1、特征工程是什么
有這么一句話在業(yè)界廣泛流傳:數(shù)據(jù)和特征決定了機(jī)器學(xué)習(xí)的上限,而模型和算法只是逼近這個上限而已牙捉。那特征工程到底是什么呢?顧名思義敬飒,其本質(zhì)是一項工程活動邪铲,目的是最大限度地從原始數(shù)據(jù)中提取特征以供算法和模型使用。通過總結(jié)和歸納无拗,目前認(rèn)為特征工程包括以下方面:
特征處理是特征工程的核心部分带到,sklearn提供了較為完整的特征處理方法,包括數(shù)據(jù)預(yù)處理英染、特征選擇揽惹、降維等晌纫。
本文中使用sklearn中的IRIS(鳶尾花)數(shù)據(jù)集來對特征處理功能進(jìn)行說明。IRIS數(shù)據(jù)集由Fisher在1936年整理永丝,包含4個特征(Sepal.Length(花萼長度)锹漱、Sepal.Width(花萼寬度)、Petal.Length(花瓣長度)慕嚷、Petal.Width(花瓣寬度))哥牍,特征值都為正浮點(diǎn)數(shù),單位為厘米喝检。目標(biāo)值為鳶尾花的分類(Iris Setosa(山鳶尾)嗅辣、Iris Versicolour(雜色鳶尾),Iris Virginica(維吉尼亞鳶尾))挠说。導(dǎo)入IRIS數(shù)據(jù)集的代碼如下:
from sklearn.datasets import load_iris
# 導(dǎo)入IRIS數(shù)據(jù)集
iris = load_iris()
# 特征矩陣
iris.data
# 目標(biāo)向量
iris.target
2澡谭、數(shù)據(jù)預(yù)處理
通過特征提取,我們能得到未經(jīng)處理的特征损俭,這時的特征有可能有以下問題:
- 不屬于同一量綱:即特征的規(guī)格不一樣蛙奖,不能夠放在一起比較;
- 定性特征不能直接使用:某些機(jī)器學(xué)習(xí)算法和模型只能接受定量特征的輸入杆兵,那么需要將定性特征轉(zhuǎn)換為定量特征雁仲。最簡單的方式是為每一種定性值指定一個定量值,但是這種方式過于靈活琐脏,增加了調(diào)參的工作攒砖。通常使用啞編碼的方式將定性特征轉(zhuǎn)換為定量特征:假設(shè)有N種特征,當(dāng)原始特征值為第i種定性值時日裙,第i個擴(kuò)展特征為1吹艇,其他擴(kuò)展特征賦值為0。啞編碼的方式相比直接指定的方式昂拂,不用增加調(diào)參的工作受神,對于線性模型來說,使用啞編碼的特征可達(dá)到非線性的效果政钟;
- 存在缺失值:缺失值需要補(bǔ)充路克;
- 信息利用率低:不同的機(jī)器學(xué)習(xí)算法和模型對數(shù)據(jù)中信息的利用是不同的,之前提到在線性模型中养交,使用對定性特征啞編碼可以達(dá)到非線性的效果。類似地瓢宦,對定量變量多項式化碎连,或者進(jìn)行其他的轉(zhuǎn)換,都能達(dá)到非線性的效果驮履。
使用sklearn中是的preprocessing庫來進(jìn)行數(shù)據(jù)預(yù)處理鱼辙,可以覆蓋以上問題的解決方案廉嚼。
2.1 無量綱化
無量綱化使不同規(guī)格的數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換到同一規(guī)格。常用的無量綱化方法有標(biāo)準(zhǔn)化和區(qū)間縮放法倒戏。標(biāo)準(zhǔn)化的前提是特征值服從正態(tài)分布怠噪,標(biāo)準(zhǔn)化后,其轉(zhuǎn)換成標(biāo)準(zhǔn)正態(tài)分布杜跷;區(qū)間縮放法利用了邊界值信息傍念,將特征的取值區(qū)間縮放到某個特點(diǎn)的范圍,例如[0,1]等葛闷。
2.1.1 標(biāo)準(zhǔn)化
標(biāo)準(zhǔn)化需要計算特征的均值和標(biāo)準(zhǔn)差憋槐,公式表達(dá)為:
使用preprocessing的StandardScaler類對數(shù)據(jù)進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化的代碼如下:
from sklearn.preprocessing import StandardScaler
# 標(biāo)準(zhǔn)化,返回值為標(biāo)準(zhǔn)化后的數(shù)據(jù)
StandardScaler().fit_transform(iris.data)
2.1.2 區(qū)間縮放法
區(qū)間縮放法的思路有多種淑趾,常見的一種為利用兩個最值進(jìn)行縮放阳仔,公式表達(dá)為:
使用preprocessing庫的MinMaxScaler類對數(shù)據(jù)進(jìn)行區(qū)間縮放的代碼如下:
from sklearn.preprocessing import MinMaxScaler
