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文章鏈接（點擊藍色字體即可跳轉(zhuǎn)至原文）：文獻
每天都在下文獻珍昨、看文獻县耽，但是對于文獻管理、分類镣典、信息提取無從下手兔毙。除了不知道該選擇什么管理工具，閱讀文獻時提取重要信息以及對信息的批量整合也挺麻煩的兄春。
這次整理了一些網(wǎng)友在管理文獻時的小技巧澎剥，結(jié)合目前的幾個主流文獻管理工具給大家分享一些經(jīng)驗。所有文獻管理工具的安裝包都附在文末啦~
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來源：知乎
知乎用戶：menz
文獻總結(jié)整理：Endnote
文獻閱讀：網(wǎng)頁版Fulltext
文獻筆記：Onenote
為什么使用這幾個軟件赶舆？因為這樣最符合我的需求哑姚。
個人認為整理文獻主要目的是：能夠在任何條件下，快速找到所需信息芜茵。任何好用的軟件蜻懦，都不如大批量多批次的文獻閱讀。
只要符合自己的需求夕晓，其實不管用哪些工具都行，不用去管主流不主流悠咱。
1蒸辆、閱讀文獻的時候用網(wǎng)頁版Fulltext或PDF
排版舒服容易閱讀（網(wǎng)頁版和PDF都合適）
不懂的內(nèi)容即時Google（網(wǎng)頁版較合適）
例如，內(nèi)容中出現(xiàn)：“xxxxx[11]”析既。我希望馬上看看這個參考文獻[11]是什么躬贡。pdf版太煩了——要拖下去找這個參考文獻[11]，然后再滾上來眼坏，忘了剛剛看到哪了拂玻。這點（大部分文獻的）網(wǎng)頁版就很好，鼠標虛指一下[11]這個鏈接，參考文獻的citation信息就顯示出來檐蚜，再點一下魄懂，直接就可以打開這個參考文獻的頁面。
在內(nèi)容中highlight關(guān)鍵部分：IE可用Imarkup擴展闯第；Firefox可用Wired-Marker市栗。高亮記錄永不丟失，并可搜索咳短。
2填帽、閱讀的同時做筆記用Onenote
Onenote可貼到屏幕右邊，記錄你的總結(jié)和思路火花咙好。如果使用IE篡腌，Onenote還可以自動記住你是在閱讀原文哪一段時做的這一句筆記。
所以勾效，我閱讀文獻采用網(wǎng)頁版嘹悼，筆記采用onenote。
3葵第、做文獻整理的時候用Endnote
我對文獻整理軟件的唯一需求绘迁，就是能快速找到想要的那一篇/幾篇文獻。想找哪篇找哪篇卒密，忘了關(guān)鍵信息也能找到缀台，模糊檢索也能找到。
想象以下場景：
我想找那篇之前讀過的（標記已讀/未讀功能）哮奇；
2005年發(fā)表的（排序功能）膛腐；
分組在"Crystallography"組的（分組功能）；
曾被我標記了"mTOR"標簽的（標簽功能）鼎俘；
忘了是題目還是內(nèi)容中含有"pET28a"的（全文內(nèi)搜索功能）的文獻哲身。
滿足所有這些功能的，我知道的只有Endnote和Mendeley（可能還有別的軟件）贸伐。我選擇了Endnote勘天。另外，把Endnote文件放在OneDrive/Dropbox等文件夾里捉邢，還可實現(xiàn)同步脯丝。
綜上所述，我個人最好的選擇是網(wǎng)頁版閱讀+Onenote筆記+Endnote整理伏伐。
2
來源：知乎
知乎用戶：nerfing
管理文獻：Mendeley
筆記工具：PDF
經(jīng)驗：重搜索宠进，輕整理
個人認為整理文獻主要目的是：能夠在任何條件下，快速找到所需信息藐翎。任何好用的軟件材蹬，都不如大批量多批次的文獻閱讀实幕。
所以思路是：輕整理，重搜索堤器。輕整理昆庇，是指不對文獻分類，或者只是對文獻簡單分類吼旧。重搜索凰锡，是指利用不同的搜索工具，快速定位到我需要的文獻圈暗。
1掂为、重搜索
在新項目（寫一篇綜述，開始一個新課題或者完成一份大作業(yè)）開始之前员串，我會在Mendeley中根據(jù)不同項目勇哗，建立一個新文件夾。
一個項目剛開始的時候寸齐，文件夾中沒有文獻欲诺，就需要先建立一份本地的文獻原始積累。我習慣在Web of Science上根據(jù)關(guān)鍵詞去找所需要的文獻渺鹦。
