<在 linux 系統(tǒng)中安裝宇宙學程序包---CosmoMC>
編譯器安裝(ifort)
本人有2013的激活文件和程序,但是程序需要2015以上的版本茅逮,所以先安裝2013,激活晓猛,再安裝2015版本翩伪,可自動激活。
$ tar xzvf parallel_studio_xe_2013_update2.tgz
$ cd parallel_studio_xe_2013_update2
$ ./install.sh
" 激活程序時選擇使用文件激活眉尸,中間需要給出集或文件 ‘*.lic‘ 的位置域蜗,
" 直接給出文件位置,比如'*.lic'文件在 Downloads噪猾,輸入
" /home/***/Downloads/
" 其中'***'是本人主文件夾
" 輸入安裝文件夾位置默認 '/opt/intel'霉祸,自己的電腦可以直接選擇默認位置
" 安裝完成'Quit'
" 卸載掉 2013 版本,集或文件會遺留在電腦里
$ cd /opt/intel/Parallel_studio/
$ sudo ./uninstall.sh
" 完全卸載 '0'
" 再次安裝 2015 版本袱蜡,安裝時激活選擇使用默認激活
$ tar xzvf l_fcompxe_2015.3.187.tgz
$ cd l_fcompxe_2015.3.187
$ ./install.sh
" 同樣過程丝蹭,安裝完成后,編輯主文件夾下的'.bashrc'文件
$ cd
$ vim .bashrc
" 在文件最后增加上這么一行:
" source /opt/intel/bin/compilervars.sh intel64
" 保存并退出 ':wq'坪蚁,然后 source 一下
$ source .basrc
查看是否安裝成功
$ ifort --version
" ifort (IFORT) 15.0.3 20150407
Copyright (C) 1985-2015 Intel Corporation. All rights reserved.
" 出現(xiàn)以上信息半夷,表明安裝從成功,環(huán)境設置成功迅细。
安裝并行軟件 --- openmpi
下載軟件 openmpi_2.0
" 解壓文件
$ tar xzvf openmpi-2.0.0.tar.gz
$ cd openmpi-2.0.0
$ ./configure --prefix=/usr/local/openmpi F77=/opt/intel/composerxe/bin/ifort FC=/opt/intel/composerxe/bin/ifort F90=/opt/intel/composerxe/bin/ifort
" prefix 后面是安裝位置,本人選定在'/usr/local/'文件夾中淘邻,'openmpi'是自己給定名字茵典,可自動生成
$ make
$ make install
" 添加環(huán)境變量
$ cd
$ vim .bashrc
" export PATH=/usr/local/openmpi/bin:${PATH}
$ source .bashrc
" 檢測是否成功
$ cd openmpi-2.0.0/examples
$ make
$ mpirun -np 4 hello_c
cfitsio 安裝 (A FITS File Subroutine Library)
$ tar xzvf cfitsio_latest.tar.gz
$ cd cfitsio_latest
$ ./configure --prefix=/usr/local/cfitsio
$ make shared
$ sudo make install
" 修改環(huán)境變量,添加
$ cd
$ vim .bashrc
" 文件最后添加
" export LD_LIBRARY_PATH=/usr/local/cfitsio/lib:${LD_LIBRARY_PATH}
- Planck, WMAP, Healpix 及主程序 CosmMC 安裝 待續(xù)……
安裝 planck 2015 【plc-2.0】
安裝時一定先看看 readme 文件
使用 waf
安裝
./waf configure --wmap_src=/home/cosmos/opt/WMAP --cfitsio_prefix=/home/cosmos/opt/cfitsio --lapack_mkl=$MKLROOT --lapack_mkl_version=10.3
./waf install
將環(huán)境加入 .bashrc
source /home/cosmos/opt/Planck/plc-2.0/bin/clik_profile.sh
使其生效
source ~/.bashrc