寫在前面
從某個(gè)角度上來說蝌箍,「TBtools」基本長成一個(gè)相對(duì)常見的青灼,偏向于大眾化的生物信息學(xué)小工具。過去幾年的不間斷開發(fā)妓盲,不僅僅得到用戶認(rèn)可杂拨,也得到了部分生信科研工作者的認(rèn)可。其間悯衬,浙江大學(xué)陳銘老師有聯(lián)系到我們弹沽,討論是否在他主編的「生物信息學(xué)」書籍中,增加「TBtools」章節(jié)。當(dāng)然贷币,我們很樂意击胜,于是有了如下。
《Integrative Bioinformatics》簡介
書籍的第一版在2014年出版役纹,那會(huì)我們不知道生物信息存在偶摔。這一版本,即書籍的第二版促脉。全書分為 5 個(gè)部分:
- 介紹了生信發(fā)展歷史辰斋,同時(shí)兼顧植物生物信息相關(guān)發(fā)展
- 概覽了生物信息在線數(shù)據(jù)資源,如網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)庫以及相關(guān)工具
- 重點(diǎn)關(guān)注多組學(xué)整合分析技術(shù)瘸味,其開發(fā)與應(yīng)用
- 詳細(xì)講述了生物分子調(diào)控網(wǎng)絡(luò)分析策略與實(shí)現(xiàn)
- 展現(xiàn)了系列數(shù)據(jù)驅(qū)動(dòng)型生物信息學(xué)工具與平臺(tái)
「TBtools」相關(guān)部分在第 5 部分宫仗,第 17 章。
第 17 章「TBtools」 講了啥旁仿?
we describe the design philosophy, development objectives, and main characteristics of TBtools.
We also provide a comprehensive introduction of its main functions, especially
those included in the “Sequence Toolkits” and “Graphics” catalogs, and advanced
features, like R plugins that contributed by senior users. A few practical tutorials
are presented to demonstrate the superb functionalities and outstanding interactive
nature of TBtools.
相比于期刊文稿藕夫,書籍編寫會(huì)更自由一些,我們可以盡情寫一些覺得值得一寫的枯冈。
- 設(shè)計(jì)理念與開發(fā)目標(biāo)毅贮,
- 「TBtools」功能概覽(含最新特性 - 至2021年)
- 使用示例
感興趣可直接查看原始書籍。
《Interactive Data Analyses Using TBtools》
https://link.springer.com/chapter/10.1007/978-981-16-6795-4_17
為什么說是「第二次」
早前尘奏,老孟與我討論滩褥,提了下他要搞本書。也忘了大體是啥時(shí)候炫加,反正就是很久瑰煎,后來就沒有后來了。于是今次的這本屬于「第二次」參與俗孝,但卻是第一本酒甸。
寫在最后
近期事情比較多,就簡單介紹一下驹针。事實(shí)上烘挫,這個(gè)事情也至少是一個(gè)月以前的事情。好柬甥,感興趣的朋友看看書籍原文。