①比如我現(xiàn)在想看一下微流控單細胞測序（microfluidic single cell sequencing）最近的進展時扰法，就去WoS搜：
② 總共有214篇文獻。我會把214篇文獻的題目先全部瀏覽一遍毅厚，其中大概100篇需要下載看一下PDF塞颁。最后我會剩下大概50篇左右PDF，拖進Mendeley吸耿，建立原始的文獻積累祠锣。
③ Mendeley會自動提取文獻信息，按照文獻的發(fā)表年份咽安、期刊和文章題目將文獻重命名伴网，并將該文獻自動整理到指定文件夾中，完成文獻的原始積累妆棒。
我用Mendeley而不是Endnote做文獻索引澡腾，主要是因為：
Mendeley是我用過所有的文獻整理軟件中，提取文章題目糕珊，發(fā)表年份和期刊等信息最準確和方便的軟件蛋铆。看到一篇有意思的文章放接，我只需要往Mendeley中一拖，它就會幫我自動提取文獻信息建立條目留特，并將文件拷貝到指定文件夾中纠脾。其他的軟件玛瘸，要么是提取文獻條目的準確度不高，要么就是建立文獻條目非常麻煩苟蹈，需要花大量的時間去建立條目糊渊，大大降低文獻閱讀效率。
④我又將這個Mendeley的文件夾中所有文獻用Dropbox同步慧脱。
之后我要看文獻時渺绒，只從這個文件夾中打開文獻。這樣做的好處就是菱鸥，把所有的文獻和筆記信息全部集中化了宗兼，不會造成信息碎片。
⑤ 做筆記我也只在PDF上做氮采，這樣就不用另外開一個軟件寫筆記殷绍，并可以對自己感興趣的信息直接標注，實現(xiàn)信息最大程度集中化鹊漠。哪怕打印了紙版的文獻主到，我在看完后也會把紙版上的筆記全部在PDF上標注，避免信息碎片化躯概。
⑥ 我看一篇文獻登钥，除了一些世界上的頂尖超級大牛，一般記不住作者的名字娶靡，但是我一般會對文章發(fā)表年份和所在期刊有很深的印象牧牢，而且一般題目又提供了文章中最主要的信息。
⑦ 所以我設置Mendeley自動根據(jù)文獻的三個強信息：發(fā)表年固蛾、發(fā)表期刊和文章題目自動重命名结执，并結(jié)合Everything，在本地實現(xiàn)文獻的第一重搜索艾凯。
如果搜索目標很明確献幔，比如我現(xiàn)在想找一篇之前在Nature Drug Review上看過的關(guān)于drug combination的文章，由于關(guān)鍵詞很明確趾诗，用Everything直接就從本地找到了蜡感，耗時不超過3秒。
⑧ 如果搜索目標不那么明確恃泪，比如題主說的郑兴，“總感覺有些文獻讀過就忘記了，想用的時候想不起來”贝乎；或者找找一些特定的問題情连，不確定本地文獻有沒有。這個時候我一般會把所有能想到的關(guān)鍵詞輸入览效，上Google Scholar搜索却舀。
這個時候虫几，可能會找到一些文獻在本地是有的，那就可以根據(jù)文獻名挽拔，用Everything快速在本地找到對應的文獻辆脸。
如果一些文獻本地沒有，那就直接下載PDF螃诅，閱讀后在Mendeley建立本地索引啡氢。
如果想要搜索特定一句話，或者在寫文章的時候想對一些說法進行佐證术裸，就可以用Mendeley的搜索工具倘是。
或者還是上Google Scholar：
2、輕整理
① 之后隨著時間的流逝穗椅，一個文件夾下的文獻慢慢變多辨绊，這個時候就需要在Mendeley中建立子文件夾了，也就是傳統(tǒng)意義上的整理匹表。但是我不贊成把文獻歸類做的過細门坷。對一個項目下簡單分類，使每個子文件夾中的文獻大概不超過50篇袍镀，再通過發(fā)表年份默蚌，期刊名，作者名等信息苇羡，也可以很容易找到所需的文章了绸吸。
② 但是我現(xiàn)在不會等文獻很多了之后再去建立子文件夾，而是會在平時讀文獻的時候设江，根據(jù)一個項目下的不同問題锦茁，建立一些小的分類。在Mendeley中叉存，同一篇文獻是可以歸屬不同的文件夾的码俩，所以在歸文件夾的時候也不用那么糾結(jié)。
最后歼捏，我想說的是稿存，任何文獻整理軟件都不能代替人對文獻的閱讀，任何時候讀文獻中信息永遠是第一位的瞳秽。整理軟件只能夠幫助更加快速地找到所需的信息而已瓣履。
3
來源：知乎
知乎用戶：喬智
