RedNotebook

我至今一直使用RedNotebook來(lái)記錄我生物信息分析的日志。盡管現(xiàn)在有很多筆記本應(yīng)用程序,我還是非常喜歡這個(gè)筆記本應(yīng)用程序,和大家分享一下原因吧幸乒。

故事可以追溯到2012年,在我完成了我全職(濕)實(shí)驗(yàn)室工作之后唇牧,我開(kāi)始全職從事生物信息分析(干實(shí)驗(yàn)室)罕扎。作為一名科學(xué)家,根據(jù)日期或每天寫(xiě)實(shí)驗(yàn)記錄是很普遍的作息奋构。然而我發(fā)現(xiàn)每天在紙質(zhì)的實(shí)驗(yàn)日記本記錄生物信息分析特別是包含指令代碼分析壳影,是一項(xiàng)不可能任務(wù)。不過(guò)弥臼,我的確曾這樣做過(guò)宴咧,而我的結(jié)論是:這是一種愚蠢的做法。

因此径缅,我便開(kāi)始尋找一種工具掺栅,一種能讓我每天記錄根據(jù)日期記錄數(shù)據(jù)分析工作的工具,是的纳猪,以每天為基礎(chǔ)氧卧。因?yàn)槲沂褂貌煌牟僮飨到y(tǒng)(Linux, Unix, Windows)進(jìn)行分析工作,所以這個(gè)工具必須是跨操作系統(tǒng)平臺(tái)的氏堤,并且支持云訪問(wèn)沙绝。

經(jīng)過(guò)一番搜索,我決定試用 RedNotebook鼠锈。RedNotebook 是什么闪檬?RedNotebook 是一種基于日記形式的筆記本應(yīng)用程序,它允許用戶每天記錄筆記购笆。該軟件使用 txt2tags 標(biāo)簽粗悯,與 markdown (另一種輕量級(jí)標(biāo)簽語(yǔ)言) 標(biāo)簽類似。

我在不同的操作系統(tǒng)上安裝了 RedNotebook同欠,將 RedNotebook 的數(shù)據(jù)文件保存在云驅(qū)動(dòng)器上样傍,并在RedNotebook中配置好路徑。 如此铺遂,我能夠在家或辦公室的其他操作系統(tǒng)上工作時(shí)在不同平臺(tái)上訪問(wèn)同一數(shù)據(jù)文件衫哥。

我用自定義的模板把我每日的數(shù)據(jù)分析工作記錄下來(lái)。必要時(shí)襟锐,我可以根據(jù)日期或月份將我的生物信息分析日志以HTML或文本文件的形式保存在我的電腦上炕檩,或者將其交予同事。我還可以使用關(guān)鍵字搜索捌斧、查看不同的日期日志笛质、跟蹤我以前做過(guò)的分析。

迄今為止捞蚂,我仍然使用 RedNotebook妇押。對(duì)于那些還在尋找理想電子日記類筆記本的同行們,我強(qiáng)烈推薦這日記筆記本軟件姓迅。RedNotebook?是免費(fèi)的(歡迎給作者捐款)敲霍,試試吧。

I have been using RedNotebook for my bioinformatics analysis logs until now. Although there are many notebook applications, I still like this notebook application very much. Let me share with you why.

The story can be traced back to the year 2012, when I started my bioinformatics analysis (dry lab) full-time after finished with my full-time (wet) lab works. As a scientist, writing an experiment log on a logbook daily or according to the date was a common practice. However, I found that recording bioinformatics analysis that involved command lines on a paper-based logbook was an impossible task. Nevertheless, I did that before, and I concluded that it was stupid.

Hence, I started to look for a tool that allowed me to write my daily analysis activities, yes, daily-basis. As I was using different operating systems (Linux, Unix, Windows) for my analysis works, the tool must be cross-platforms workable and support cloud drive access.

After googling a while, I decided to give RedNotebook a try. What is RedNotebook? RedNotebook is a diary-based journal/notebook that allowed users to write their notes daily. It uses txt2tags markup, which more or less similar to markdown (another type of lightweight markup language) markup.

I installed RedNotebook on different operating systems, kept RedNotebook's data files at cloud drive and configured the path in the RedNotebook. By doing so, I can access to same data files across different platforms while working from home or at the office on different operating systems.

I used a custom made templates to record my data analysis works daily. When needed, I can export my dry lab logs according to the date or month as HTML or text-based files on my computer or share them to a colleague. With keywords search, I can look at my different date logs and track what I have done previously.

Up to date, I still using RedNotebook. I strongly recommend this diary/journal to scientists who are looking for an ideal electronic logbook-like diary/journal. RedNotebook is free (donations to the author are welcome), try it.

