/L ? EDTA
②?TPE貯存液(每L):
10×:108g ????Tris堿
15.5ml ??85%磷酸
40ml 0.5mol/L EDTA(pH8.0)
2凿可、1%(線性DNA分子大小為400-6000)瓊脂糖凝膠DNA電泳操作過(guò)程:
①制膠:按要求取1g瓊脂糖加入1×TAE(或0.5×TAE)電泳緩沖液100ml惑折,置于三角瓶中,在沸水浴或微波爐中加熱至瓊脂糖溶解(一般中低火溫枯跑,3-5min即可)惨驶;
②溶液冷卻至60℃,加入EB至0.5μg/ml(2-3ml即可),充分混勻敛助;
③迅速倒入備好的膠模中粗卜;
④凝膠完全凝固后,小心移去梳子和封口膠帶纳击,將凝膠放入電泳槽中续扔;
⑤加入能沒過(guò)膠面1mm深的電泳緩沖液(TAE)攻臀;
⑥D(zhuǎn)NA樣品與加樣緩沖液(溴酚藍(lán))混合后,用微量移液吸頭加樣纱昧;
⑦蓋上電泳槽并通電刨啸,使DNA向正極移動(dòng)(黑極→紅極),1-5V/cm(80V電壓左右)進(jìn)行電泳(30min左右)识脆;
⑧電泳完畢设联,切斷電源,取出凝膠于紫外投射光源下觀察并拍照灼捂。
二离例、12%SDS-PAGE?的相關(guān)溶液
1、5×加樣緩沖液:
10% w/v SDS悉稠,10 mM DTT或β-巰基乙醇宫蛆,20% v/v甘油,0.2M Tris-HCl pH 6.8的猛,0.05% w/v?溴酚藍(lán)耀盗。??(注意:將不含DTT的1×SDS凝膠上樣緩沖液置于室溫下儲(chǔ)存,臨用前從1mol/L DTT儲(chǔ)液中添加到上述緩沖液中衰絮。)
5×Sample Buffer:
10% w/v SDS
10 mmol/L Dithiothreitol,or beta-mercapto-ethanol
20% v/v Glycerol ?
0.2 mol/L Tris-HCl pH 6.8
0.05% w/v Bromophenolblue
另:2×SDS?上樣液緩沖液:
100mL溶液中含0.5mol/L Tris-HCl(pH=6.8) 20mL , SDS 4 g ,甘油20 mL ,?溴酚藍(lán)0.2 g ,DTT3g;
2袍冷、1×電泳緩沖液:
25 mM Tris-HCl pH 8.8磷醋,200 mM?甘氨酸猫牡,0.1% w/vSDS。
1×Running Buffer
25mmol/L Tris-HCl pH 8.8
200~250mmol/L ???Glycine(電泳級(jí))(pH 8.3)
0.1% w/v SDS
可以配成5×貯存液邓线,在900ml去離子水中溶解15.1gTris堿和94g甘氨酸淌友,然后加入50ml 10%(m/v)電泳級(jí)SDS的貯存液,用去離子水補(bǔ)至1000ml即可骇陈。
3震庭、分離膠配方:
H2O 10.5,1.5 M Tris-HCl pH8.8 ?7.5你雌,20% w/v SDS 0.15器联,30%?丙烯酰胺?/ 0.8%?亞甲雙丙烯酰胺(/w/v) ?12.0,10% w/v?過(guò)硫酸銨?15婿崭,TEMED ?0.02(單位:mL拨拓,總體積25 mL)。注:過(guò)硫酸銨會(huì)緩慢分解氓栈,故應(yīng)每周新鮮配制渣磷,可用去離子水配制少量10%(m/v)儲(chǔ)存液于4℃保存。
Running Gel Solution (mL)?:
H2O ??????????????????????????????????????????????10.2
1.5 mol/L Tris-HCl pH8.8 ?????????????????????????????7.5
20% SDS (w/v) ????????????????????????????????????0.15
Acrylamide/Bis-acrylamide (30%/0.8% w/v)?12.0
10% ammonium persulfate (w/v)?0.15
