難道赌蔑，這不像孔雀開屏嗎？
寫在前面
組學數據已經泛濫竟秫，但是信息的挖掘仍任重道遠娃惯。順手的工具，可以節(jié)省使用者盡可能多的時間肥败，或者將看起來很復雜渐逃，很難以完成的事情等浊，變得非常簡單犁罩。
圖形的掰彎届良，這個是我很久以前已經實現的功能哄啄，當然這個功能的靈感（而不是實現邏輯）來至《The Grammer of Graphics》（這本書也是R包ggplot2的實現基礎）蟆融。圖形的掰彎姐仅，正如本公眾號早前的推文介紹刊头，事實是笛卡爾坐標系像極坐標系轉換的過程仗颈。坐標的轉換是一個事情佛舱，而圖形的變換是另一個事情，比如矩形要辦成中空的扇形等挨决。
熱圖请祖，我已經不止一次談及，如果早前有關注生信札記公眾號的朋友脖祈，那么應該知道肆捕，TBtools有兩個熱圖功能，Amazing Heatmap和Fancy Heatmap Browser盖高，各有所長慎陵。一般用過的人眼虱，大部分時候都會覺得真的是Amazing。后者目前似乎用的人不多席纽，不過我們課題組有一些相關成果會應用上捏悬。或許有時候润梯，過于非常規(guī)的出圖邏輯（往往也是更優(yōu)秀的發(fā)表級圖片）并不能為多數人所接受过牙。所以沒有人用，也是意料之內纺铭。
優(yōu)秀的人寇钉，總是會突破已有局限的。
我寫Amazing Heatmap在先彤蔽，而后續(xù)才實現了掰彎邏輯摧莽。掰彎邏輯的實現，本身是為了Circos圖工具的實現顿痪。但是我并沒有想到镊辕，會有TBtools用戶在我之前挖掘出了掰彎的熱圖的使用邏輯。
掰彎的熱圖蚁袭，目前已可在數個已發(fā)表工作中見到征懈。往往，使用這一功能的目的揩悄，可能是盡可能展示更多的基因卖哎。這個需求其實很容易產生。有時候删性，我們展示十幾個基因亏娜，那么常規(guī)的矩形熱圖效果就很不錯；但是蹬挺，當基因數目上升到數十上百维贺，那么可能圖版就不好放下。此時巴帮，圓環(huán)狀的優(yōu)勢就會體現出來溯泣。
工具的使用
首先，應該升級TBtools到最新版本榕茧，然后垃沦，還是打開Amazing Heatmap這個工具
然后輸入數據，我直接用一個好基友的數據（屏蔽了樣品和基因名字）用押，
于是得到下圖肢簿，
恩，基因數太多，一般可以縮小文字译仗，當然抬虽，更多的時候，是調整圖片的大小纵菌，同時也調一下配色阐污，得到下圖
很明顯，此時圖片太長咱圆。
掰彎這個熱圖和聚類樹
第一步是笛辟，大概調整一些文字與圖形的距離，主要原因是文字總歸是文字序苏，使用的空間與我們圖形元件使用的空間不同手幢，所以距離需要自己多試試..., 我同時也調整了樹的寬度
首先是一個提示操作，TBtools的所有圖片是交互的忱详，原本圖是這樣的
在圖形外的空白處围来，鼠標右擊兩次，可顯示隱藏元件
可以看出這個圖片是之后包含幾個Panel匈睁，如聚類樹的Panel监透，和熱力圖矩形的Panel，大體了解了Panel的位置之后航唆，鼠標右擊兩次胀蛮，恢復隱藏模式
開始掰彎熱圖
以下關鍵操作，
鍵盤摁住Shift鍵不放手糯钙，鼠標左鍵分別單擊熱圖的TilePanel粪狼，和TreePanel，大概是下述兩個位置任岸。這樣就同時選擇了兩個Panel再榄，
摁住Shift鍵不放，鼠標右鍵TilePanel享潜，此時會出現菜單不跟，選擇
如此，即可合并兩個Panel（用于后續(xù)統(tǒng)一轉換坐標系）
接下來的操作就比較簡單米碰，對合并后的Panel，鼠標右鍵购城，調出菜單吕座，
隨后在彈出菜單中，設置自己需要的極坐標的參數瘪板，
這些參數吴趴，可以依據自己需要，不斷細調侮攀。具體就看個人需要了
比如你看都不想看到一個gap
只是锣枝，這個有什么用嗎厢拭？
當然，可能不要忘了撇叁，Amazing HeatMaps供鸠，是可以自定義樹結構的。
一些無關緊要的事情陨闹。
其實楞捂，如果你確實花時間去了解一個工具，那么并不會有那么多使用問題趋厉。如果有寨闹，那么一般是你想要使用別人甚至是開發(fā)者的時間來實現你的夢想。既然如此君账，其實你需要做的是考慮支付一定額度的酬勞繁堡。
真正做事情的，往往遇到問題乡数，會自己找到解決辦法椭蹄。比如這位朋友，自己搞定一個圖瞳脓，最后整到微信頭像上
比如塑娇，我并沒有寫這個教程，但是看到朋友圈劫侧，別人自己自然就可以使用TBtools繪制出來
很多時候埋酬，完成一件事情，使用一個工具烧栋，達成一個目的写妥，需要的或許是解決問題的思維，而不是問到的就是學會的审姓。
寫在后面
近日珍特，事情挺多的∧拢或許生物學問題值得做的事情已經很多了扎筒，寫工具已經放在第二甚至第三位。正如我們所看到的酬姆，過得好的嗜桌，更多的還是做生物學問題的，而不是寫工具的辞色。
當然骨宠，寫工具，本身也是為了解決生物學問題，只是為誰解決生物學問題层亿，這是一個需要問自己的問題桦卒。
