前幾天去外地參加婚禮饵筑,中間耽誤了好些時(shí)間,沒能做好持續(xù)更新博客处坪,感到罪過好大啊根资。想到自己始終以Scalers的持續(xù)迭代進(jìn)步為導(dǎo)航準(zhǔn)繩,這次中斷了同窘,做了蠻久的事又要重新再來玄帕。
根據(jù)博文 TCGA數(shù)據(jù)下載方法簡介中的順序J繼續(xù)來介紹R包RTCGA包。
R包下載
## try http:// if https:// URLs are not supported
source("https://bioconductor.org/biocLite.R")
biocLite("RTCGA")
涉及的包很多想邦,可能很久才能下載完裤纹,下載建議使用R,不要用Rstudio丧没,效果更好鹰椒,穩(wěn)定。
對RTCGA可下載的數(shù)據(jù)介紹
這里我給出RTCGA這個(gè)包的github.io主頁鏈接呕童,從這里可以了解到如何下載數(shù)據(jù)漆际,還有如何從各種數(shù)據(jù)中提取所要的數(shù)據(jù)集。
下載數(shù)據(jù)的工作流程:
RTCGA的工作流程
需要先下載RTCGA包夺饲,再來獲取其它數(shù)據(jù)奸汇。
可以遵循上圖的流程來做或查看官網(wǎng)的幫助文檔
本期完結(jié)!