linux軟件安裝
1.miniconda
conda是linux的應(yīng)用商店,相當(dāng)于apple store和microsoft store
首先給服務(wù)器下載安裝conda或miniconda,再?gòu)闹邢螺d安裝需要的軟件
(商城的版本需與服務(wù)器匹配般眉,輸入命令 uname -a可查詢)在“miniconda 清華”官網(wǎng)中找到匹配的鏈接奴潘,右鍵“復(fù)制鏈接地址”
在linux中后频,輸入命令wget 右鍵粘貼研儒,回車(chē)開(kāi)始下載
輸入命令bash 安裝包名字恋昼,回車(chē)開(kāi)始安裝
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中間會(huì)出現(xiàn)很多的版權(quán)信息顶瞳,按回車(chē)跳過(guò)玖姑,當(dāng)看到一行“Do you accept the license terms? [yes|no]”說(shuō)明安裝要開(kāi)始了【注意看下圖的操作,程序讓你enter就enter慨菱,讓你yes就yes】image.png
輸入命令source ~/.bashrc焰络,來(lái)激活conda
輸入命令conda,出現(xiàn)滿屏的信息說(shuō)明成功
2.其他軟件安裝卸載
首先添加國(guó)內(nèi)鏡像符喝,提速闪彼;如,使用清華鏡像协饲,
輸入命令:
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda
conda config --set show_channel_urls yes查看當(dāng)前服務(wù)器上安裝的所有軟件列表 conda list
搜索conda軟件 conda search fastqc 【如畏腕,數(shù)據(jù)質(zhì)控軟件fastqc】
安裝軟件 conda install fastqc -y 【-y是yes】
卸載軟件 conda remove fastqc -y