TEMED 0.02
4授瘦、積層膠配方(4%?丙烯酰胺):
H2O 3.05醋界,0.5 M Tris-HCl pH6.8 1.25竟宋,20% w/v SDS 0.025,30%?丙烯酰胺?/ 0.8%?亞甲雙丙烯酰胺(/w/v) 0.65形纺,10% w/v過(guò)硫酸銨?0.025丘侠,TEMED 0.005(單位:mL,總體積5 mL)逐样。
Stacking Gel Solution (4% Acrylamide) (mL):
H2O ????????????????????????????????????????????????3.075
0.5 mol/L Tris-HCl pH6.8 ??????????????????????????????1.25
20% SDS (w/v) ??????????????????????????????????????0.025
Acrylamide/Bis-acrylamide (30%/0.8% w/v)?0.67
10% ammonium persulfate (w/v)?0.025
TEMED 0.005
5婉陷、考馬斯亮藍(lán)染色液:
0.25 g考馬斯亮藍(lán)R250溶解于90 mL甲醇:水(1:1 v/v)和10 mL冰乙酸的混合液中,過(guò)濾除去顆粒狀物質(zhì)官研。(或考馬斯亮藍(lán)R-250 0.5g ,乙醇250mL ,乙酸110mL ,水740mL ,混勻;)
另:0.2%考馬斯亮蘭R-250染液:
甲醇?????????????????????????????? 46.5ml
醋酸?????????????????????????????? 7.0ml
考馬斯亮蘭???????????????????????? 0.2g
蒸餾水???????????? ????????????????加至100ml
6秽澳、脫色液:
170 mL甲醇,加70 mL冰乙酸,加蒸餾水定容至1000 mL戏羽。
三担神、蛋白質(zhì)純化的相關(guān)溶液
1、超聲破菌緩沖液:
20mmol/L Tris-HCl pH8.0始花、0.5mol/L NaCl妄讯、1mmol/L EDTA、1mg/mL溶菌酶
2酷宵、包涵體洗滌緩沖液:
20 mmol/L Tris-HCl pH 8.0亥贸,0.5 mol/L NaCl,2 mol/L尿素浇垦,2%?Triton炕置。?
3、包涵體溶解緩沖液:
20 mmol/L Tris-HCl pH 8.0男韧,0.5 mol/L NaCl朴摊,8 mol/L尿素,0.2 mmol/L DTT或100 mmol/L β-巰基乙醇此虑,2%Triton甚纲。
4、Ni2+親和層析柱純化緩沖液:
格式變形朦前,參考“生命科學(xué)技術(shù)摘集”
結(jié)合緩沖液(pH7.8):
20mmol/L?磷酸鈉
500mmol/L NaCl
洗滌緩沖液(pH6.0):
20mmol/L磷酸鈉
500mmol/LNaCl
咪唑洗脫緩沖液(pH6.0):
20mmol/L?磷酸鈉
500mmol/L NaCl
在洗滌緩沖液(pH6.0)中加入適量3mol/L咪唑分別配成10mmol/L介杆、50mmol/L?、100mmol/L和150 mmol/L的咪唑洗脫緩沖液韭寸。
Triton X-100(10% v/v)
酶和緩沖液:
DNase(1mg/ml)
溶菌酶
RNase(1mg/ml)
5春哨、2%Triton X-100溶液:
?量取2mlTriton X一100(聚乙二醇辛基苯基醚)液,加M緩沖液98ml即可棒仍。
6悲靴、50%PEG(聚乙二醇Polyethyleneglycol mwl500):
稱取0.5克PEG,用前放入試管中在酒精燈火焰上熔化,加入等量37℃予熱的MEM培養(yǎng)液癞尚,混勻耸三,保溫在37℃水浴中待用。
7浇揩、1%SDS(十二烷基硫酸鈉Sodium dodecyl sulfate,SDS):?
