27歲這一年锰瘸，我開始學(xué)生信
2017年，碩士入學(xué)昂灵，雖然當(dāng)時(shí)月薪3000避凝，我花了2000左右舞萄，在丁香園買了個(gè)科研課程中，雖然什么都沒學(xué)會(huì)管削，但是邂逅了“生物信息學(xué)”和“R語言”這兩個(gè)概念倒脓，就很值得。我當(dāng)時(shí)就知道它們很重要含思，我一定要學(xué)會(huì)崎弃，可惜當(dāng)時(shí)的我還沒遇到生信技能樹。當(dāng)然含潘，如果真遇到了饲做，我可能也不會(huì)有現(xiàn)在這般的熱情去學(xué)習(xí)它。所謂“知恥而后勇”遏弱，人只有受到足夠大的刺激才能迸發(fā)出足夠的激情盆均。
雖然我不記仇，但是尷尬和難堪的記憶總是最深刻的漱逸，也是最能激勵(lì)人奮進(jìn)的泪姨。第一次去打聽測序這件事，是因?yàn)檠幸粫r(shí)被碩士導(dǎo)師安排寫PDX模型相關(guān)的綜述饰抒，結(jié)果文章看多了肮砾，和PDX模型最相關(guān)的“腫瘤精準(zhǔn)治療”就吸引了我的注意力，從此袋坑，所有的科研想法就聚焦在這個(gè)理念上仗处。于是經(jīng)過校友介紹，認(rèn)識(shí)了一些做測序的公司咒彤，一問價(jià)格疆柔，都是1例樣本數(shù)萬元起步，最后還來一句：“沒錢做什么測序跋庵旷档？”第一學(xué)期完成碩士課程后，就開始上臨床干活歇拆，同時(shí)養(yǎng)細(xì)胞鞋屈，只有偶爾失眠時(shí)爬起來打開RStudio，一知半解地完成一個(gè)列線圖的教程故觅，直到東方既白厂庇，右下角終于出了個(gè)很丑的圖，把自己感動(dòng)得熱淚盈眶输吏。等我需要開始做課題時(shí)权旷，蹭著熱點(diǎn)，做了MeRIP-seq和RNA-seq贯溅，等結(jié)果出來后拄氯，想畫一張熱圖躲查，有人說，“需要幾千塊一張”译柏。有人說镣煮，“我們忙得要死，這么簡單的圖還是請(qǐng)客戶自己畫吧”鄙麦。于是在我網(wǎng)上瘋狂搜教程典唇，用Excel畫，用網(wǎng)頁小工具等等胯府，天天學(xué)介衔，天天試，學(xué)得太專注盟劫，還毀掉我一段感情夜牡，結(jié)果卻還是不理想。幸好這時(shí)遇到個(gè)靠譜的朋友侣签，幫我完成了畫圖這項(xiàng)工作，才一起發(fā)表文章并考上博士急迂，是幸運(yùn)協(xié)助導(dǎo)師中了個(gè)面上項(xiàng)目影所，碩士圓滿畢業(yè)。
2020年僚碎，博士入學(xué)的前一天猴娩，我給自己列了許多任務(wù)，第一項(xiàng)就是學(xué)會(huì)R語言和生信分析勺阐【碇校可是，自學(xué)實(shí)在太不容易渊抽，一看書就困蟆豫，漫無目的地做練習(xí)題就覺得浪費(fèi)了我看文獻(xiàn)的時(shí)間，思緒來回拉扯懒闷，無比糾結(jié)十减。某一天，不知在哪里收到一條訊息：“Hitplot”在線數(shù)據(jù)分析平臺(tái)要開發(fā)布會(huì)愤估。我迫不及待去聽了帮辟，發(fā)現(xiàn)這些工具的開發(fā)者居然都是全國各大醫(yī)院的醫(yī)學(xué)生。在感受到巨大差距后玩焰，我很失落由驹，同時(shí)也很振奮。我當(dāng)時(shí)產(chǎn)生一個(gè)想法昔园，“未來醫(yī)學(xué)科研工作者會(huì)分為兩類蔓榄，老一輩的憑借深厚的知識(shí)底蘊(yùn)闹炉，知道該做什么樣的研究，年輕一輩通過大數(shù)據(jù)分析润樱，機(jī)器學(xué)習(xí)等方法渣触，才能知道做什么方向更好∫既簦”于是嗅钻，借著免修英語的空擋，我去蹭了給碩士開的生物信息學(xué)課程店展。雖然能學(xué)到不少基礎(chǔ)知識(shí)养篓，但是仍然缺乏R語言實(shí)操。
