讀《Single Cell Biomedicine》|| 新工具新視角

前兩天朋友圈在傳一本Xiangdong Wang老師的一本書:Single-cell Sequencing
and Methylation :Methods and Clinical Applications。于是在書庫(kù)里面搜索的時(shí)候看到了這本書:Single Cell Biomedicine,也是Xiangdong Wang 老師參編的。這幾年

單細(xì)胞技術(shù)是指面向單個(gè)細(xì)胞的分析技術(shù)合集,我們提過(guò)护姆,它是一個(gè)應(yīng)用層面。流式細(xì)胞是不是單細(xì)胞?是的陈辱,只是通量沒(méi)有那么高。不能手里拿著錘子就看什么都是釘子细诸,也不能一看到Single Cell 就想到scRNA,scVDJ沛贪,scATAC,應(yīng)該想到在微環(huán)境中活生生的震贵,細(xì)胞間相互交流利赋,細(xì)胞內(nèi)各種調(diào)控的細(xì)胞生態(tài)。

高通量的細(xì)胞技術(shù)(微流控+NGS)為我們?cè)趩渭?xì)胞水平上看基因的調(diào)控猩系、表達(dá)媚送、翻譯等信息,為我研究疾病機(jī)理提供了新的工具與視角寇甸。為什么單細(xì)胞技術(shù)是里程碑的呢塘偎?首先看里程碑在哪:個(gè)體,器官幽纷,組織式塌,細(xì)胞,細(xì)胞器友浸,生物分子峰尝。細(xì)胞處在這鏈條的中間位置:向上承接組織細(xì)胞類型,向下承接亞細(xì)胞單位收恢。

而武学,單細(xì)胞作為生物器官和組織的基本單位,近年來(lái)被認(rèn)為是進(jìn)一步了解器官功能和生物學(xué)的分子機(jī)制的一個(gè)重要窗口伦意。隨著單細(xì)胞生物技術(shù)的發(fā)展火窒,單細(xì)胞生物醫(yī)學(xué)越來(lái)越成為了解細(xì)胞間異質(zhì)性、識(shí)別疾病特異性生物標(biāo)志物驮肉、探索分子調(diào)控和信號(hào)的重要領(lǐng)域熏矿。單細(xì)胞系統(tǒng)生物學(xué)是強(qiáng)調(diào)作為一種方法來(lái)理解單細(xì)臨床表型,單細(xì)胞生物學(xué),異質(zhì)性票编。 多維度褪储、多層、多交叉和立體的單細(xì)胞生物學(xué)必將有利于疾病特異性生物標(biāo)志物的發(fā)現(xiàn)和開發(fā)慧域、將單細(xì)胞系統(tǒng)生物學(xué)轉(zhuǎn)化為臨床表型鲤竹、理解單細(xì)胞基因測(cè)序和患者對(duì)治療反應(yīng)的功能。作為單細(xì)胞生物醫(yī)學(xué)的一部分昔榴,單細(xì)胞RNA測(cè)序(scRNAseq)被用作定義轉(zhuǎn)錄組的改變辛藻、瘤內(nèi)和細(xì)胞間異質(zhì)性的發(fā)展以及響應(yīng)的基因毒性的關(guān)鍵和初始工具。

癌癥的異質(zhì)性可以通過(guò)單細(xì)胞測(cè)序和癌癥細(xì)胞的全面分子特征來(lái)描述互订,包括遺傳和體細(xì)胞的基因變化和突變吱肌。腫瘤細(xì)胞異質(zhì)性的特異性、表征和作用決定了細(xì)胞對(duì)治療的敏感性和耐藥性屁奏,并被認(rèn)為是基于提出的精確的自我驗(yàn)證系統(tǒng)開發(fā)靶向驅(qū)動(dòng)療法和臨床試驗(yàn)策略的關(guān)鍵因素岩榆。

當(dāng)然,單細(xì)胞不是終點(diǎn)坟瓢。或者說(shuō)犹撒,它展開了一個(gè)新的畫卷折联。這是一項(xiàng)醫(yī)學(xué)驅(qū)動(dòng)的技術(shù),所以他的學(xué)術(shù)识颊,他的應(yīng)用基本也都是面向臨床的:機(jī)理與應(yīng)用诚镰。以往的研究,特別是對(duì)異質(zhì)性較強(qiáng)的癌癥的研究祥款,基于組織可能只能分型分期清笨,到單細(xì)胞這可以看到每個(gè)癌細(xì)胞的狀態(tài)。這里我們不禁要引用一句話:

If you can not see it 刃跛, you can not stop it.

單細(xì)胞技術(shù)正好是一項(xiàng) see it 的技術(shù)抠艾,我們可以中各個(gè)側(cè)面看到單個(gè)細(xì)胞的性質(zhì),如基因的表達(dá)調(diào)控桨昙。雖然目前還都是沒(méi)有離開中心法則检号,單細(xì)胞像是人口普查,為我們提供一個(gè)全景的概覽蛙酪,以便我們可以找到新的方向齐苛。

生物醫(yī)學(xué)(Biomedicine)這個(gè)單詞的核心是個(gè)體,根本是細(xì)胞桂塞。所以單細(xì)胞技術(shù)可以說(shuō)是一個(gè)分界點(diǎn)凹蜂,到亞細(xì)胞結(jié)構(gòu)的研究偏向生物物理或者生物化學(xué)。單細(xì)胞技術(shù)的商業(yè)化,在2020年來(lái)看是學(xué)術(shù)界和產(chǎn)業(yè)界一同發(fā)展的玛痊。有不少科研院所的技術(shù)走出象牙塔擠進(jìn)大教堂汰瘫,這也是一個(gè)特點(diǎn)。

本書是編著卿啡,所以是圍繞Single Cell Biomedicine這個(gè)主題幾位專家展開的討論吟吝。開卷是有益的,看大牛們的討論颈娜,形成自己的思考剑逃。單細(xì)胞打開了一個(gè)維度,巧的是官辽,單細(xì)胞本身也是一個(gè)維度蛹磺。

感興趣的章節(jié)我做了標(biāo)注,不知道你有沒(méi)用看到呢同仆?

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