?SDS???????????????????????????????? 10g
?45%乙醇??????????????????????????? 100ml
8仪壮、1mol/LTris(三羥甲基氨基甲烷/鹽酸緩沖液Trihydroxy methylaminomethane Tris/HCL)pH7.8:
Tris???????????????????????????????? 12.114g
蒸餾水????????????????? ?????????????lOOml
先將Tris溶于少量蒸餾水,用HCI調(diào)pH至7.8胳徽,然后加水至100ml
四积锅、PH緩沖液的配制:
(1)磷酸緩沖鹽溶液(PBS):
①??137mmol/L NaCl
2.7mmol/L KCl
10mmol/L Na2HPO4
2mmol/L KH2PO4
用800ml蒸餾水溶解8g NaCl,0.2g KCl养盗,1.44g Na2HPO4和0.24g KH2PO4缚陷。用HCl調(diào)節(jié)溶液的PH值至7.4,加水至1L往核。分裝后在15psi(1.05kg/cm2)高壓蒸汽滅菌20min箫爷,或過(guò)濾除菌,保存于室溫聂儒。(注:PBS是一種通用試劑虎锚,值得指出的是上述列出的配方缺乏雙價(jià)陽(yáng)離子,如果需要衩婚,PBS可以補(bǔ)加成1mmol/L CaCl2和0.5mmol/L MgCl2)
②?0.01mol/LPBS(磷酸鹽緩沖液Phosphate Buffer Saline窜护,PBS),pH7.2:
A:0.2mol/L磷酸氫二鈉液(甲液):?
NaH2PO4·12H2O?????????????????????? 35.814g
雙蒸水?加至500ml
B:0.2mol/L磷酸二氫鈉液(乙液):
NaH2PO4·2H2O?????????????????????? 15.601g
雙蒸水?加至500ml
取甲液36ml非春,乙液14ml和NaCl 8.2克柱徙,加雙蒸水至1000ml∷澳龋混勻待完全溶解分裝坐搔,經(jīng)高壓滅菌后保存于4℃冰箱備用藏研。
③?1/15 mol/L PBS(磷酸緩沖液Phosphate Buffer Solution敬矩,PBS):
甲液:1/15 mol/L Na2HPO4溶液
Na2HPO49.465g
蒸餾水??????????????????加至1000ml
乙液:l/15 mol/L KH2PO4溶液
KH2P049.07g
蒸餾水??????????????????加至1000m1
分裝在棕色瓶?jī)?nèi),于4℃冰箱中保存蠢挡,用時(shí)甲弧岳、乙兩液各按不同比例混合,即可得所需pH的緩沖液,見下表:
格式變形业踏,參考“生命科學(xué)技術(shù)摘集”
(2)10×Tris EDTA(TE):
①pH 7.4:
100mmol/L Tris-Cl(pH7.4)
10mmol/L EDTA(pH8.0)
②pH 7.6:
100mmol/L Tris-Cl(pH7.6)
10mmol/L EDTA(pH8.0)
③pH 8.0:
100mmol/L Tris-Cl(pH8.0)
10mmol/L EDTA(pH8.0)
分裝后在15psi(1.05kg/cm2)高壓蒸汽滅菌20min禽炬,保存于室溫。
(3)Tris-Cl(1mol/L):
用800ml蒸餾水溶解121.1gTris堿勤家,加濃鹽酸調(diào)pH?至所需值腹尖。
pH ????????????HCl
7.4 ???????????70ml
7.6 ???????????60ml
8.0 ???????????42ml
應(yīng)使溶液冷至室溫后,方可最后調(diào)定pH?值伐脖。加水定容至1L热幔。分裝后高壓蒸汽滅菌乐设。如果1mol/L溶液呈現(xiàn)黃色,應(yīng)予丟棄绎巨。并使用質(zhì)量更好的Tris近尚。Tris溶液的pH?值因溫度而異,溫度每升高1℃场勤,pH?值大約降低0.03單位戈锻,0.05mol/L溶液在5℃,25℃和37℃時(shí)的pH?值分別為9.5和媳,8.9和8.6格遭。
