海哥，中國科學(xué)院遺傳與發(fā)育生物學(xué)研究所者蠕，生物信息學(xué)博士陋率。在生信寶典出品過多部“傻瓜式”教程。
生信寶典之傻瓜式 (二) 如何快速查找指定基因的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)
生信寶典之傻瓜式 (三) 我的基因在哪里發(fā)光 - 如何查找基因在發(fā)表研究中的表達(dá)
生信寶典之傻瓜式 (四) 蛋白蛋白互作網(wǎng)絡(luò)在線搜索
生信寶典之傻瓜式 (五) 文獻(xiàn)挖掘查找指定基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)
生信寶典之傻瓜式 (六) 查找轉(zhuǎn)錄因子的靶基因
這次海哥回北京杆勇，結(jié)合自己發(fā)表過的文章和其它經(jīng)典文章以及自己多年做研究的經(jīng)歷，從中心法則出發(fā)饱亿，為大家從不同層面介紹組學(xué)分析的手段蚜退，并解釋了不同方法都能解決什么具體的生物學(xué)問題闰靴。
本視頻內(nèi)容全面，簡(jiǎn)單易懂钻注，很適合想知道組學(xué)能做什么和生物數(shù)據(jù)分析沒有思路的朋友蚂且，能為你在學(xué)習(xí)、科研項(xiàng)目以及分析實(shí)戰(zhàn)的過程中提供很多的指導(dǎo)幅恋。
這次視頻最開始是在4天你也可以自己處理二代三代轉(zhuǎn)錄組測(cè)序數(shù)據(jù)最后一天的答疑課上給出的杏死，很受好評(píng)，現(xiàn)分享與此捆交。點(diǎn)擊閱讀原文即可限時(shí)免費(fèi)觀看淑翼。
（海哥講述詼諧，這次錄制是其第二次講零渐。有點(diǎn)遺憾的是窒舟，海哥自認(rèn)為沒有第一次講的好系忙，如果有緣诵盼，希望能在易生信極高性價(jià)比暑期黑馬集訓(xùn) -- 低至2500每人的暑期課上再講一次。）
下面是筆者自己觀看完視頻后的理解银还，蒼白的文字代表不了視頻风宁，有狗尾續(xù)貂之嫌，還請(qǐng)見諒蛹疯。
內(nèi)容概覽
形象地用盲人摸象闡述組學(xué)分析的優(yōu)勢(shì)
利用大數(shù)據(jù)關(guān)聯(lián)鳥和花的分布與云圖的關(guān)系戒财，便于精準(zhǔn)救治。
大數(shù)據(jù)告訴你為什么科比是NBA最偉大的球員之一捺弦？如何防守庫里饮寞？
用傳統(tǒng)實(shí)驗(yàn)得到的小數(shù)據(jù)去解釋生物學(xué)問題，就如同盲人摸象般列吼，盡管可以比較精確地描述某一問題幽崩，但是由于找不到全局的聯(lián)系而無法全面地做出解釋。隨著新一代測(cè)序技術(shù)的發(fā)展寞钥，生物大數(shù)據(jù)分析越來越受到生物學(xué)家們的青睞慌申，我們可以從各組學(xué)層面來了解某一生物樣本在某個(gè)狀態(tài)下的全貌。
1. DNA level
DNA level包括序列突變理郑、插入蹄溉、刪除、易位等您炉，會(huì)影響到基因編碼柒爵、轉(zhuǎn)錄因子motif結(jié)合，并舉了“畫蛇也可添足”的例子闡述蛇中增強(qiáng)子區(qū)域序列突變影響到ETS1結(jié)合赚爵，進(jìn)而足發(fā)育退化的故事棉胀。
之前的推文從Richard Young教授的系列研究看超級(jí)增強(qiáng)子發(fā)現(xiàn)背后的故事 (附超級(jí)增強(qiáng)子鑒定代碼)也介紹了一點(diǎn)增強(qiáng)子的知識(shí)和大牛的分析思路宴霸，可作為飯后閱讀小故事。
2. Transcriptional regulatory level
基因表達(dá)調(diào)控受轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合膏蚓、組蛋白修飾瓢谢、DNA甲基化等的影響，分析這些調(diào)控最常用的是ChIP-seq (詳細(xì)分析流程驮瞧，調(diào)整下也可適用于ATAC-seq)氓扛，ATAC-seq和亞硫酸鹽測(cè)序等。這在之前的培訓(xùn)中也有部分提及论笔，可在騰訊課堂看對(duì)應(yīng)視頻https://bioinfo.ke.qq.com采郎。
第二張圖是常見的基因組瀏覽器的展示，可以查看某個(gè)區(qū)域多個(gè)維度的信息狂魔，具體使用見高通量數(shù)據(jù)分析必備|基因組瀏覽器使用介紹 - 3系列文章蒜埋。
3. RNA level
RNA水平主要指RNA表達(dá)量變化、可變剪接形式變化最楷、RNA修飾整份、編輯、非編碼RNA調(diào)控等籽孙，這些部分的實(shí)戰(zhàn)會(huì)在我們的易生信極高性價(jià)比暑期黑馬集訓(xùn)中講到烈评。也可查看轉(zhuǎn)錄組分析的正確姿勢(shì)，轉(zhuǎn)錄組分析工具哪家強(qiáng)犯建？和120分的轉(zhuǎn)錄組試題（第三份答案）等讲冠。
RNA m6A是研究的比較火的修飾，我們也在王秀杰研究組合作發(fā)現(xiàn)m6A修飾在小腦發(fā)育中的新功能 （附2018上半年m6A研究文章和點(diǎn)評(píng)）中做過一點(diǎn)總結(jié)适瓦。
4. Translational level
翻譯水平是從Ribosome結(jié)合的角度查看潛在的蛋白表達(dá)量竿开。
5. Protein and metabolite level
蛋白質(zhì)組水平和代謝組水平，配合之前蛋白質(zhì)組學(xué)研究概述一起觀看玻熙。
感謝海哥的分享否彩！在此將本視頻推薦給大家，點(diǎn)擊文末鏈接即可限時(shí)免費(fèi)觀看揭芍。若您覺得不錯(cuò)胳搞，請(qǐng)轉(zhuǎn)給更多需要的人。
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