Dgenesis可視化paf格式的比對(duì)文件

https://dgenies.toulouse.inra.fr/install

可以直接使用在線版 或者也可以本地安裝

windows版直接下載安裝包紊服，安裝就可以

啟動(dòng)軟件是啟動(dòng)瀏覽器的頁(yè)面

image.png

3 個(gè)輸入文件

第一個(gè)是minimap2比對(duì)的paf格式問(wèn)價(jià)

第二個(gè)和第三個(gè)是fasta的idx文件，可以利用腳本

https://raw.githubusercontent.com/genotoul-bioinfo/dgenies/v1.2.0/src/dgenies/bin/index.py

生成這個(gè)文件

python index.py -i input.fa -n abc -o input.idx

i 是fasta的文件路徑
n 是自己隨便起的
o 是輸出文件的路徑

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