我們都知道在生物信息學(xué)領(lǐng)域师脂，R語(yǔ)言發(fā)揮著極其重要的價(jià)值，相信大家平時(shí)進(jìn)行個(gè)性化數(shù)據(jù)分析或者利用R進(jìn)行工具開(kāi)發(fā)時(shí)，主要用到的還是???织盼。
也就是最經(jīng)典的R語(yǔ)言集成開(kāi)發(fā)環(huán)境杨何，RStudio???。
但是當(dāng)我們需要撰寫(xiě)學(xué)習(xí)筆記時(shí)沥邻，單純的代碼輸入和控制臺(tái)運(yùn)行模式可能并不能完全滿足需求危虱。例如我們學(xué)習(xí)一個(gè)新的R工具包，在筆記撰寫(xiě)過(guò)程中唐全，需要帶有格式地記錄包的用途和原理埃跷，源碼解釋，示例代碼邮利，各種運(yùn)行結(jié)果弥雹，圖片和引用，個(gè)人的觀點(diǎn)與感悟等等延届。此時(shí)使用Markdown或者R Markdown剪勿，可以滿足需求，但是就實(shí)時(shí)響應(yīng)的便捷性方庭，這里還是要推薦另一種工具厕吉，即???。
The Jupyter Notebook is the original web application for creating and sharing computational documents. It offers a simple, streamlined, document-centric experience.
Jupyter Notebook集成在了Anaconda中二鳄，通過(guò)安裝Anaconda即可完成Jupyter Notebook的安裝赴涵，這是最簡(jiǎn)單的方式，當(dāng)然也可以單獨(dú)安裝订讼。
Jupyter Notebook與Kernel交互髓窜，而默認(rèn)的Jupyter Notebook是調(diào)用IPython Kernel，可通過(guò)在cmd中運(yùn)行jupyter kernelspec list查看欺殿。
而當(dāng)我們進(jìn)入Jupyter Notebook寄纵，點(diǎn)擊“New” ——> “Python 3”，即可調(diào)用IPython Kernel在Web端進(jìn)行Python編程脖苏。當(dāng)然這些對(duì)于Python用戶程拭，特別是著重?cái)?shù)據(jù)分析與科學(xué)計(jì)算領(lǐng)域的Python用戶，都是一些常識(shí)知識(shí)棍潘。那么如果我們想進(jìn)行R編程呢恃鞋？所需要的自然是安裝一個(gè)R Kernel，讓Jupyter Notebook可以調(diào)用它亦歉。
在R中安裝devtools::install_github('IRkernel/IRkernel')恤浪，然后根據(jù)自己的R版本（我的是R 4.1.2）運(yùn)行IRkernel::installspec(name = 'ir41', displayname = 'R 4.1')。（另外如果想刪除安裝的內(nèi)核肴楷，可在cmd中運(yùn)行jupyter kernelspec uninstall ir41）水由。
在Web端進(jìn)行R編程，支持Markdown格式赛蔫，Latex公式砂客，實(shí)時(shí)響應(yīng)代碼輸入輸出泥张，粗略的效果???：
參考：
https://github.com/ipython/ipykernel
https://github.com/IRkernel/IRkernel