(4)Tris緩沖鹽溶液(TBS):
用800ml蒸餾水溶解8g NaCl,0.2g KCl和3g Tris堿留瞳,加入0.015g酚紅并用HCl調(diào)pH值至7.4如庭,用蒸餾水定容至1L。分裝后在15 psi(1.05 kg/cm2)高壓下蒸汽滅菌20min撼港,保存于室溫坪它。
五、常用緩沖液配制:
(1)碳酸鈉-碳酸氫鈉緩沖液
貯備液A:0.2 mol/L碳酸鈉(Na2CO3·H2O 24.8g配成1000ml)帝牡;
貯備液B:0.2 mol/L碳酸氫鈉(NaHCO3?16.8g配成1000ml)往毡。
x ml A液?+ y ml B液稀釋至200ml
格式變形,參考“生命科學(xué)技術(shù)摘集”
(2)磷酸二氫鈉-磷酸氫二鈉緩沖液
貯備液A:0.2 mol/L磷酸二氫鈉(NaH2PO3·H2O 27.6g或NaH2PO3·2H2O 31.21g配成1000ml)靶溜;
貯備液B:0.2 mol/L磷酸氫二鈉(Na2HPO3·2H2O 35.61g或Na2HPO3·12H2O 71.64g配成1000ml)开瞭。
x ml A液?+ y ml B液稀釋至100ml
格式變形,參考“生命科學(xué)技術(shù)摘集”
(3)Tris-HCl緩沖液
貯備液A:0.2 mol/L三羥甲氨基烷(Tris-ydroxy methyLamino methanne,C4H11NO3罩息,24.2g配成1000ml)嗤详;
貯備液B:0.2 mol/L鹽酸(濃HCl?17.1ml配成1000ml)。
50ml ml A液?+ x ml B液稀釋至200ml
格式變形瓷炮,參考“生命科學(xué)技術(shù)摘集”
(4)檸檬酸-檸檬酸鈉緩沖液
貯備液A:0.1 mol/L檸檬酸(C6H8O7葱色,19.21g配成1000ml);
貯備液B:0.1 mol/L檸檬酸鈉(C6H5O7Na3·2H2O 29.41g配成1000ml)娘香。
x ml A液?+ y ml B液稀釋至100ml
格式變形苍狰,參考“生命科學(xué)技術(shù)摘集”
(5)醋酸-醋酸鈉緩沖液
貯備液A:0.2 mol/L醋酸(冰醋酸11.55ml稀釋至1000ml);
貯備液B:0.2 mol/L醋酸鈉(C2H2O2Na 16.4g或C2H2O2Na·3H2O 27g配成1000ml)烘绽。
x ml A液?+ y ml B液稀釋至1000ml
格式變形淋昭,參考“生命科學(xué)技術(shù)摘集”
六、細(xì)胞培養(yǎng)和細(xì)胞融合溶液:
1安接、0.25%胰蛋白酶-0.02%EDTA混合消化液:
胰蛋白酶(Trypsin)粉???????????????? 0.25g
EDTA粉???????????????????????????? 20.0mg
0.01mol/L PBS????????????????????? 100ml
先用少量PBS溶解胰蛋白酶翔忽,然后將EDTA粉末和剩下的液體加入混合,置37℃水浴中1小時(shí)左右(待徹底溶解,液體呈透明為止)歇式,用G5抽濾矢赁,分裝置4℃冰箱中保存。
2贬丛、Hanks液:
(1)原液
①原液甲:
??NaCl???????????????????????????????? 160g
??KCl?????????? ????????????????????????8g
MgSO4·7H2O???????????????????? 2g
MgCI2·6H2O???????????????????????2g
??溶于800ml餾水中撩银。
CaCl2(無(wú)水)????????????????????????2.8g
??溶于100ml蒸餾水中。
??將兩種液體混合后豺憔,加水至1000ml用濾紙濾過(guò)额获,再加2ml氯仿防腐,置4℃冰箱備用恭应。
②原液乙:
Na2HPO4·12H2O??? ???????????????3.04g
KH2PO41.2g
??葡萄糖?????????????????????????????????20.0g
