Linux下bowtie2安裝(非conda)和配置

conda安裝更好歹苦,但這種方法也要學(xué)會(huì)咨堤,因?yàn)椴⒉皇撬熊浖伎梢詂onda安裝埂伦,如果要看conda下安裝NGS軟件仔蝌,請(qǐng)看我以前的這篇:用conda安裝RNA-seq所需要的工具

養(yǎng)成習(xí)慣泛领,安裝在固定目錄下
比如家目錄下,建biosoft文件夾敛惊,下面建各個(gè)軟件的文件夾

$ mkdir biosoft
$ cd biosoft/
~/biosoft$ mkdir bowtie2
~/biosoft$ cd bowtie2/
~/biosoft/bowtie2$ wget https://sourceforge.net/projects/bowtie-bio/files/bowtie2/2.3.5.1/bowtie2-2.3.5.1-linux-x86_64.zip/download

解壓文件

$ unzip bowtie2-2.3.5.1-linux-x86_64.zip

下面把bowtie2寫入bashrc,以便以后隨便哪個(gè)目錄都可以調(diào)用

vim ~/.bashrc

最后一行加入
export PATH="$PATH:/home/kelly/biosoft/bowtie2/bowtie2-2.3.5.1-linux-x86_64/"

保存退出

$ source ~/.bashrc

就完成了配置渊鞋。

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