所有網(wǎng)絡(luò)摩渺,包括生物網(wǎng)絡(luò) biological networks偶洋、社交網(wǎng)絡(luò) social networks饲趋、技術(shù)網(wǎng)絡(luò)(例如計算機網(wǎng)絡(luò)和電路)等,都可以用圖的形式來表示炮温,這些圖中會包括各種各樣的子圖 subgraphs火脉。網(wǎng)絡(luò)的一個重要的局部性質(zhì)是所謂的網(wǎng)絡(luò)模體,即重復(fù)且具有統(tǒng)計意義的子圖或模式 patterns。
網(wǎng)絡(luò)模體 Network motifs(NM)是指在特定網(wǎng)絡(luò)或各種網(wǎng)絡(luò)中重復(fù)出現(xiàn)的相同的子圖倦挂。這些子圖由頂點之間特定的交互模式定義畸颅,一個子圖便可以反映一個框架,這個框架可以有效地實現(xiàn)某個特定的功能方援。事實上没炒,之所以說模體是一個重要的特性,正是因為它們可能反映出對應(yīng)網(wǎng)絡(luò)功能的這一性質(zhì)犯戏。近年來這一概念作為揭示復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)設(shè)計原理的一個有用概念而受到了廣泛的關(guān)注送火。[1] 但是,雖然通過研究網(wǎng)絡(luò)模體可以深入了解網(wǎng)絡(luò)的功能先匪,但是對于模體的檢測在計算上是具有挑戰(zhàn)性的种吸。
目錄
工具鏈接:
https://www.weizmann.ac.il/mcb/UriAlon/download/network-motif-software