由于我國特殊的網(wǎng)絡(luò)環(huán)境踩寇，有時候我們通過conda無法順利下載和安裝生信軟件俺孙，我們必須還得熟悉傳統(tǒng)的軟件安裝方式掷贾，以備不時之需想帅。
傳統(tǒng)的軟件安裝方式包括：安裝預(yù)編譯版本的軟件和從源代碼安裝軟件。由于從源代碼安裝軟件的編譯過程非常緩慢旨剥，一般情況下優(yōu)先安裝預(yù)編譯版本浅缸。
1.從ftp下載預(yù)編譯版本的BLAST安裝包
# 選擇Linux系統(tǒng)安裝包疗杉，復(fù)制鏈接地址蚕礼，wget下載
# 也可使用瀏覽器下載后，通過FileZilla上傳到服務(wù)器
wget ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/LATEST/ncbi-blast-2.7.1+-x64-linux.tar.gz`
復(fù)制BLAST下載鏈接
通過wget命令下載BLAST軟件
2.解壓縮軟件
tar -zxvf ncbi-blast-2.7.1+-x64-linux.tar.gz
解壓縮后朝聋，在安裝目錄下的bin文件夾下課看到可執(zhí)行文件：
bin目錄下的可執(zhí)行文件
通過命令
./blastp -help可以返回blastp的幫助文檔冀痕，說明BLAST程序可成功執(zhí)行：
image
3.把程序的可執(zhí)行文件添加到環(huán)境變量中
我們手動安裝的預(yù)編譯版本的軟件言蛇，默認(rèn)情況下是不會把可執(zhí)行文件添加到系統(tǒng)的環(huán)境變量中去的，每次我們執(zhí)行程序時吨拗，都需要使用程序的絕對路徑婿斥，這樣就非常麻煩。我們可以手動添加到環(huán)境變量中：
# cd 進(jìn)入home目錄中
cd ~
# 打開.profile文件
vim .profile
# 在.profile中加入添加環(huán)境變量的命令民宿，其中export PATH=$PATH:后面是blast可執(zhí)行文件的絕對路徑
export PATH=$PATH:/mnt/h/Workspace/Biosoft/ncbi-blast-2.7.1+/bin/
# 使添加的環(huán)境變量立即生效
source .profile
程序可直接執(zhí)行
直接運行blastp程序哈恰，可以順利執(zhí)行志群，安裝成功！