最后編輯于
?著作權(quán)歸作者所有,轉(zhuǎn)載或內(nèi)容合作請(qǐng)聯(lián)系作者
  • 序言:七十年代末丁存,一起剝皮案震驚了整個(gè)濱河市肩杈,隨后出現(xiàn)的幾起案子,更是在濱河造成了極大的恐慌解寝,老刑警劉巖扩然,帶你破解...
    沈念sama閱讀 210,978評(píng)論 6 490
  • 序言:濱河連續(xù)發(fā)生了三起死亡事件,死亡現(xiàn)場(chǎng)離奇詭異聋伦,居然都是意外死亡夫偶,警方通過(guò)查閱死者的電腦和手機(jī),發(fā)現(xiàn)死者居然都...
    沈念sama閱讀 89,954評(píng)論 2 384
  • 文/潘曉璐 我一進(jìn)店門(mén)觉增,熙熙樓的掌柜王于貴愁眉苦臉地迎上來(lái)兵拢,“玉大人,你說(shuō)我怎么就攤上這事逾礁∷盗澹” “怎么了?”我有些...
    開(kāi)封第一講書(shū)人閱讀 156,623評(píng)論 0 345
  • 文/不壞的土叔 我叫張陵嘹履,是天一觀的道長(zhǎng)腻扇。 經(jīng)常有香客問(wèn)我,道長(zhǎng)植捎,這世上最難降的妖魔是什么衙解? 我笑而不...
    開(kāi)封第一講書(shū)人閱讀 56,324評(píng)論 1 282
  • 正文 為了忘掉前任,我火速辦了婚禮焰枢,結(jié)果婚禮上蚓峦,老公的妹妹穿的比我還像新娘。我一直安慰自己济锄,他們只是感情好暑椰,可當(dāng)我...
    茶點(diǎn)故事閱讀 65,390評(píng)論 5 384
  • 文/花漫 我一把揭開(kāi)白布。 她就那樣靜靜地躺著荐绝,像睡著了一般一汽。 火紅的嫁衣襯著肌膚如雪。 梳的紋絲不亂的頭發(fā)上,一...
    開(kāi)封第一講書(shū)人閱讀 49,741評(píng)論 1 289
  • 那天召夹,我揣著相機(jī)與錄音岩喷,去河邊找鬼。 笑死监憎,一個(gè)胖子當(dāng)著我的面吹牛纱意,可吹牛的內(nèi)容都是我干的。 我是一名探鬼主播鲸阔,決...
    沈念sama閱讀 38,892評(píng)論 3 405
  • 文/蒼蘭香墨 我猛地睜開(kāi)眼偷霉,長(zhǎng)吁一口氣:“原來(lái)是場(chǎng)噩夢(mèng)啊……” “哼!你這毒婦竟也來(lái)了褐筛?” 一聲冷哼從身側(cè)響起类少,我...
    開(kāi)封第一講書(shū)人閱讀 37,655評(píng)論 0 266
  • 序言:老撾萬(wàn)榮一對(duì)情侶失蹤,失蹤者是張志新(化名)和其女友劉穎渔扎,沒(méi)想到半個(gè)月后硫狞,有當(dāng)?shù)厝嗽跇?shù)林里發(fā)現(xiàn)了一具尸體,經(jīng)...
    沈念sama閱讀 44,104評(píng)論 1 303
  • 正文 獨(dú)居荒郊野嶺守林人離奇死亡赞警,尸身上長(zhǎng)有42處帶血的膿包…… 初始之章·張勛 以下內(nèi)容為張勛視角 年9月15日...
    茶點(diǎn)故事閱讀 36,451評(píng)論 2 325
  • 正文 我和宋清朗相戀三年妓忍,在試婚紗的時(shí)候發(fā)現(xiàn)自己被綠了。 大學(xué)時(shí)的朋友給我發(fā)了我未婚夫和他白月光在一起吃飯的照片愧旦。...
    茶點(diǎn)故事閱讀 38,569評(píng)論 1 340
  • 序言:一個(gè)原本活蹦亂跳的男人離奇死亡世剖,死狀恐怖,靈堂內(nèi)的尸體忽然破棺而出笤虫,到底是詐尸還是另有隱情旁瘫,我是刑警寧澤,帶...
    沈念sama閱讀 34,254評(píng)論 4 328
  • 正文 年R本政府宣布琼蚯,位于F島的核電站酬凳,受9級(jí)特大地震影響,放射性物質(zhì)發(fā)生泄漏遭庶。R本人自食惡果不足惜宁仔,卻給世界環(huán)境...
    茶點(diǎn)故事閱讀 39,834評(píng)論 3 312
  • 文/蒙蒙 一、第九天 我趴在偏房一處隱蔽的房頂上張望峦睡。 院中可真熱鬧翎苫,春花似錦、人聲如沸榨了。這莊子的主人今日做“春日...
    開(kāi)封第一講書(shū)人閱讀 30,725評(píng)論 0 21
  • 文/蒼蘭香墨 我抬頭看了看天上的太陽(yáng)龙屉。三九已至呐粘,卻和暖如春,著一層夾襖步出監(jiān)牢的瞬間,已是汗流浹背作岖。 一陣腳步聲響...
    開(kāi)封第一講書(shū)人閱讀 31,950評(píng)論 1 264
  • 我被黑心中介騙來(lái)泰國(guó)打工唆垃, 沒(méi)想到剛下飛機(jī)就差點(diǎn)兒被人妖公主榨干…… 1. 我叫王不留,地道東北人鳍咱。 一個(gè)月前我還...
    沈念sama閱讀 46,260評(píng)論 2 360
  • 正文 我出身青樓降盹,卻偏偏與公主長(zhǎng)得像,于是被迫代替她去往敵國(guó)和親谤辜。 傳聞我的和親對(duì)象是個(gè)殘疾皇子,可洞房花燭夜當(dāng)晚...
    茶點(diǎn)故事閱讀 43,446評(píng)論 2 348