conda 使用教程

針對 ubuntu 20.04
ubuntu 20.04 是 “西柚云” 主要使用的操作系統(tǒng) 西柚云官網(wǎng)

參考教程： conda 的安裝和卸載

虛擬環(huán)境管理

1. conda env list （列出虛擬環(huán)境信息）
2. conda create -n <env_name> (創(chuàng)建虛擬環(huán)境)

   # 命令示例
   conda create -n py38 -y
   conda create -n py39 python=3.9 -y  # 官方推薦使用這種方式
   conda create -n py39_2 -y && conda install -n py39_2 python=3.9 -y
   
   # 比較兩種創(chuàng)建方式有何不同米愿，并無任何不同
   diff miniconda3/envs/py39 miniconda3/envs/py39_2
   

   在這里插入圖片描述
   
   

   可以看到强经，在創(chuàng)建環(huán)境時指定 python 版本檐盟，和創(chuàng)建完環(huán)境后安裝 python 的指定版本兩者導(dǎo)致的結(jié)果并無不同庸论，那為什么官方推薦在創(chuàng)建環(huán)境時使用 python=3.9 的方式指定 python
   版本呢手素？ 這是因為如果您要在該虛擬環(huán)境中使用 python死陆，就應(yīng)該在創(chuàng)建環(huán)境之初下載 python3.9 惊豺，之后在這個虛擬環(huán)境中下載的其他包都會匹配 python3.9的依賴與約束署照。如果安裝了很多其他包之后再安裝 python3.9，處理環(huán)境依賴就會變得較為復(fù)雜酗钞，甚至導(dǎo)致一些不易察覺的 bug腹忽。

3. conda activate <env_name> (進(jìn)入虛擬環(huán)境)

   # 命令示例
   conda activate py39
   

4. conda deactivate <env_name> (退出虛擬環(huán)境)

   # 命令示例
   conda deactivate 
   

5. conda remove -n <env_name> --all 刪除虛擬環(huán)境

   # 命令示例
   conda create -n test -y
   conda env list
   # 刪除 test 虛擬環(huán)境
   conda remove -n test --all
   conda env list
   

6. 導(dǎo)出虛擬環(huán)境

   # 適用于在相同操作系統(tǒng)版本下 clone 虛擬環(huán)境
   conda list --explicit > spec-list.txt
   # 適用于所有平臺之間 clone 虛擬環(huán)境
   conda env export > environment.yml
   

7. 根據(jù)導(dǎo)出的文件創(chuàng)建虛擬環(huán)境

   # 代碼示例
   # 根據(jù)導(dǎo)出包創(chuàng)建 env_name1 的虛擬環(huán)境
   conda create -n env_name1 --file spec-list.txt
   conda env create --file environment.yml
   

channels 管理

conda 處理 channels 的優(yōu)先級的步驟:
1. 按通道優(yōu)先級從高到低對包進(jìn)行排序。
2. 將捆綁的軟件包（具有相同通道優(yōu)先級的軟件包）從最高版本號到最低版本號排序砚作。例如窘奏，如果 channelA 包含 NumPy 1.12.0 和 1.13.1，則 NumPy 1.13.1 將被排序更高葫录。
3. 將仍然綁定的軟件包（具有相同通道優(yōu)先級和相同版本的軟件包）從最高到最低內(nèi)部版本號排序着裹。例如，如果 channelA 同時包含 NumPy 1.12.0 build 1 和 build 2米同，則 build 2 首先排序骇扇。通道B 中的任何包都將排在通道A 之下。
4. 安裝排序列表中滿足安裝規(guī)范的第一個包

1. 列出 conda 中配置的 channels面粮，根據(jù)從低到高的優(yōu)先級排列

   conda config --get channels 
   

2. 添加 channels少孝，添加國內(nèi)的 channels 也就是我們常說的添加國內(nèi)源

   conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
   conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
   conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/
   

3. 刪除 channels
   • 方法 1 （通過命令刪除）：

     # 首先查看 channels
     conda config --get channels
     # 刪除指定的 channels
     conda config --remove channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/
     

   • 方法 2 （編輯 .condarc 文件刪除想要刪除 channels 對應(yīng)的行）

     vi ~/.condarc
     

4. 安裝包時暫時添加 channels，此 channels 處于最高優(yōu)先級

   conda install -c bioconda presto
   

包管理

使用 conda 安裝包之前熬苍，需要在以下鏈接中搜索 conda 包稍走，找到安裝對應(yīng)包的命令后再進(jìn)行安裝
搜 conda 包

在這里插入圖片描述

1. conda list （查看當(dāng)前虛擬環(huán)境已經(jīng)安裝的包）
2. conda install <package_name>

   # 命令示例
   conda install --help
   # -y: yes
   conda install requests -y
   # -c: 臨時增加一個 channel ，并且增加的 channels 會處于最高優(yōu)先級
   conda install -c bioconda presto
   # -vv: 顯示下載過程中的詳細(xì)日志柴底，方便定位問題
   conda install numpy -y -vv
   # 后臺下載
   nohup conda install pandas -y &
   

3. conda 官方建議婿脸，使用 conda 安裝的 python包和使用 pip 安裝的 python 包是有略微不同的，如果可能柄驻，盡量使用 conda 來安裝包狐树。參考鏈接
   • 在 conda 4.6 以后，conda 可以識別 pip 安裝的 python包鸿脓，不過目前這一功能還處于實驗階段褪迟。
   • 在 conda 中應(yīng)該優(yōu)先使用 conda 安裝包冗恨，不要混用 conda 和 pip，可以設(shè)置一個虛擬環(huán)境專門用戶 pip 管理 python 包
   • conda 和 pip 都可以根據(jù)文件批量安裝 python 包

     pip list --format=freeze > requirements.txt
     pip install -r requirements.txt
     conda install -n env_name --file requirements.txt
     

配置管理

1. conda config --show

   # 查看 channels
   conda config --help
   conda config --get channels
   conda config --remove <key> <value>
   

我們很難記住那么多配置項的作用味赃，如果需要可以查閱 conda 官方教程對各配置項的詳解
conda 配置項的作用