# 區(qū)間縮放,返回值縮放到[0,1]區(qū)間的數(shù)據(jù)
MinMaxScaler().fit_transform(iris.data)
2.1.3 標(biāo)準(zhǔn)化與歸一化的區(qū)別
簡單來說扣泊,標(biāo)準(zhǔn)化是依照特征矩陣的列處理數(shù)據(jù)近范,其通過z-score的方法,將樣本的特征值轉(zhuǎn)換到同一量綱下延蟹;歸一化是依照特征矩陣的行處理數(shù)據(jù)顺又,其目的在于樣本向量在點(diǎn)乘運(yùn)算或其他核函數(shù)計算相似性時,擁有統(tǒng)一的標(biāo)準(zhǔn)等孵,也就是說都轉(zhuǎn)化為“單位向量”稚照。規(guī)則為l2的歸一化公式如下:
使用preprocessing庫的Normalizer類對數(shù)據(jù)進(jìn)行歸一化的代碼如下:
from sklearn.preprocessing import Normalizer
# 歸一化,返回值為歸一化后的數(shù)據(jù)
Normalizer().fit_transform(iris.data)
2.2 對定量特征二值化
定量特征的二值化的核心在于設(shè)定一個閾值俯萌,小于等于閾值的賦值為0果录,大于閾值的賦值為1,公式表達(dá)如下:
使用preprocessing庫的Binarizer類對數(shù)據(jù)進(jìn)行二值化的代碼如下:
from sklearn.preprocessing import Binarizer
# 二值化咐熙,閾值為3弱恒,返回值為二值化后的數(shù)據(jù)
Binarizer(threshold=3).fit_transform(iris.data)
2.3 對定性特征啞編碼
由于IRIS數(shù)據(jù)集的特征皆為定量特征,故使用其目標(biāo)值進(jìn)行啞編碼(實際上是不需要的)棋恼。
使用preprocessing庫的OneHotEncoder類對數(shù)據(jù)進(jìn)行啞編碼的代碼如下:
from sklearn.preprocessing import OneHotEncoder
# 啞編碼返弹,對IRIS數(shù)據(jù)集的目標(biāo)值,返回啞編碼后的數(shù)據(jù)
OneHotEncoder().fit_transform(iris.target.reshape((-1,1)))
2.4 缺失值計算
由于IRIS數(shù)據(jù)集沒有缺失值爪飘,故對數(shù)據(jù)集新增一個樣本义起,4個特征均賦值為NaN,表示數(shù)據(jù)缺失师崎。
使用preprocessing庫的Imputer類對數(shù)據(jù)進(jìn)行缺失值計算的代碼如下:
from numpy import vstack,array,nan
from sklearn.preprocessing import Imputer
# 缺失值計算默终,返回值為結(jié)算缺失值后的數(shù)據(jù)
# 參數(shù)missing_value為缺失值的表示形式,默認(rèn)為NaN
# 參數(shù)strategy為默認(rèn)填充方式,默認(rèn)為mean(均值)
Imputer().fit_transform(vstack((array([nan,nan,nan,nan]),iris.data)))
2.5 數(shù)據(jù)變換
常見的數(shù)據(jù)變換有基于多項式的齐蔽、基于指數(shù)函數(shù)的两疚、基于對數(shù)函數(shù)的。4個特征含滴,度為2的多項式轉(zhuǎn)換公式如下:
使用preprocessing庫的PolynomialFeatures類對數(shù)據(jù)多項式轉(zhuǎn)化的代碼如下:
from sklearn.preprocessing import PolynomialFeatures
# 多項式轉(zhuǎn)換
# 參數(shù)degree為度
PolynomialFeatures().fit_transform(iris.data)
基于單變元函數(shù)的數(shù)據(jù)變換可以使用一個同一的方式完成诱渤,使用preprocessing庫的FunctionTransformer對數(shù)據(jù)進(jìn)行對數(shù)函數(shù)轉(zhuǎn)換的代碼如下:
from numpy import log1p
from sklearn.preprocessing import FunctionTransformer
# 自定義轉(zhuǎn)換函數(shù)為對數(shù)函數(shù)的數(shù)據(jù)變換
# 第一個參數(shù)是單變元函數(shù)
FunctionTransformer(log1p).fit_transform(iris.data)
3、特征選擇
當(dāng)數(shù)據(jù)預(yù)處理完成后谈况,我們需要選擇有意義的特征輸入機(jī)器學(xué)習(xí)的算法和模型進(jìn)行訓(xùn)練勺美。通常來說,從兩個方面考慮來選擇特征:
