單細(xì)胞從理論到實踐-這一本書就夠了

前面給大家介紹過一些單細(xì)胞相關(guān)的理論和實踐知識

  1. BD單細(xì)胞測序平臺Rhapsody(視頻)

  2. 10X單細(xì)胞RNA-seq技術(shù)(視頻)

  3. 10X單細(xì)胞混樣技術(shù)(視頻)

  4. 單細(xì)胞ATAC-seq技術(shù)介紹

  5. 免疫組庫

  6. 10X Genomics VDJ測序

  7. 10X Genomics的Visium空間基因表達(dá)解決方案

  8. 空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)(Spatial Transcriptomics)

  9. 單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析相關(guān)R包安裝(視頻)

  10. 單細(xì)胞小提琴圖+箱型圖

  11. Seurat單細(xì)胞繪圖函數(shù)DimHeatmap邊界無法調(diào)整

  12. 單細(xì)胞DoHeatmap畫熱圖標(biāo)簽出界

  13. unstack函數(shù)應(yīng)用——生成單細(xì)胞marker基因表格

  14. 為什么要選擇單細(xì)胞核RNA測序涌乳?

  15. PBMC or 全血爷怀,應(yīng)該選哪個运授?

  16. 單細(xì)胞測序公共數(shù)據(jù)庫(上)

  17. 單細(xì)胞測序公共數(shù)據(jù)庫(下)

  18. 單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)檢索新方法和參考數(shù)據(jù)庫

  19. 首個單細(xì)胞空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析可視化平臺

  20. 單細(xì)胞類型注釋工具singleR

  21. 基于人工智能度量學(xué)習(xí)的單細(xì)胞類型鑒定新方法

  22. 單細(xì)胞SCENIC分析——尋找驅(qū)動基因

  23. 單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)質(zhì)控

  24. scRNA-Seq數(shù)據(jù)預(yù)處理

  25. 單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析——降維

  26. 單細(xì)胞RNA數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)化與聚類分析

  27. 單細(xì)胞去除批次效應(yīng)軟件比較

  28. 單細(xì)胞測序的三種方式

  29. 人類細(xì)胞圖譜 — 讓你的細(xì)胞注釋更簡單

  30. 單細(xì)胞等高線圖

今天給大家安利一本比較系統(tǒng)的介紹單細(xì)胞原理到利用R做數(shù)據(jù)分析的電子書

由Bioconductor出品,品質(zhì)肯定有保障逗宜。

http://bioconductor.org/books/release/OSCA/

下面是這本書的目錄纺讲,可以看到基本上囊括了單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析的方方面面熬甚。從質(zhì)控(QC)到歸一化乡括,從特征篩選到降維诲泌,從聚類到marker基因挑選铣鹏,從細(xì)胞亞群鑒定到數(shù)據(jù)整合吝沫。從單個樣本分析惨险,到多個樣本的比較辫愉。從單細(xì)胞RNA測序到多組學(xué)聯(lián)合分析恭朗。還包括了擬時序分析痰腮,免疫組庫分析膀值,最新的細(xì)胞核測序沧踏。理論結(jié)合實踐翘狱。真實單細(xì)胞測序數(shù)據(jù)+R代碼實操潦匈。把這本書啃完,應(yīng)該可以算半個單細(xì)胞專家了赤惊。趕緊練起來吧荐捻!

