基因定位最有效且最常用的方法就是構(gòu)建遺傳連鎖圖譜進(jìn)行基因定位带迟，該方法對(duì)于數(shù)量性狀和質(zhì)量性狀的基因定位都適用。今天囱桨，小編簡(jiǎn)單講解一下遺傳圖譜構(gòu)建及QTL定位的一些基本知識(shí)點(diǎn)仓犬。

質(zhì)量性狀：

指能觀察但不能測(cè)量的性狀，同一種性狀的不同表現(xiàn)型之間不存在連續(xù)性的數(shù)量變化舍肠，而呈現(xiàn)質(zhì)的中斷性變化搀继。多由一對(duì)或少數(shù)幾對(duì)基因控制。比如翠语，花藥的有無(wú)叽躯、芒的有無(wú)、血型肌括、子粒的顏色等点骑。其雜交后代的個(gè)體可根據(jù)性狀明確分組，遺傳關(guān)系簡(jiǎn)單，一般服從三大遺傳定律黑滴。

數(shù)量性狀：

指?jìng)€(gè)體間表現(xiàn)的差異只能用數(shù)量來(lái)區(qū)別憨募，變異呈連續(xù)性的性狀。其主要特征有：①個(gè)體間差異很難描述跷跪，需要度量馋嗜；②在一個(gè)群體中齐板，變異呈連續(xù)性吵瞻；③數(shù)量性狀常受多基因控制；④數(shù)量性狀對(duì)環(huán)境影響敏感甘磨。

QTL（quantitative trait locus）：

QTL是數(shù)量性狀座位或者數(shù)量性狀基因座橡羞，它指的是控制數(shù)量性狀的基因在基因組中的位置。對(duì)QTL的定位必須使用遺傳標(biāo)記济舆，通過(guò)尋找遺傳標(biāo)記和感興趣的數(shù)量性狀之間的聯(lián)系卿泽，將一個(gè)或多個(gè)QTL定位到位于同一染色體的遺傳標(biāo)記旁，換句話(huà)說(shuō)滋觉，標(biāo)記和QTL是連鎖的签夭。

遺傳圖譜：

某一物種的連鎖圖譜，顯示所知的遺傳標(biāo)記的相對(duì)位置椎侠，而不是在每條染色體上特殊的物理位置第租。

加性效應(yīng)：

影響數(shù)量性狀的多個(gè)微效基因的基因型值的累加，也稱(chēng)性狀的育種值我纪，是性狀表型值的主要成分慎宾。

上位效應(yīng)：

一對(duì)基因的表現(xiàn)受到另一對(duì)非等位基因的作用，這種非等位基因間的抑制或遮掩作用叫上位效應(yīng)浅悉。起抑制作用的基因稱(chēng)為上位基因趟据，被抑制的基因稱(chēng)為下位基因。

顯性效應(yīng)：

指各基因效應(yīng)值與其加性效應(yīng)值的離差术健，亦即基因型值(G)與其加性效應(yīng)值(D)的差汹碱。又叫顯性高差，以H表示荞估，即H=G-D(設(shè)上位性效應(yīng)I=0)比被。其值可為正數(shù)或負(fù)數(shù)，大小取決于群體中的基因頻率泼舱，并是各位點(diǎn)內(nèi)顯性值的總和等缀。

LOD score：

遺傳學(xué)上通常用或然率的常用對(duì)數(shù)作為標(biāo)準(zhǔn)的衡量方法，該值的對(duì)數(shù)值稱(chēng)為L(zhǎng)od值或?qū)?shù)優(yōu)勢(shì)比娇昙。根據(jù)兩個(gè)非此即彼的假設(shè)尺迂，計(jì)算數(shù)據(jù)的整體或然性，以確定兩個(gè)基因座或是按一定的重組率而相互連鎖的可能性或是互不連鎖的可能性；這兩種可能性之比噪裕，是基因座實(shí)際上為連鎖的可能性蹲盘；這個(gè)比率的10作底的對(duì)數(shù)就是對(duì)數(shù)優(yōu)勢(shì)比，即Lod值膳音。為了確定是否存在連鎖召衔，一般要求或然比大于1000:1，即Lod>3祭陷。

QTL貢獻(xiàn)率：

一個(gè)QTL所能解釋的表型變異概率被稱(chēng)為QTL的貢獻(xiàn)率苍凛。

物理圖譜：

以物理尺度標(biāo)明各種遺傳標(biāo)記在基因組上的位置和距離。物理圖譜的構(gòu)建不需要經(jīng)過(guò)減數(shù)分裂的世代群體兵志，可以直接通過(guò)DNA測(cè)序獲得醇蝴。

QTL作圖：

尋找遺傳標(biāo)記和感興趣的數(shù)量性狀之間的聯(lián)系，將一個(gè)或多個(gè)QTL定位到連鎖群的相應(yīng)位置想罕，并估計(jì)其遺傳效應(yīng)的過(guò)程稱(chēng)為QTL作圖寞钥。

QTL作圖常用的方法包括：區(qū)間作圖衔瓮、復(fù)合區(qū)間作圖。常用的QTL作圖軟件有QTL Icimapping、MapQTL棉胀、WinQTL cartographer亮钦、QTLNetwork忿族、R\qtl等谅将。

偏分離：

指觀察到的基因型比例偏離預(yù)期的孟德?tīng)栴l率的分離方式，它不遵循分離規(guī)律鸠蚪，無(wú)法用傳統(tǒng)的遺傳理論和方法加以分析今阳。偏分離可以增加群體中雜合等位基因或者異型染色體的頻率。

重組率：

指同源染色體的非姊妹染色單體間有關(guān)基因的染色體片段發(fā)生交換的頻率茅信，一般利用重新組合配子數(shù)占總配子數(shù)的百分率進(jìn)行估算盾舌。

厘摩（cM）:

厘摩是重組頻率的測(cè)量單位 ，也是遺傳圖距單位蘸鲸。1個(gè)厘摩定義為重組頻率100次中發(fā)生1次妖谴。換句話(huà)說(shuō)，若兩個(gè)基因間相距1個(gè)厘摩酌摇，那么其后代與父母相比膝舅，有1%的個(gè)體具有不同的等位基因頻率。這一數(shù)值越小窑多，基因在染色體上的位置就越近仍稀，連鎖關(guān)系越緊密。

以上就是小編整理的遺傳圖譜構(gòu)建和QTL定位的一些基礎(chǔ)知識(shí)點(diǎn)埂息。當(dāng)然技潘，如果要作圖的話(huà)遥巴，還需要了解作圖群體，這部分內(nèi)容可以參考“作圖群體如何選擇享幽？”這篇文章（藍(lán)色字體可以點(diǎn)擊）铲掐。

如果您近期有遺傳圖譜構(gòu)建及QTL定位的計(jì)劃，您大可和我們聯(lián)系值桩，我們將派專(zhuān)人給您制定詳細(xì)的實(shí)驗(yàn)計(jì)劃摆霉，以期得到一張優(yōu)質(zhì)的圖譜和一個(gè)精確的定位結(jié)果。

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