最近在看網(wǎng)絡(luò)藥理學相關(guān)的內(nèi)容
推薦一個好用的網(wǎng)站拢切,根據(jù)蛋白質(zhì)uniprot轉(zhuǎn)換為基因名(無需代碼)
https://www.uniprot.org/uploadlists/
網(wǎng)站名字就叫做Uniprot荆烈,直接提交就好
只需要兩步就好刹勃,第二步選擇只需要from uniprot to gene name
或者ensemble name / entrez ID都可以谁不,看自己的需要吧
之前試過應(yīng)用R中org.Hs.eg.db包進行g(shù)ene name 和 gene symbol結(jié)合诅妹,然后合并票髓,但是寫代碼過程中發(fā)現(xiàn)gene name與uniprot的name并不一致锅纺,例如org包中ACHE的gene name 是“acetylcholinesterase (Cartwright blood group)”掷空,uniprot中的name是“Acetylcholinesterase”,雖然一致囤锉,但是內(nèi)容不完全相同坦弟,我的能力是沒辦法實現(xiàn)這種合并了,所以放棄而使用在線網(wǎng)站轉(zhuǎn)換官地,又快又不用動腦筋酿傍。