HMM-Forward/Backward算法實(shí)現(xiàn)

  • M 個(gè)隱狀態(tài) - S^M
  • 長(zhǎng)度為T的觀測(cè)序列 - V^T
  • 轉(zhuǎn)移矩陣 - A
  • 發(fā)射矩陣 - B
  • 初始概率分布 - \pi

Evaluation Problem

給定 \theta, V_M \to 估計(jì) p(V_T|\theta), 其中 \theta \to s, v, a_{ij}, b_{jk}

方法:

  • 找出所有的隱狀態(tài)荒揣,S^M辉川, M是隱狀態(tài)的數(shù)目
  • 從所有的隱狀態(tài)序列S^M中重父,找到生成觀測(cè)序列V^T的概率

數(shù)學(xué)表達(dá):

p(V^T|\theta) = \sum_{r=1}^{R}p(V^T|S_{r}^{T})p(S_{r}^{T}) \\ where \quad S_{r}^{T} = \{s_1(1), s_2(2)... s_r(T)\}

上面的R=最大數(shù)目的關(guān)于隱狀態(tài)的可能序列
因此可以得到枯饿,1-T的時(shí)間位置上番川,每個(gè)時(shí)刻t都可能是上述M個(gè)隱狀態(tài)的任意一個(gè)取值,那么這個(gè)R的數(shù)目等于R = M^T

為了計(jì)算序列長(zhǎng)度為T的可觀測(cè)序列V^T的生成概率懈糯, 我們應(yīng)該采用每個(gè)可能的隱藏狀態(tài)序列,計(jì)算它們產(chǎn)生V^T的概率单雾,然后將這些概率相加赚哗。

以一個(gè)具體的示例講解

Forward-and-Backward-Algorithm-in-Hidden-Markov-Model-adeveloperdiary.com_.jpg

上述通過(guò)隱狀態(tài)生成的觀測(cè)序列:(sun, sun, rain) \to (happy, sad, happy)可以計(jì)算生成概率

p(happy, sad, happy | sun, sun, rain ) = p(happy|sun) * p(sad|sun) * p(happy|rain)

數(shù)學(xué)上:

p(V^T|S_{r}^{T}) = \prod_{t=1}^{T}p(v(t)|s(t))

但是不幸的是,我們真的不知道隱藏狀態(tài)的具體順序硅堆,這些順序會(huì)生成可觀測(cè)變量happy, sad, happy

我們可以計(jì)算V^T和與之對(duì)應(yīng)的S^T的聯(lián)合概率

Forward-and-Backward-Algorithm-in-Hidden-Markov-Model-adeveloperdiary.com-2.jpg

p(happy,sad,happy,sun,sun,rain) = p(sun|initial state) * p(sun|sun) * p(rain|sun) * p(happy|sun) * p(sad|sun) * p(happy|rain)

p(S^T) = p(sun|initial state) * p(sun|sun) * p(rain|sun) = \prod_{t=1}^{T}p(s(t)|s(t-1))
p(V^T|S^T) = p(happy|sun) * p(sad|sun) * p(happy|rain) = \prod_{t=1}^{T}p(v(t)|s(t))

p(V^T, S^T) = p(V^T|S^T)p(S^T) = \prod_{t=1}^{T}p(v(t)|s(t)) \prod_{t=1}^{T}p(s(t)|s(t-1))

上述只是特定的一個(gè)隱狀態(tài)序列生成觀測(cè)序列的例子屿储,那么還有別的觀測(cè)序列生成這個(gè)可觀測(cè)序列,那么對(duì)所有的序列進(jìn)行上述的計(jì)算然后求和

假設(shè)只有兩種隱狀態(tài)sun, rain, 那么一共有三個(gè)時(shí)刻渐逃,所以隱狀態(tài)序列的大小一共有2^3=8

p(happy,sad,happy|model) = p(happy,sad,happy,sun,sun,sun) + p(happy,sad,happy,sun,sun,rain) + p(happy,sad,happy,sun,rain,rain)+ . . .

