R語(yǔ)言基礎(chǔ)
認(rèn)識(shí)R和Rstidio
R是一種免費(fèi)開(kāi)源的編程語(yǔ)言荒典，對(duì)于生信分析十分友好霎烙，因?yàn)樗鼌R集了很多函數(shù)，很多包，能夠大部分的下游分析麦箍，統(tǒng)計(jì)計(jì)算卢肃，繪圖幻锁。
Rstudio 是一款R語(yǔ)言的IDE,因?yàn)楸旧鞷自帶的環(huán)境對(duì)于操作者來(lái)說(shuō)不太友好敞映，Rstudio提供了很多調(diào)試，可視化的功能與環(huán)境糕珊，使R的使用更為方便动分。
基礎(chǔ)設(shè)置
打開(kāi)Rstutio后，點(diǎn)擊Tools--global options红选，在general中可以設(shè)置默認(rèn)的R版本澜公，appearance里可以設(shè)置字體大小，主題等喇肋，有興趣的可以每個(gè)選項(xiàng)都嘗試一下坟乾。
R語(yǔ)言基本操作
1.設(shè)置工作目錄
設(shè)置好工作目錄，可以將腳本蝶防、文件糊渊、圖片等都保存到該目錄中，防止找不到慧脱。
getwd() #查看當(dāng)前工作目錄
setwd(新地址) #設(shè)置新的工作目錄
或者每次新建project時(shí)，設(shè)置好名稱(chēng)和位置贺喝，以后每次打開(kāi)都直接打開(kāi)這個(gè)project即可菱鸥。
2.顯示文件列表
dir() #查看當(dāng)前工作目錄里的文件宗兼，類(lèi)似于linux中的ls
3.賦值
<-是賦值，例如
x<-3 #將3賦值給x
4.刪除變量
rm(變量名)
rm（list=ls()）#刪除所有變量
