ST Pipeline||空間轉(zhuǎn)錄組分析流程

ST Pipeline: an automated pipeline for spatial mapping of unique transcripts

我們終于可以看到單個細(xì)胞在組織中的狀態(tài)了茬腿，細(xì)胞生物學(xué)開啟spatial + 時代蜓肆，spatial + 轉(zhuǎn)錄組/蛋白組/代謝組坞古，然后是空間多組學(xué)媚污。想想都怕炭分，安心讀文獻(xiàn)啥容。

SPATiAL
pipeline

其實看到這個pipeline的最后那張表我們就不怕了蛙酪，就是把之前的單細(xì)胞的cell-gene矩陣轉(zhuǎn)化為xy-gene的矩陣鸟整，在其中xy是cell的坐標(biāo)二蓝，那么有單細(xì)胞分析經(jīng)驗的小伙伴不是得心應(yīng)手了嗎誉券，分析方法可以用了呀。

ST Pipeline: an automated pipeline for spatial mapping of unique transcripts
st_pipeline||github
10X spatialtranscriptomics

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