為什么今天要提到無縫拼接這項(xiàng)技術(shù)呢？
在開展動(dòng)物實(shí)驗(yàn)時(shí)岖研，不可避免地要拍攝完整器官切片的圖像警检，這也逐漸成為很多SCI期刊的要求扇雕。（如下圖所示）
局部圖像幾乎都存在“人為選擇”偏倚窥摄，甚至無法反映出真實(shí)情況，這種“管中窺豹”式的結(jié)果顯然說服力不強(qiáng)哨苛。
然而币砂，在具體執(zhí)行時(shí)，全數(shù)字切片掃描儀器僅僅只能幫助我們獲取小動(dòng)物（小鼠/大鼠）明場下的全器官圖像亿蒸，獲取熒光場下的全器官圖像很難。
此外边锁，受限于玻片尺寸和物鏡視野的顯示茅坛，大動(dòng)物（兔则拷、比格犬曹鸠、食蟹猴等）的全器官圖像很難獲取物延。
今天的推文就是為了以上問題仅父。
圖文教程
1.?搞科研都知道Image J可以用來分析蛋白條帶或IHC平均光密度。你肯定想不到耗溜，它還可以用來無縫拼接圖像省容。
一定要下載FiJi版本腥椒，接下來要用到其中的插件Stitching，否則無法進(jìn)行后續(xù)操作洒放。（開源軟件下載地址：https://imagej.net/Fiji）
2.?為避免軟件與系統(tǒng)沖突 或出現(xiàn)閃退滨砍，軟件盡量安裝在C盤的非program file (x86）的非中文文件夾內(nèi)。
3.?大尺寸的器官在4X物鏡下拍攝多張照片领追，保證部分區(qū)域有重合绒窑，這樣可以提高拼接精準(zhǔn)度龄句。例如想要獲取熒光染色后全腎圖像，可以在4X物鏡下拍攝2張有重合的圖片傀蓉。（現(xiàn)實(shí)中职抡，兩次拍攝的圖片絕對不存在無重合區(qū)的兩張圖，這是最常見的情況）
4.?用Image J 打開拍攝好的兩張圖窑邦。
5.?選中其中一張圖冈钦，按照如下選擇李请，將RGB彩圖分解為R、G导盅、B三種通道圖像较幌。
6.?同理乍炉，將另外一張彩圖也進(jìn)行分解滤馍。
7.?然后點(diǎn)擊Plugins，選擇Stitching衷恭，選擇Pairwise stitching纯续。
8.?在彈窗中猬错，分別按照對應(yīng)的通道選擇需要拼接的圖像茸歧，比如紅-紅软瞎、綠-綠、藍(lán)-藍(lán)涤浇。然后按照如下設(shè)置。
9.?稍等片刻，然后就能得到紅色通道的無縫拼接圖像。
10.?用同樣的操作依次獲取綠色通道和藍(lán)色通道的縫拼接圖像邀摆。
11.?點(diǎn)擊image，選擇color敷矫，選擇merge channels。將拼接好的紅-紅躏敢、綠-綠件余、藍(lán)-藍(lán)單通道圖像merge成為RGB彩圖遭居，如下設(shè)置后點(diǎn)擊OK。
12.?獲得無縫拼接后的RGB彩圖端壳∷鹎可點(diǎn)擊file ,save as保存為所需格式圖像岳颇。
13.?最終效果如下话侧。完美的無縫拼接效果！
Ending~~
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