芯片探針與基因的對(duì)應(yīng)關(guān)系

常見(jiàn)的物種，對(duì)應(yīng)R包如下：

? ? ? ? gpl???????????organism??????????????????bioc_package

1?????GPL32???????Mus?musculus????????????????????????mgu74a

2?????GPL33???????Mus?musculus????????????????????????mgu74b

3?????GPL34???????Mus?musculus????????????????????????mgu74c

6?????GPL74???????Homo?sapiens????????????????????????hcg110

7?????GPL75???????Mus?musculus?????????????????????mu11ksuba

8?????GPL76???????Mus?musculus?????????????????????mu11ksubb

9?????GPL77???????Mus?musculus?????????????????????mu19ksuba

10????GPL78???????Mus?musculus?????????????????????mu19ksubb

11????GPL79???????Mus?musculus?????????????????????mu19ksubc

12????GPL80???????Homo?sapiens????????????????????????hu6800

13????GPL81???????Mus?musculus??????????????????????mgu74av2

14????GPL82???????Mus?musculus??????????????????????mgu74bv2

15????GPL83???????Mus?musculus??????????????????????mgu74cv2

16????GPL85??Rattus?norvegicus????????????????????????rgu34a

17????GPL86??Rattus?norvegicus????????????????????????rgu34b

18????GPL87??Rattus?norvegicus????????????????????????rgu34c

19????GPL88??Rattus?norvegicus?????????????????????????rnu34

20????GPL89??Rattus?norvegicus?????????????????????????rtu34

22????GPL91???????Homo?sapiens??????????????????????hgu95av2

23????GPL92???????Homo?sapiens????????????????????????hgu95b

24????GPL93???????Homo?sapiens????????????????????????hgu95c

25????GPL94???????Homo?sapiens????????????????????????hgu95d

26????GPL95???????Homo?sapiens????????????????????????hgu95e

27????GPL96???????Homo?sapiens???????????????????????hgu133a

28????GPL97???????Homo?sapiens???????????????????????hgu133b

29????GPL98???????Homo?sapiens?????????????????????hu35ksuba

30????GPL99???????Homo?sapiens?????????????????????hu35ksubb

31???GPL100???????Homo?sapiens?????????????????????hu35ksubc

32???GPL101???????Homo?sapiens?????????????????????hu35ksubd

36???GPL201???????Homo?sapiens???????????????????????hgfocus

37???GPL339???????Mus?musculus???????????????????????moe430a

38???GPL340???????Mus?musculus?????????????????????mouse4302

39???GPL341??Rattus?norvegicus???????????????????????rae230a

40???GPL342??Rattus?norvegicus???????????????????????rae230b

41???GPL570???????Homo?sapiens???????????????????hgu133plus2

42???GPL571???????Homo?sapiens??????????????????????hgu133a2

43???GPL886???????Homo?sapiens?????????????????????hgug4111a

44???GPL887???????Homo?sapiens?????????????????????hgug4110b

45??GPL1261???????Mus?musculus????????????????????mouse430a2

49??GPL1352???????Homo?sapiens???????????????????????u133x3p

50??GPL1355??Rattus?norvegicus???????????????????????rat2302

51??GPL1708???????Homo?sapiens?????????????????????hgug4112a

54??GPL2891???????Homo?sapiens???????????????????????h20kcod

55??GPL2898??Rattus?norvegicus?????????????????????adme16cod

60??GPL3921???????Homo?sapiens?????????????????????hthgu133a

63??GPL4191???????Homo?sapiens???????????????????????h10kcod

64??GPL5689???????Homo?sapiens?????????????????????hgug4100a

65??GPL6097???????Homo?sapiens???????????????illuminaHumanv1

66??GPL6102???????Homo?sapiens???????????????illuminaHumanv2

67??GPL6244???????Homo?sapiens???hugene10sttranscriptcluster

68??GPL6947???????Homo?sapiens???????????????illuminaHumanv3

69??GPL8300???????Homo?sapiens??????????????????????hgu95av2

70??GPL8490???????Homo?sapiens???IlluminaHumanMethylation27k

71?GPL10558???????Homo?sapiens???????????????illuminaHumanv4

72?GPL11532???????Homo?sapiens???hugene11sttranscriptcluster

73?GPL13497???????Homo?sapiens?????????HsAgilentDesign026652

74?GPL13534???????Homo?sapiens??IlluminaHumanMethylation450k

75?GPL13667???????Homo?sapiens????????????????????????hgu219

76?GPL15380???????Homo?sapiens??????GGHumanMethCancerPanelv1

77?GPL15396???????Homo?sapiens?????????????????????hthgu133b

78?GPL17897???????Homo?sapiens?????????????????????hthgu133a

參考菜鳥(niǎo)團(tuán)博客：http://www.bio-info-trainee.com/1399.html

http://www.reibang.com/p/f6906ba703a0

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