單細(xì)胞從理論到實踐-這一本書就夠了

?著作權(quán)歸作者所有,轉(zhuǎn)載或內(nèi)容合作請聯(lián)系作者
  • 序言:七十年代末,一起剝皮案震驚了整個濱河市魂角,隨后出現(xiàn)的幾起案子野揪,更是在濱河造成了極大的恐慌斯稳,老刑警劉巖挣惰,帶你破解...
    沈念sama閱讀 217,406評論 6 503
  • 序言:濱河連續(xù)發(fā)生了三起死亡事件珍语,死亡現(xiàn)場離奇詭異竖幔,居然都是意外死亡拳氢,警方通過查閱死者的電腦和手機饿幅,發(fā)現(xiàn)死者居然都...
    沈念sama閱讀 92,732評論 3 393
  • 文/潘曉璐 我一進(jìn)店門透乾,熙熙樓的掌柜王于貴愁眉苦臉地迎上來乳乌,“玉大人汉操,你說我怎么就攤上這事磷瘤〔筛浚” “怎么了挠他?”我有些...
    開封第一講書人閱讀 163,711評論 0 353
  • 文/不壞的土叔 我叫張陵贸呢,是天一觀的道長楞陷。 經(jīng)常有香客問我猜谚,道長魏铅,這世上最難降的妖魔是什么览芳? 我笑而不...
    開封第一講書人閱讀 58,380評論 1 293
  • 正文 為了忘掉前任沧竟,我火速辦了婚禮悟泵,結(jié)果婚禮上糕非,老公的妹妹穿的比我還像新娘朽肥。我一直安慰自己衡招,他們只是感情好始腾,可當(dāng)我...
    茶點故事閱讀 67,432評論 6 392
  • 文/花漫 我一把揭開白布浪箭。 她就那樣靜靜地躺著山林,像睡著了一般驼抹。 火紅的嫁衣襯著肌膚如雪框冀。 梳的紋絲不亂的頭發(fā)上明也,一...
    開封第一講書人閱讀 51,301評論 1 301
  • 那天绣硝,我揣著相機與錄音鹉胖,去河邊找鬼甫菠。 笑死寂诱,一個胖子當(dāng)著我的面吹牛痰洒,可吹牛的內(nèi)容都是我干的带迟。 我是一名探鬼主播仓犬,決...
    沈念sama閱讀 40,145評論 3 418
  • 文/蒼蘭香墨 我猛地睜開眼搀继,長吁一口氣:“原來是場噩夢啊……” “哼叽躯!你這毒婦竟也來了点骑?” 一聲冷哼從身側(cè)響起黑滴,我...
    開封第一講書人閱讀 39,008評論 0 276
  • 序言:老撾萬榮一對情侶失蹤菜谣,失蹤者是張志新(化名)和其女友劉穎尾膊,沒想到半個月后冈敛,有當(dāng)?shù)厝嗽跇淞掷锇l(fā)現(xiàn)了一具尸體莺债,經(jīng)...
    沈念sama閱讀 45,443評論 1 314
  • 正文 獨居荒郊野嶺守林人離奇死亡,尸身上長有42處帶血的膿包…… 初始之章·張勛 以下內(nèi)容為張勛視角 年9月15日...
    茶點故事閱讀 37,649評論 3 334
  • 正文 我和宋清朗相戀三年椎侠,在試婚紗的時候發(fā)現(xiàn)自己被綠了第租。 大學(xué)時的朋友給我發(fā)了我未婚夫和他白月光在一起吃飯的照片。...
    茶點故事閱讀 39,795評論 1 347
  • 序言:一個原本活蹦亂跳的男人離奇死亡我纪,死狀恐怖慎宾,靈堂內(nèi)的尸體忽然破棺而出,到底是詐尸還是另有隱情浅悉,我是刑警寧澤,帶...
    沈念sama閱讀 35,501評論 5 345
  • 正文 年R本政府宣布术健,位于F島的核電站汹碱,受9級特大地震影響,放射性物質(zhì)發(fā)生泄漏荞估。R本人自食惡果不足惜咳促,卻給世界環(huán)境...
    茶點故事閱讀 41,119評論 3 328
  • 文/蒙蒙 一、第九天 我趴在偏房一處隱蔽的房頂上張望勘伺。 院中可真熱鬧跪腹,春花似錦、人聲如沸飞醉。這莊子的主人今日做“春日...
    開封第一講書人閱讀 31,731評論 0 22
  • 文/蒼蘭香墨 我抬頭看了看天上的太陽。三九已至轴术,卻和暖如春蹲盘,著一層夾襖步出監(jiān)牢的瞬間,已是汗流浹背膳音。 一陣腳步聲響...
    開封第一講書人閱讀 32,865評論 1 269
  • 我被黑心中介騙來泰國打工召衔, 沒想到剛下飛機就差點兒被人妖公主榨干…… 1. 我叫王不留,地道東北人祭陷。 一個月前我還...
    沈念sama閱讀 47,899評論 2 370
  • 正文 我出身青樓苍凛,卻偏偏與公主長得像,于是被迫代替她去往敵國和親兵志。 傳聞我的和親對象是個殘疾皇子醇蝴,可洞房花燭夜當(dāng)晚...
    茶點故事閱讀 44,724評論 2 354

推薦閱讀更多精彩內(nèi)容