按我前面文章繼續(xù)反思:如何才能入門生信?中提到的學(xué)習(xí)方案執(zhí)行养铸。
總的方案:
孟老師推薦關(guān)于最后一部分的四大切入點雁芙,最后是把幾個不同的Seq的過程細節(jié)都了解一下轧膘。
第一部分:linux學(xué)習(xí)
北大羅老師linux 10大常用命令
北大羅老師 Unix 10大專用命令
北大羅老師 Unix 10大實用命令
只看這三個當(dāng)然還是不夠的,只用30個命令是薄發(fā)却特,沒有厚積扶供,薄發(fā)也是發(fā)不溜的。這里的話需要升級則是可以看《鳥哥的Linux私房菜:基礎(chǔ)篇》裂明,當(dāng)然還可以去看他的視頻椿浓,一般我在油管看,其他平臺有沒有我還沒查看過闽晦。
第二部分:測序基礎(chǔ)(我把統(tǒng)計學(xué)部分放到后面了)
陳巍學(xué)基因視頻學(xué)習(xí)筆記--視頻1:Illumina測序化學(xué)原理
陳巍學(xué)基因視頻學(xué)習(xí)筆記--視頻7:RNA-seq方法和應(yīng)用
陳巍學(xué)基因視頻學(xué)習(xí)筆記--視頻8:外顯子測序
陳巍學(xué)基因視頻學(xué)習(xí)筆記--視頻9:small RNA-seq
陳巍學(xué)基因視頻學(xué)習(xí)筆記--視頻10:單細胞DNA測序
陳巍學(xué)基因視頻學(xué)習(xí)筆記--視頻11:單細胞mRNA測序
測序基礎(chǔ)這部分扳碍,我之前看過一些視頻也做過一些筆記,因此我就勉強給自己過了仙蛉。在儲備不夠的時候笋敞,還需要再多多補充細節(jié)和復(fù)習(xí)。
第三部分:實戰(zhàn)訓(xùn)練
一個超簡單的轉(zhuǎn)錄組項目全過程--iMac+RNA-Seq(一)
一個超簡單的轉(zhuǎn)錄組項目全過程--iMac+RNA-Seq(二)QC
一個超簡單的轉(zhuǎn)錄組項目全過程--iMac+RNA-Seq(三)Alignment 比對
一個超簡單的轉(zhuǎn)錄組項目全過程--iMac+RNA-Seq(四)featureCounts
我目前只更新了上游分析荠瘪,下游由于涉及到R語言以及繪圖等等夯巷,復(fù)雜得多,因此需要慢慢學(xué)習(xí)哀墓。R語言部分趁餐,我在早期的時候依據(jù)果子老師的500行代碼進行了學(xué)習(xí)和注釋,但是由于練習(xí)不多篮绰,還不夠熟練后雷。R語言的學(xué)習(xí)筆記可太多了,并沒有放到簡書上來吠各⊥瓮唬可以看以下幾本書:
第四部分:統(tǒng)計學(xué)部分
由于事先我完全就沒有在統(tǒng)計學(xué)上下過功夫,現(xiàn)在就只是整理一下我看孟老師課程的資料贾漏,整理出學(xué)習(xí)計劃來候学。
先看《概率論和數(shù)理統(tǒng)計》+《醫(yī)學(xué)統(tǒng)計學(xué)》這是我上大學(xué)的時候的課本,學(xué)習(xí)重點如下(這是我目前學(xué)習(xí)統(tǒng)計的方向和方案):
其他進階的我并沒有列上纵散,感興趣請去B站看教學(xué)視頻~