??溶于800ml蒸餾水中抄邀,用濾紙過(guò)濾,然后加0.5%酚紅80ml昼榛,再加水至1000ml境肾,最后加入2ml氯仿防腐,置4℃冰箱備用胆屿。
(2)使用液
甲乙兩液各1份奥喻,雙蒸水18份,混勻分裝包扎好瓶口非迹,經(jīng)10磅15分鐘高壓滅菌后置4℃冰箱中保存环鲤。使用時(shí)用5.6%NaHCO3調(diào)pH值到所需要求。
3憎兽、LB培養(yǎng)基(Luria-Bertani培養(yǎng)基):
每升培養(yǎng)基含有:
細(xì)菌培養(yǎng)用胰化蛋白胨(bacto-trytone)??????????10g
細(xì)菌培養(yǎng)用酵母提取物(bacto-yeast extract)??????5g
氯化鈉(NaCl)??????????????????????????????10g
在950ml重蒸水中分別加入上述組分冷离,搖動(dòng)容器直至溶質(zhì)完全溶解,用5mol/L氫氧化鈉(NaOH)(約0.2ml)調(diào)節(jié)pH值至7.0纯命,加入重蒸水定容至1L西剥,在1.034×105Pa高壓蒸汽滅菌20min。(液體培養(yǎng)基)
另:固體培養(yǎng)基(含有瓊脂或瓊脂糖的培養(yǎng)基)
按照上述配方配制液體培養(yǎng)基亿汞,高壓滅菌前加入下列試劑中的一份:
細(xì)菌培養(yǎng)用瓊脂(Bacto-Agar)??????15g/L(鋪制平板用)
細(xì)菌培養(yǎng)用瓊脂(Bacto-Agar)??????7g/L(配制頂層瓊脂用)
瓊脂糖????????????????????????????15g/L(鋪制平板用)
瓊脂糖????????????????????????????7g/L(配制頂層瓊脂用)
在15psi(1.05kg/cm2)高壓下滅菌20min瞭空。從高壓鍋取出培養(yǎng)基時(shí)應(yīng)輕輕旋動(dòng)以使溶解的瓊脂或瓊脂糖能夠均勻分布在整個(gè)培養(yǎng)基溶液中。必須小心留夜,此時(shí)培養(yǎng)基溶液可能過(guò)熱匙铡,旋動(dòng)液體可能會(huì)發(fā)生暴沸。應(yīng)使培養(yǎng)基降溫至50~60℃碍粥,方可加入不耐熱的物質(zhì)(如抗生素,加Amp的量為1:100)黑毅;為避免產(chǎn)生氣泡嚼摩,混勻培養(yǎng)基時(shí)應(yīng)采用旋動(dòng)的方式。然后可直接從燒瓶中倒置平板。90mm直徑的培養(yǎng)皿每個(gè)需約30~50ml的培養(yǎng)基枕面。如果平板上的培養(yǎng)基有氣泡形成愿卒,可在瓊脂或瓊脂糖凝結(jié)前用本生煤氣噴射燈灼燒培養(yǎng)基表面以除去之。設(shè)定顏色記號(hào)在相應(yīng)平板的邊緣作記號(hào)以區(qū)別不同的培養(yǎng)基潮秘。
培養(yǎng)基完全凝固后琼开,應(yīng)倒置平板并貯存于4℃?zhèn)溆谩J褂们?-2h應(yīng)取出貯存的平板枕荞。如果平板是新鮮配制的嗅绰,在37℃溫育時(shí)會(huì)“發(fā)汗”挣跋,便會(huì)導(dǎo)致細(xì)菌菌落或噬菌體噬菌斑在平板表面擴(kuò)散而增加交叉污染的機(jī)會(huì)。為避免這一問題,可以拭去平皿內(nèi)部的冷凝水并把平板倒置谍夭,37℃溫育數(shù)小時(shí)方予使用,也可以快甩一下平皿以除去冷凝水趴泌,為盡可能減少污染倒戏,除去蓋上的水滴時(shí),應(yīng)把開蓋的平板呈倒置狀態(tài)拿著瞭吃。
4碌嘀、Amp:抗生素(氨芐青霉素),濃度50mg/ml(溶于水)歪架,溫度-20℃筏餐,工作液(嚴(yán)密型質(zhì)粒:20μg/ml;松弛型質(zhì)粒60μg/ml)
5牡拇、IPTG:isopropyl-β-D-thiogalactoside(異丙基-β-D-硫代半乳糖苷)魁瞪,作為蛋白質(zhì)誘導(dǎo)劑。母液1M/L惠呼,工作液1mM/L