R爬蟲(chóng)實(shí)踐—抓取國(guó)自然基金信息【中篇】

R爬蟲(chóng)實(shí)踐—抓取國(guó)自然基金信息【上篇】簡(jiǎn)單介紹了如何爬取2016-2019年某一關(guān)鍵詞下的國(guó)自然信息岖瑰,當(dāng)需要一次獲取多種關(guān)鍵詞下的國(guó)自然信息時(shí)該怎么做鳖孤?比如咱們需要獲取lncRNA轻抱、miRNA奕剃、circRNA渣窜、腸道菌群吏垮、外泌體障涯,細(xì)胞焦亡等多個(gè)關(guān)鍵詞的國(guó)自然信息。

首先膳汪,分析各個(gè)關(guān)鍵詞下的首頁(yè)網(wǎng)址特征唯蝶,如下所示。

#lncRNA:'http://fund.zsci.com.cn/Index/index/title/lncRNA/start_year/2016/end_year/2019/xmid/0/search/1/p/1.html'
#miRNA: 'http://fund.zsci.com.cn/Index/index/title/miRNA/start_year/2016/end_year/2019/xmid/0/search/1/p/1.html'
#circRNA: "http://fund.zsci.com.cn/Index/index/title/circRNA/start_year/2016/end_year/2019/xmid/0/search/1/p/1.html"
#腸道菌群:"http://fund.zsci.com.cn/Index/index/title/%E8%82%A0%E9%81%93%E8%8F%8C%E7%BE%A4/start_year/2016/end_year/2019/xmid/0/search/1/p/1.html"
......

發(fā)現(xiàn)由關(guān)鍵詞首頁(yè)網(wǎng)址由以下幾部分組成:

[http://fund.zsci.com.cn/Index/index/title/]
[關(guān)鍵詞]
[/start_year/2016/end_year/2019/xmid/0/search/1/p/1.html]

接著遗嗽,分析每個(gè)關(guān)鍵詞下的網(wǎng)址特征粘我,以lncRNA為例,如下所示痹换。

#http://fund.zsci.com.cn/Index/index/title/lncRNA/start_year/2016/end_year/2019/xmid/0/search/1/p/1.html
#http://fund.zsci.com.cn/Index/index/title/lncRNA/start_year/2016/end_year/2019/xmid/0/search/1/p/2.html
#.......
#http://fund.zsci.com.cn/Index/index/title/lncRNA/start_year/2016/end_year/2019/xmid/0/search/1/p/lastpage_number.html

發(fā)現(xiàn)關(guān)鍵詞所有網(wǎng)址由以下幾部分組成:

[http://fund.zsci.com.cn/Index/index/title/]+
[關(guān)鍵詞]+
[/start_year/2016/end_year/2019/xmid/0/search/1/p/]+
[頁(yè)碼]+
[.html]

然后征字,根據(jù)以上分析出的網(wǎng)頁(yè)規(guī)律,提前構(gòu)建網(wǎng)頁(yè)地址的各個(gè)部分娇豫。

s1 <- c("http://fund.zsci.com.cn/Index/index/title/")
s2 <- c("/start_year/2016/end_year/2019/xmid/0/search/1/p/1.html")
part1 <- c("http://fund.zsci.com.cn/Index/index/title/")
part2 <- c("/start_year/2016/end_year/2019/xmid/0/search/1/p/")
keys <- c("lncRNA","miRNA","circRNA","單細(xì)胞","腸道菌群","外泌體","RNA甲基化","細(xì)胞焦亡")

正式開(kāi)始爬取~~~利用兩次循環(huán)匙姜,依次爬取各個(gè)關(guān)鍵詞下的國(guó)自然信息。具體過(guò)程:先獲取第一個(gè)關(guān)鍵詞檢索首頁(yè)——獲取末頁(yè)的網(wǎng)址——獲取最大頁(yè)碼——依次循環(huán)抓取1到最大頁(yè)碼的信息——結(jié)束后再進(jìn)行第二個(gè)關(guān)鍵詞(同樣過(guò)程冯痢,循環(huán)往復(fù))——直到最后一個(gè)關(guān)鍵詞的最后一頁(yè)——爬取結(jié)束搁料。

results <- data.frame(Title="題目",Author="負(fù)責(zé)人",Department="申請(qǐng)單位",
                      Type="研究類型",Project="項(xiàng)目批準(zhǔn)號(hào)",Date="批準(zhǔn)年度",Money="金額")

j <- 1
i <- 1

for (j in 1:length(keys)) {
  site <- paste0(s1,keys[j],s2)
  web <- read_html(site,encoding = "utf-8")
  lastpage_link <- web %>% html_nodes("div.layui-box a") %>% html_attr("href")
  lastpage_link <- paste0("http://fund.zsci.com.cn/",lastpage_link[length(lastpage_link)])
  lastpage_web <- read_html(lastpage_link,encoding = "utf-8")
  lastpage_number <-  lastpage_web %>% html_nodes("div.layui-box span.current") %>% html_text() %>% as.integer()
  print(lastpage_number)
  