- 特征是否發(fā)散:如果一個特征不發(fā)散鸦做,例如方差接近于0励烦,也就是說樣本在這個特征上基本上沒有差異,這個特征對于樣本的區(qū)分并沒有什么用泼诱;
- 特征與目標(biāo)的相關(guān)性:這點(diǎn)比較顯見坛掠,與目標(biāo)相關(guān)性高的特征應(yīng)當(dāng)優(yōu)先選擇。
根據(jù)特征選擇的形式又可以將特征選擇方法分為3種: - Filter:過濾法治筒,按照發(fā)散性或者相關(guān)性對各個特征進(jìn)行評分屉栓,設(shè)定閾值或者選擇閾值的個數(shù),選擇特征耸袜;
- Wrapper:包裝法友多,根據(jù)目標(biāo)函數(shù)(通常是預(yù)測效果評分),每次選擇若干特征堤框,或者排除若干特征域滥;
- Embedded:嵌入法,先使用某些機(jī)器學(xué)習(xí)的算法和模型進(jìn)行訓(xùn)練蜈抓,得到各個特征的權(quán)值系數(shù)启绰,根據(jù)系數(shù)從大到小選擇特征。類似于Filter方法沟使,但是通過訓(xùn)練來確定特征的優(yōu)劣委可。
我們使用sklearn中的feature_selection庫來進(jìn)行特征選擇。
3.1 Filter
3.1.1 方差選擇法
使用方差選擇法腊嗡,先要計算各個特征的方差着倾,選擇方差大于閾值的特征。
使用feature_selection庫的VarianceThreshold類來選擇特征的代碼如下:
from sklearn.feature_selection import VarianceThreshold
# 方差選擇法燕少,返回值為特征選擇后的數(shù)據(jù)
# 參數(shù)threshold為方差的閾值
VarianceThreshold(threshold=3).fit_transform(iris.data)
3.1.2 相關(guān)系數(shù)法
使用相關(guān)系數(shù)法卡者,先要計算各個特征對目標(biāo)值的相關(guān)系數(shù)的P值。用feature_selection庫的SelectKBest類結(jié)合相關(guān)系數(shù)來選擇特征的代碼如下:
from sklearn.feature_selection import SelectKBest
from scipy.stats import pearsonr
#選擇K個最好的特征棺亭,返回選擇特征后的數(shù)據(jù)
#第一個參數(shù)為計算評估特征是否好的函數(shù)虎眨,該函數(shù)輸入特征矩陣和目標(biāo)向量蟋软,輸出二元組(評分镶摘,P值)的數(shù)組嗽桩,數(shù)組第i項為第i個特征的評分和P值。在此定義為計算相關(guān)系數(shù)
#參數(shù)k為選擇的特征個數(shù)
SelectKBest(lambda X, Y: array(map(lambda x:pearsonr(x, Y), X.T)).T, k=2).fit_transform(iris.data, iris.target)
# 此處代碼有問題凄敢,得改
3.1.3 卡方檢驗
經(jīng)典的卡方檢驗是檢驗定性自變量對定性因變量的相關(guān)性碌冶。假設(shè)自變量有N種取值,因變量有M種取值涝缝,考慮自變量等于i且因變量等于j的樣本頻數(shù)的觀察值與期望的差距扑庞,構(gòu)建統(tǒng)計量:
使用feature_selection庫的SelectionKBest類結(jié)合卡方檢驗來選擇特征的代碼如下:
from sklearn.feature_selection import SelectKBest
from sklearn.feature_selection import chi2
# 選擇K個最好的特征,返回選擇特征后的數(shù)據(jù)
SelectKBest(chi2,k=2).fit_transform(iris.data,iris.target)
3.1.4 互信息法
經(jīng)典的互信息也是評價定性自變量對定性因變量的相關(guān)性的拒逮,互信息計算公式如下:
為了處理定量數(shù)據(jù)罐氨,最大信息系數(shù)法被提出,使用feature_selection庫的SelectKBest類結(jié)合最大信息系數(shù)法來選擇特征的代碼如下:
from sklearn.feature_selection import SelectKBest
from minepy import MINE
# 由于MINE的設(shè)計不是函數(shù)式滩援,定義mic方法將其改為函數(shù)式的栅隐,返回一個二元組,二元組的第2項設(shè)置成固定的P值0.5
def mic(x,y):
m = MINE()
m.compute_score(x,y)