數(shù)學(xué)上够掠,假設(shè)共有R種可能的序列R=M^T

\begin{equation} \label{eq1} \begin{split} p(V^T|\theta) & = \sum_{All Seq of S}p(V^T, S^T) \\ & = \sum_{All Seq of S}p(V^T|S^T)p(S^T) \\ & = \sum_{r=1}^{R}\prod_{t=1}^{T}p(v(t)|s(t)) \prod_{t=1}^{T}p(s(t)|s(t-1)) \\ & = \sum_{r=1}^{R}\prod_{t=1}^{T}p(v(t)|s(t))p(s(t)|s(t-1)) \end{split} \end{equation}

但是計(jì)算復(fù)雜度很高,O(M^T\cdot T)需要優(yōu)化茄菊, 我們將采用動(dòng)態(tài)規(guī)劃來(lái)克服上述解決方案中的指數(shù)計(jì)算疯潭。 有兩種這樣的算法赊堪,F(xiàn)orward算法,backward算法,可以指數(shù)級(jí)復(fù)雜度降到多項(xiàng)式復(fù)雜度O(M^2\cdot T)竖哩。

Forward算法

給定一系列可見(jiàn)狀態(tài)V^T哭廉,則隱馬爾可夫模型在特定時(shí)間步長(zhǎng)t處在特定隱藏狀態(tài)s的概率是多少。

\alpha(t) = p(v(1)...v(t), s(t)=j) = p(v_{1:t}, s(t)=j)

當(dāng)t=1時(shí):
\begin{equation} \label{eq222} \begin{split} \alpha_{j}(1) & = p(v_{k}(1), s(1)=j) \\ & = p(v_{k}(1)|s(1)=j)p(s(1)=j) \\ & = \pi_{j}p(v_{k}(1)|s(1)=j)\\ & = \pi_{j}b_{jk} \end{split} \end{equation}

  • 其中\pi=初始狀態(tài)分布
  • 上式中的b_{jk}表示t=1時(shí)刻的發(fā)射概率

如果通過(guò)向量的方式計(jì)算取不同的隱狀態(tài)j相叁,可以通過(guò)向量乘積計(jì)算遵绰,即\mathrm{\alpha(1)} = \mathrm{\pi}\mathrm{B_{:,k}}

當(dāng)t=2時(shí):

獲得t=1的結(jié)果后, t=2的計(jì)算公式中的一部分需要借助t=1的計(jì)算結(jié)果
\begin{equation} \label{eq333} \begin{split} \alpha_{j}(2) & = p(v_{k}(1),v_{k}(2), s(2)=j) \\ & = \sum_{i=1}^{M} p(v_{k}(1), v_{k}(2), s(1)=i, s(2)=j) \\ & = \sum_{i=1}^{M} p(v_{k}(2)|s(2)=j, v_{k}(1), s(1)=i)p(s(2)=j, v_{k}(1), s(1)=i) \\ & = \sum_{i=1}^{M} p(v_{k}(2)|s(2)=j, v_{k}(1), s(1)=i)p(s(2)=j|s(1)=i, v_{k}(1))p(v_{k}(1), s(1)=i) \\ & = \sum_{i=1}^{M} p(v_{k}(2)|s(2)=j)p(s(2)=j|s(1)=i)p(v_{k}(1), s(1)=i) \\ & = p(v_{k}(2)|s(2)=j)\sum_{i=1}^{M} p(s(2)=j|s(1)=i)p(v_{k}(1), s(1)=i) \\ & = b_{jkv(2)}\sum_{i=1}^{M} a_{i2}\alpha_{i}(1) \end{split} \end{equation}

如果通過(guò)向量的方式計(jì)算取不同的隱狀態(tài)j,可以通過(guò)向量乘積計(jì)算增淹,即\mathrm{\alpha(2)} = \mathrm{B_{:, k}} \times (\mathrm{\alpha_{:,1}} \cdot \mathrm{a_{:, 2}})

  • 其中 a_{i2} = 轉(zhuǎn)移概率
  • b_{jkv(2)} = 發(fā)射概率 在t=2時(shí)刻
  • \alpha_{i}(1) = 前向概率在t=1時(shí)刻

解釋: 因?yàn)樵趖=1時(shí)刻的椿访,s(1)有M個(gè)狀態(tài),所以從s(1)到s(2)需要把M種狀態(tài)都要考慮進(jìn)來(lái),在第二步的時(shí)候虑润,加了sum符號(hào)

