常用的工具
某個基因的研究現(xiàn)狀--pubmed文獻自動分析工具EVEX數(shù)據(jù)庫
cytoscape的插件
參考鏈接
string
string教程
Cytoscape的使用
Cytoscape官網(wǎng)
cytoscape中文教程-Y大寬
Cytoscape是一個基于Java的網(wǎng)絡構建程序浩村,在它的基礎上有許多現(xiàn)成的可用的包做葵,用于網(wǎng)絡構建等等。官網(wǎng)包括軟件下載心墅,軟件依賴檢測酿矢,相關社區(qū),相關包cytoscape的所有插件包怎燥,教程瘫筐。
主要漢化講述:差異基因的網(wǎng)絡構建
從APPs—— APP manager …… 從中輸入目標包STRING
,install
同樣安裝其他的包
Agilent Literature Search
,GeneMANIA
,
WikiPathways
NDEx
GeneMANIA
也可以從上述地址下載jar文件,手動從APP manager里面安裝铐姚。
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默認的物種是人類策肝,需要根據(jù)自己的實際物種修改。