return (m.mic(),0.5)
# 選擇K個最好的特征玩徊,返回特征選擇后的數(shù)據(jù)
SelectKBest(lambda X, Y: array(map(lambda x:mic(x, Y), X.T)).T, k=2).fit_transform(iris.data, iris.target)
# 此處代碼有問題租悄,得改
3.2 Wrapper
3.2.1 遞歸特征消除法
遞歸消除特征法使用一個基模型來進(jìn)行多輪訓(xùn)練,每輪訓(xùn)練后恩袱,消除若干權(quán)值系數(shù)的特征泣棋,再基于新的特征集進(jìn)行下一輪訓(xùn)練。
使用feature_selection庫的RFE類來選擇特征的代碼如下:
from sklearn.feature_selection import RFE
from sklearn.linear_model import LogisticRegression
# 遞歸特征消除法畔塔,返回特征選擇后的數(shù)據(jù)
# 參數(shù)estimator為基模型
# 參數(shù)n_features_to_select為選擇的特征個數(shù)
RFE(estimator=LogisticRegression(),n_features_to_select=2).fit_transform(iris.data,iris.target)
Embedded
3.3.1 基于懲罰項的特征選擇法
使用帶懲罰項的基模型潭辈,除了篩選出特征外,同時也進(jìn)行了降維澈吨。
使用feature_selection庫的SelectFromModel類結(jié)合帶L1懲罰項的邏輯回歸模型把敢,來選擇特征的代碼如下:
from sklearn.feature_selection import RFE
from sklearn.linear_model import LogisticRegression
# 遞歸特征消除法,返回特征選擇后的數(shù)據(jù)
# 參數(shù)estimator為基模型
# 參數(shù)n_features_to_select為選擇的特征個數(shù)
RFE(estimator=LogisticRegression(),n_features_to_select=2).fit_transform(iris.data,iris.target)
# 此處代碼有問題
3.3.2 基于樹模型的特征選擇法
樹模型中GBDT也可以用來作為基模型進(jìn)行特征選擇棚辽,用feature_selection庫的SelectFromModel類結(jié)合GBDT模型技竟,來選擇特征的代碼如下:
from sklearn.feature_selection import SelectFromModel
from sklearn.ensemble import GradientBoostingClassifier
# GBDT作為基模型的特征選擇
SelectFromModel(GradientBoostingClassifier()).fit_transform(iris.data,iris.target)
4、降維
當(dāng)特征選擇完成后屈藐,可以直接訓(xùn)練模型了榔组,但是可能由于特征矩陣過大,導(dǎo)致計算量大联逻、訓(xùn)練時間長的問題搓扯,因此降低特征矩陣維度也是必不可少的。常見的降維方法除了以上提到的基于L1懲罰項的模型以外包归,另外還有主成分分析法(PCA)和線性判別分析(LDA)锨推,線性判別分析本身也是一個分類模型。PCA和LDA有很多的相似點(diǎn),其本質(zhì)是要將原始的樣本映射到維度更低的樣本空間中换可,但是PCA和LDA的映射目標(biāo)不一樣:PCA是為了讓映射后的樣本具有最大的發(fā)散性椎椰;而LDA是為了讓映射后的樣本有最好的分類性能。所以說PCA是一種無監(jiān)督的降維方法沾鳄,而LDA是一種有監(jiān)督的降維方法慨飘。
4.1 主成分分析法(PCA)
使用decomposition庫的PCA類特征的代碼如下:
from sklearn.decomposition import PCA
# 主成分分析法,返回降維后的數(shù)據(jù)
# 參數(shù)n_components為主成分?jǐn)?shù)目
PCA(n_components=2).fit_transform(iris.data)
4.2 線性判別分析法(LDA)
使用lda庫的LDA類選擇特征的代碼如下:
from sklearn.discriminant_analysis import LinearDiscriminantAnalysis as LDA
# 線性判別分析法译荞,返回降維后的數(shù)據(jù)
# 參數(shù)n_components為降維后的維數(shù)
LDA(n_components=2).fit_transform(iris.data,iris.target)
本文摘自jasonfreak的博客