進(jìn)一步得到通用公式

generalized-Equation.jpg

當(dāng)然也可以通過(guò)圖示的方式

Forward-and-Backward-Algorithm-in-Hidden-Markov-Model-adeveloperdiary.com-4.jpg

上圖如果用通用公式可以得到
\alpha_{2}(t) = b_{2k}\sum_{i=1}^{M}\alpha_{i}(t-1)a_{i2}
如果把其他的也寫出來(lái)
\alpha_{1}(t) = b_{1k}\sum_{i=1}^{M}\alpha_{i}(t-1)a_{i1}
\alpha_{3}(t) = b_{3k}\sum_{i=1}^{M}\alpha_{i}(t-1)a_{i3}

總結(jié):前向算法的遞推關(guān)系如下

recursive-forward-equation.jpg

Forward算法代碼實(shí)現(xiàn)

假設(shè)做出如下定義:

  • 隱狀態(tài)共兩個(gè),分別是AAA成玫,BBB
  • 觀測(cè)狀態(tài)取值為三個(gè),分別是0端辱, 1梁剔, 2
  • 假設(shè)已經(jīng)知道轉(zhuǎn)移矩陣A,和發(fā)射矩陣B
init_matrix.jpg
import pandas as pd
import numpy as np

data = pd.read_csv('data/data_python.csv')
 
V = data['Visible'].values

# Transition Probabilities
A = np.array(((0.54, 0.46), (0.49, 0.51)))
 
# Emission Probabilities
B = np.array(((0.16, 0.26, 0.58), (0.25, 0.28, 0.47)))
 
# Equal Probabilities for the initial distribution
π = np.array((0.5, 0.5))
def forward(V, A, B, π):
    alpha = np.zeros((a.shape[0], V.shape[0]))
    alpha[:, 0] = π*B[:, V[0]]
    T = len(V)
    M = A.shape[0]
    for t in range(1, T):
        for j in range(M):
            alpha[j, t] = B[j, V[t]]*alpha[:, t-1]@A[:, j]
    return alpha
alpha = forward(V, A, B, π)

Backward算法

\begin{equation} \label{eq6} \begin{split} \beta_{i}(t) & = p(v_{k}(t+1),v_{k}(T)|s(t)=i) \\ & = \sum_{j=0}^{M} p(v_{k}(t+1)... v_{k}(T), s(t+1)=j|s(t)=i) \\ & = \sum_{j=0}^{M} p(v_{k}(t+2)... v_{k}(T)|v_{k}(t+1), s(t+1)=j, s(t)=i)p(v_{k}(t+1),s(t+1)=j|s(t)=i)\\ & = \sum_{j=0}^{M} p(v_{k}(t+2)... v_{k}(T)|v_{k}(t+1), s(t+1)=j, s(t)=i)p(v_{k}(t+1)|s(t+1)=j,s(t)=i)p(s(t+1)=j|s(t)=i)\\ & = \sum_{j=0}^{M} p(v_{k}(t+2)... v_{k}(T)|s(t+1)=j)p(v_{k}(t+1)|s(t+1)=j)p(s(t+1)=j|s(t)=i)\\ & = \sum_{j=0}^{M} \beta_{j}(t+1)b_{jk}(t+1)a_{ij} \end{split} \end{equation}

  • 其中a_{ij}表示t時(shí)刻到t+1時(shí)刻的轉(zhuǎn)移概率
  • b_{jk}(t+1)表示t+1時(shí)刻舞蔽,單詞為k的發(fā)射概率
  • \beta_{j}(t+1)表示t+1時(shí)刻的后向概率

當(dāng)然也可以通過(guò)圖示的方式

Forward-and-Backward-Algorithm-in-Hidden-Markov-Model-adeveloperdiary.com-5.jpg
generialized-equation2.jpg
def backward(V, A, B):
    M = A.shape[0]
    T = len(V)
    beta = np.zeros((M, T))
    
    beta[:, -1] = np.ones(M)
    
    for t in range(T-2, 0, -1):
        for j in range(M):
            beta[j, t] = (B[:, V[t+1]]*beta[:, t+1])@A[j, :]
    return beta
beta = backward(V, A, B)
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