收集文獻：DEVONthink pro
管理文獻：Zotero
管理筆記：Circus Ponies Notebook
1、收集文獻：DEVONthink pro
DEVONthink功能
a. 文件可以以相同或者不同的名稱儲存在同一個或者不同的文件夾练俐；
b. 文件可以進行不同的標記（Label）和標簽（Tag）袖迎，我把標記用來表示重要程度（待讀、當下可用、重要等）瓢棒，標簽則涵蓋核心信息浴韭；
c. 文件可以復制（Duplication）和建立替身（Replication），后者對一個替身文件的修改可以實現(xiàn)在所有文件上脯宿。我在文件夾中有Chapter3，這是我正在進行中的論文泉粉，我將我需要的文章全部替身到這個文件夾里连霉，完成后再把這個文件夾里的替身全部刪掉，但是我閱讀的修改和標記已經(jīng)全部在我的文獻中保存了嗡靡；
d. 左下方紫色文件夾為智能文件夾（Smart Group）跺撼，可以自定義軟件中任何一個規(guī)則，我僅僅是作為匯集標記的文件夾讨彼；
e. 可以將網(wǎng)頁截屏為網(wǎng)頁格式歉井，或者pdf格式，平彻螅看到有用信息可以立刻保存哩至。
適用半個月蜜自，非常方便菩貌，還有更多更加細節(jié)的功能，這里只是一些最基礎功能重荠。
目的：替代Mac Finder箭阶，收集整理文獻。
2戈鲁、管理文獻：Zotero
目的：直接形成參考仇参。
Zotero優(yōu)勢：
a. 可直接拖曳pdf，自動抓取元數(shù)據(jù)婆殿，導入?yún)⒖夹畔ⅲ?/p>
b. 可輸入書號诈乒，自動生成參考信息；
c. 可安裝插件鸣皂，顯示參考數(shù)量抓谴。
補充：原本用Zotero整理文件，所以建立了文件夾寞缝，但是在用DEVONthink之后癌压，就放棄在Zotero里繼續(xù)整理了，通過插件在Word中可以很輕松的實現(xiàn)查找和輸入荆陆。
3滩届、管理筆記：Circus Ponies Notebook
目的：記錄筆記，形成主題，安排提綱帜消。
Circus Ponies Notebook功能：
a. 收集筆記
a1. 上圖是我的筆記本和主題本棠枉，按照“作者_年份_名稱”命名，前面標“*”號代表需要歸納整理泡挺；
a2. 截圖是某一篇期刊的內(nèi)容辈讶，我將期刊分為摘要，摘錄娄猫，總結(jié)贱除，分別記各類信息：
b. 形成主題：
b1. 上圖是我的主題頁面，我將所有讀過的文獻全部整理到了不同的主題之下媳溺，以此建立自己知識體系月幌，并且方便以后查看；
b2. 側(cè)面是參考悬蔽，告知我具體信息從何而來扯躺。
c. 安排提綱
c1. 上圖是我為最近寫作的論文安排的提綱頁面；
c2. 不同的信息由筆記和主題以及持續(xù)的閱讀中豐富提綱蝎困，基本上提綱建立完成录语，按照順序?qū)懽饕簿涂梢粤耍瑐?cè)面仍是“作者_年份”的參考信息难衰。
總結(jié)
這是我用來整理文獻和收集筆記的三個基本工具钦无，也僅僅介紹了最最基本的功能，希望各位可以從中開發(fā)更多功能盖袭，養(yǎng)成更符合自己的習慣失暂。
其它文獻管理工具
Citavi ：citavi是知識管理工具。它有完善的文獻管理鳄虱、作者管理弟塞、關(guān)鍵詞管理、pdf映射拙已、搜索引擎决记、表格、想法等全方位的知識管理工具倍踪，可以支撐起博士生涯在內(nèi)的龐大文獻背后的知識管理工作系宫，文獻管理自然也不在話下。
NoteExpress：國產(chǎn)文獻管理工具建车，最大的特點是對中文文獻的非常友好扩借、筆記功能強大、中文雜志的引文格式數(shù)量多缤至。其對中文PDF文獻的讀取能力不是其他主流文獻管理軟件所能比擬的闲昭，不會出現(xiàn)其他國外軟件長出現(xiàn)的亂碼透敌、識別困難的現(xiàn)象柄慰，徹底幫你解決中文文獻無法識別、亂碼等等讓人糟心的問題沃暗。
NoteFirst：免費，軟件內(nèi)雙擊能直接打開pdf何恶，但是會有英文名bug（顯示pdf英文字母間沒有空格）孽锥，導入操作復雜（自帶的插件被谷歌標注為惡意軟件chrome沒法裝），word加載項不能用细层，加上好久才更新一次忱叭，用起來體驗感不是很好。