  for(i in 1:lastpage_number){
    keysite <- paste0(part1,keys[j],part2,i,".html")
    web <- read_html(keysite,encoding = "utf-8")
    #---獲得基金標(biāo)題---
    Title <- web %>% html_nodes('ul a li h3') %>% html_text() # 標(biāo)題內(nèi)容解析
    Title
    #---獲得眾多信息---
    Information <- web %>% html_nodes('ul a li span') %>% html_text()  #獲取了負(fù)責(zé)人和單位信息
    Information
    #---獲取負(fù)責(zé)人信息---
    Author <-  Information[grep("負(fù)責(zé)人", Information)]
    Author
    #---獲得申請(qǐng)單位---
    Department <-  Information[grep("申請(qǐng)單位", Information)]
    Department
    #---獲取研究類型---
    jijintype <-  Information[grep("研究類型", Information)]
    jijintype
    #---獲得項(xiàng)目號(hào)---
    Project <-  Information[grep("項(xiàng)目批準(zhǔn)號(hào)", Information)]
    Project
    #---獲取批準(zhǔn)時(shí)間---
    Date <-  Information[grep("批準(zhǔn)年度", Information)]
    Date
    #---獲取基金金額---
    Money <- Information[grep("金額", Information)]
    Money 
    result <- data.frame(Title=Title,Author=Author,Department=Department,
                         Type=jijintype,Project=Project,Date=Date,Money=Money)
    
    results <- data.frame(Title="題目",Author="負(fù)責(zé)人",Department="申請(qǐng)單位",
                          Type="研究類型",Project="項(xiàng)目批準(zhǔn)號(hào)",Date="批準(zhǔn)年度",Money="金額")
    
    #合并所有頁(yè)面數(shù)據(jù)成數(shù)據(jù)框
    results <- rbind(results,result)
  }
    write.csv(results,file = paste0("2016-2019.",keys[j],".csv"))
}

最終爬取結(jié)果如下,每個(gè)關(guān)鍵詞條件下生成一個(gè)文件系羞。

image

往期回顧
R爬蟲(chóng)在工作中的一點(diǎn)妙用
R爬蟲(chóng)必備基礎(chǔ)——HTML和CSS初識(shí)
R爬蟲(chóng)必備基礎(chǔ)——靜態(tài)網(wǎng)頁(yè)+動(dòng)態(tài)網(wǎng)頁(yè)
R爬蟲(chóng)必備——rvest包的使用
R爬蟲(chóng)必備基礎(chǔ)——CSS+SelectorGadget
R爬蟲(chóng)必備基礎(chǔ)—Chrome開(kāi)發(fā)者工具(F12)
R爬蟲(chóng)必備基礎(chǔ)—HTTP協(xié)議
R爬蟲(chóng)必備—httr+POST請(qǐng)求類爬蟲(chóng)(網(wǎng)易云課堂)
R爬蟲(chóng)必備基礎(chǔ)—rvest為什么不用于動(dòng)態(tài)網(wǎng)頁(yè)郭计?
R爬蟲(chóng)必備——httr+GET請(qǐng)求類爬蟲(chóng)(解螺旋課程)
R爬蟲(chóng)實(shí)戰(zhàn)—抓取PubMed文章的基本信息
R爬蟲(chóng)實(shí)踐—抓取國(guó)自然基金信息【上篇】