轉(zhuǎn)折點(diǎn)出在偶然間和室友聊起生信分析赂蕴，他說這個(gè)不難柳弄，B站上有很多教程。于是概说，我第一次上了B站碧注，第一次看到了生信技能樹的免費(fèi)視頻。但也只是看了一點(diǎn)點(diǎn)糖赔，因?yàn)槲铱傆X得免費(fèi)的東西估計(jì)作用不大萍丐。幸運(yùn)的是，我關(guān)注了這個(gè)公眾號(hào)放典。之后就是按部就班地上完博士課程逝变，看文獻(xiàn)，想把碩士期間發(fā)現(xiàn)的東西延續(xù)著做一做奋构，偶爾艱難地推進(jìn)R語言的學(xué)習(xí)壳影。直到完成期末考后的某一天，我在生信技能樹上看到一條“數(shù)據(jù)挖掘培訓(xùn)”的推送弥臼，就像遇到了命中注定的那個(gè)人一樣宴咧，僅僅只看完標(biāo)題，我就馬上給博士導(dǎo)師發(fā)消息醋火，請(qǐng)求暫時(shí)不要拉我回臨床悠汽，給我2個(gè)月時(shí)間，讓我把這個(gè)課程學(xué)完芥驳。導(dǎo)師讓我再好好考慮一下柿冲，這個(gè)課程是否真的值得學(xué)習(xí)。我回答說：“不用再考慮了兆旬，我等這樣的課程已經(jīng)等3年了假抄。”
實(shí)在感謝導(dǎo)師的信任，不僅給我時(shí)間宿饱，還報(bào)銷了課程報(bào)名費(fèi)熏瞄。于是，我從2021年1月份開始聽課谬以，終于如愿以償强饮，下載到了我想研究的數(shù)據(jù)集。之后为黎，我給自己配了臺(tái)式機(jī)邮丰，除非吃飯或者偶爾的臨床任務(wù)，其余所有時(shí)間铭乾，我都是坐著或者站著電腦前看教程剪廉，改代碼，再看教程炕檩。直到2021年12月份斗蒋，我已經(jīng)完成2篇文章的分析，目前等待著驗(yàn)證結(jié)果笛质，也借此完成了博士開題泉沾。目前，我認(rèn)為轉(zhuǎn)錄組水平的分析经瓷，只要是R語言能完成的爆哑，通過各種教程的學(xué)習(xí)，都能實(shí)現(xiàn)舆吮，只是所需的時(shí)間長短不一而已。另外队贱，我也不會(huì)滿足于此色冀。我還在進(jìn)一步學(xué)習(xí)RNA-seq上游分析以及DNA層面的大數(shù)據(jù)分析，希望同時(shí)學(xué)好Lunix和Python柱嫌，以進(jìn)行更大規(guī)模和更高級(jí)的數(shù)據(jù)挖掘锋恬。
結(jié)合自己前期的科研經(jīng)歷，我希望在未來能以大數(shù)據(jù)分析為基礎(chǔ)编丘，結(jié)合分子生物學(xué)技術(shù)与学、計(jì)算機(jī)輔助藥物以及復(fù)合生物材料，建立一個(gè)完整的研究體系嘉抓，從臨床問題出發(fā)索守，逐步探究惡性腫瘤這一世紀(jì)難題。雖然現(xiàn)在還沒有太多經(jīng)費(fèi)抑片，但是感覺自己有方向卵佛，不迷茫，每天叫自己起床的都是“希望”。再次感謝導(dǎo)師截汪，感謝健明老師疾牲、小潔老師以及生信技能樹全體成員。
2021年12月23日星期四
寫于27歲生日前一天