在win系統(tǒng)上做生信數(shù)據(jù)分析如何快速檢查和填寫正確的文件路徑,避免分析報錯
文件路徑?jīng)]有填寫正確導(dǎo)致分析報錯或閃退的問題
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報錯示例截圖
報錯原因講解
我的軟件界面run_file_path文件路徑參數(shù)填寫的文件路徑是D:/omics_tools/demo_data/iris2.csv, 但是我的D盤的D:/omics_tools/demo_data是沒有這個文件的,只有一個D:/omics_tools/demo_data/iris.csv這個文件叠荠,所以我的文件路徑填錯了,給了一個無效的文件路徑竖共,軟件分析模塊界面的run_file_path等一些文件路徑尤其是run_file_path的文件路徑填錯了,導(dǎo)致分析模塊無法讀取到這個文件俺祠,就會出現(xiàn)閃退的情況公给,我們要保證給的路徑一定是完整的絕對路徑,并且這個路徑是文件的所在路徑蜘渣,就是可以正常對該數(shù)據(jù)文件進(jìn)行識別讀取和分析處理的淌铐。
快速檢測給的文件路徑是否正確有效的方法
檢測給的文件路徑是否正確,一個很簡單的方法就是把文件路徑直接粘貼到文件管理器的地址欄中蔫缸,如果能把這個文件找到或打開腿准,這個路徑就是正確的,否則,文件路徑?jīng)]有填寫正確吐葱。
把文件路徑直接粘貼到文件管理器的地址欄:
按enter回車鍵后街望,自動在wps或記事本中打開了iris.csv這個文件
如果該文件是一個txt,csv,xlsx等表格文件,把路徑粘貼到地址欄弟跑,按enter回車鍵后灾前,能在記事本或wps,excel等軟件中自動把這個表格文件打開,說明我們的文件路徑填寫的是正確的孟辑,否則哎甲,就是沒有填寫正確,需要堅持一些路徑哪些填錯了饲嗽。
快速正確填寫文件路徑的方法
讓文件管理器顯示出文件擴(kuò)展名如果我們沒有設(shè)置讓文件管理器顯示出文件擴(kuò)展名炭玫, 我們看到的文件名字是不完整的,像這樣:
比如貌虾,iris.csv這個文件吞加,只顯示了iris這個名字,我們直接復(fù)制iris這個名字作為文件路徑就是不完整和錯誤的酝惧。
這個時候榴鼎,我們需要先讓文件管理器能正常顯示出文件的擴(kuò)展名,設(shè)置方法如下:
在文件管理器中點(diǎn)擊查看---點(diǎn)擊顯示---點(diǎn)擊顯示文件擴(kuò)展名晚唇,讓文件擴(kuò)展名前面是有√的巫财。
設(shè)置好顯示文件擴(kuò)展名后,文件管理器顯示文件就是正常的文件名了哩陕,像這樣:
現(xiàn)在我們看到iris.csv的文件名就是顯示的是iris.csv,而不是之前的iris了平项,這樣我們?nèi)?fù)制iris.csv這個文件名,才是正常的名字悍及。
在記事本中通過復(fù)制粘貼快速得到該文件的完整正確的文件名絕對路徑用于軟件的分析模塊的正確路徑
- 我們在電腦先打開一個空白的記事本窗口:
2.1 在文件管理器中把光標(biāo)放到我們要分析的文件上面闽瓢,鼠標(biāo)右鍵點(diǎn)擊該文件,在彈出的菜單欄中選擇復(fù)制文件地址心赶,并按Ctrl+v粘貼到記事本中
我們把完整的文件路徑復(fù)制到記事本之后扣讼,需要把文件路徑兩邊的雙引號給刪除掉,因?yàn)镺micsTools分析模塊填寫的文件路徑都是不能加雙引號的
至此缨叫,現(xiàn)在就可以把這個完整的文件路徑粘貼到OmicsTools分析軟件對應(yīng)的文件路徑參數(shù)中了椭符。
2.2 可以在文件管理器中把光標(biāo)放到我們要分析的文件上面,直接按Ctrl+shift+C快捷鍵來復(fù)制文件的完整路徑地址耻姥,并按Ctrl+v粘貼到記事本中销钝,然后把文件路徑兩邊的雙引號給刪除掉,就可以把這個完整的文件路徑粘貼到OmicsTools分析軟件對應(yīng)的文件路徑參數(shù)中了琐簇。