學(xué)習(xí)小組Day3-小樂(lè)

Day3

昨天學(xué)習(xí)的是學(xué)習(xí)Linux的基礎(chǔ)準(zhǔn)備劳闹,以及幾個(gè)簡(jiǎn)單常用的指令,今天準(zhǔn)備學(xué)習(xí)Linux中軟件的安裝判没,軟件的安裝是基于conda這個(gè)軟件和環(huán)境的管理系統(tǒng)啊送,用conda可以很輕松地在Linux上安裝軟件,今天安裝的是conda的精簡(jiǎn)版——miniconda广恢,話不多說(shuō)凯旋,走著。

miniconda安裝

miniconda安裝

強(qiáng)調(diào)钉迷,安裝后一定要激活變量瓦阐,否則conda代碼都不能正常運(yùn)行,若變量無(wú)法正常激活篷牌,或者安裝失敗,就用rm -f ~/miniconda3將整個(gè)目錄刪除重新安裝

附上代碼

軟件安裝

用conta安裝軟件

附上代碼

  • conda install 軟件名 -y
  • conda remove 軟件名 -y

conta環(huán)境變量的配置

因?yàn)椴煌能浖蟮沫h(huán)境不同踏幻,甚至可能會(huì)起沖突枷颊,所以通過(guò)自行配置的方式,為軟件創(chuàng)造特殊的環(huán)境该面,來(lái)滿足不同軟件的運(yùn)行


conda環(huán)境變量配置流程

強(qiáng)調(diào)夭苗,配置時(shí)一定要-n,否則會(huì)報(bào)錯(cuò)隔缀,使用時(shí)一定要先激活
附上代碼

  • conda info --envs
  • conda create -n xxxxx python=3 fastqc trimmomatic -y
  • conda activate xxxxx
  • conda deactivate

初步學(xué)習(xí)题造,還有太多不懂的地方,筆記內(nèi)有任何問(wèn)題或錯(cuò)誤都?xì)g迎大家批評(píng)指出猾瘸!

今天就到這里界赔,明天繼續(xù)加油!

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