?著作權(quán)歸作者所有,轉(zhuǎn)載或內(nèi)容合作請(qǐng)聯(lián)系作者
  • 序言:七十年代末,一起剝皮案震驚了整個(gè)濱河市椒振,隨后出現(xiàn)的幾起案子昭伸,更是在濱河造成了極大的恐慌,老刑警劉巖澎迎,帶你破解...
    沈念sama閱讀 206,839評(píng)論 6 482
  • 序言:濱河連續(xù)發(fā)生了三起死亡事件庐杨,死亡現(xiàn)場(chǎng)離奇詭異选调,居然都是意外死亡,警方通過(guò)查閱死者的電腦和手機(jī)灵份,發(fā)現(xiàn)死者居然都...
    沈念sama閱讀 88,543評(píng)論 2 382
  • 文/潘曉璐 我一進(jìn)店門(mén)仁堪,熙熙樓的掌柜王于貴愁眉苦臉地迎上來(lái),“玉大人填渠,你說(shuō)我怎么就攤上這事弦聂。” “怎么了氛什?”我有些...
    開(kāi)封第一講書(shū)人閱讀 153,116評(píng)論 0 344
  • 文/不壞的土叔 我叫張陵莺葫,是天一觀的道長(zhǎng)。 經(jīng)常有香客問(wèn)我枪眉,道長(zhǎng)捺檬,這世上最難降的妖魔是什么? 我笑而不...
    開(kāi)封第一講書(shū)人閱讀 55,371評(píng)論 1 279
  • 正文 為了忘掉前任贸铜,我火速辦了婚禮堡纬,結(jié)果婚禮上,老公的妹妹穿的比我還像新娘蒿秦。我一直安慰自己烤镐,他們只是感情好,可當(dāng)我...
    茶點(diǎn)故事閱讀 64,384評(píng)論 5 374
  • 文/花漫 我一把揭開(kāi)白布渤早。 她就那樣靜靜地躺著,像睡著了一般瘫俊。 火紅的嫁衣襯著肌膚如雪鹊杖。 梳的紋絲不亂的頭發(fā)上,一...
    開(kāi)封第一講書(shū)人閱讀 49,111評(píng)論 1 285
  • 那天扛芽,我揣著相機(jī)與錄音骂蓖,去河邊找鬼。 笑死川尖,一個(gè)胖子當(dāng)著我的面吹牛登下,可吹牛的內(nèi)容都是我干的。 我是一名探鬼主播叮喳,決...
    沈念sama閱讀 38,416評(píng)論 3 400
  • 文/蒼蘭香墨 我猛地睜開(kāi)眼被芳,長(zhǎng)吁一口氣:“原來(lái)是場(chǎng)噩夢(mèng)啊……” “哼!你這毒婦竟也來(lái)了馍悟?” 一聲冷哼從身側(cè)響起畔濒,我...
    開(kāi)封第一講書(shū)人閱讀 37,053評(píng)論 0 259
  • 序言:老撾萬(wàn)榮一對(duì)情侶失蹤,失蹤者是張志新(化名)和其女友劉穎锣咒,沒(méi)想到半個(gè)月后侵状,有當(dāng)?shù)厝嗽跇?shù)林里發(fā)現(xiàn)了一具尸體赞弥,經(jīng)...
    沈念sama閱讀 43,558評(píng)論 1 300
  • 正文 獨(dú)居荒郊野嶺守林人離奇死亡,尸身上長(zhǎng)有42處帶血的膿包…… 初始之章·張勛 以下內(nèi)容為張勛視角 年9月15日...
    茶點(diǎn)故事閱讀 36,007評(píng)論 2 325
  • 正文 我和宋清朗相戀三年趣兄,在試婚紗的時(shí)候發(fā)現(xiàn)自己被綠了绽左。 大學(xué)時(shí)的朋友給我發(fā)了我未婚夫和他白月光在一起吃飯的照片。...
    茶點(diǎn)故事閱讀 38,117評(píng)論 1 334
  • 序言:一個(gè)原本活蹦亂跳的男人離奇死亡艇潭,死狀恐怖拼窥,靈堂內(nèi)的尸體忽然破棺而出,到底是詐尸還是另有隱情暴区,我是刑警寧澤闯团,帶...
    沈念sama閱讀 33,756評(píng)論 4 324
  • 正文 年R本政府宣布,位于F島的核電站仙粱,受9級(jí)特大地震影響房交,放射性物質(zhì)發(fā)生泄漏。R本人自食惡果不足惜伐割,卻給世界環(huán)境...
    茶點(diǎn)故事閱讀 39,324評(píng)論 3 307
  • 文/蒙蒙 一候味、第九天 我趴在偏房一處隱蔽的房頂上張望。 院中可真熱鬧隔心,春花似錦白群、人聲如沸。這莊子的主人今日做“春日...
    開(kāi)封第一講書(shū)人閱讀 30,315評(píng)論 0 19
  • 文/蒼蘭香墨 我抬頭看了看天上的太陽(yáng)。三九已至唯卖,卻和暖如春粱玲,著一層夾襖步出監(jiān)牢的瞬間,已是汗流浹背拜轨。 一陣腳步聲響...
    開(kāi)封第一講書(shū)人閱讀 31,539評(píng)論 1 262
  • 我被黑心中介騙來(lái)泰國(guó)打工抽减, 沒(méi)想到剛下飛機(jī)就差點(diǎn)兒被人妖公主榨干…… 1. 我叫王不留,地道東北人橄碾。 一個(gè)月前我還...
    沈念sama閱讀 45,578評(píng)論 2 355
  • 正文 我出身青樓卵沉,卻偏偏與公主長(zhǎng)得像,于是被迫代替她去往敵國(guó)和親法牲。 傳聞我的和親對(duì)象是個(gè)殘疾皇子史汗,可洞房花燭夜當(dāng)晚...
    茶點(diǎn)故事閱讀 42,877評(píng)論 2 345