從BioMart中下載擬南芥和小麥的直系同源基因(Orthologues)

從BioMart中下載擬南芥和小麥的直系同源基因(Orthologues)

step1:進(jìn)入EnsemblPlants網(wǎng)站https://plants.ensembl.org/index.html

step2:點(diǎn)擊BioMart

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step3:選擇合適的數(shù)據(jù)庫(kù),這里選擬南芥的基因

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step4:選擇要導(dǎo)出的數(shù)據(jù)晰洒,這里選定導(dǎo)出擬南芥的基因ID耗美,以及擬南芥和小麥的orthologues

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選擇小麥的基因ID

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step5:點(diǎn)擊Results

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step6:選擇導(dǎo)出的文件格式,點(diǎn)擊Go拗军,導(dǎo)出結(jié)果

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導(dǎo)出的文件中包含所有擬南芥基因32833個(gè)(包含非編碼基因)和與擬南芥直系同源的51147個(gè)小麥基因喇完。(PS:如果最開(kāi)始的數(shù)據(jù)庫(kù)選的是小麥的,后面的orthologues選的是擬南芥的稠通,則結(jié)果為包含小麥所有基因和擬南芥部分基因)

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