精準(zhǔn)醫(yī)療是誰都要獨(dú)一無二的治療方法?共識分子分型了解一下!

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結(jié)直腸癌的共識分子分型(DOI:10.1016/j.gendis.2019.10.013)


由于不同癌變通路的CRC具有不同的臨床病理特征碾阁,甚至是不同的預(yù)后和治療反應(yīng)性输虱,因此隨著個體化醫(yī)學(xué)的發(fā)展,人們對CRC精準(zhǔn)分子分型的需求越來越迫切脂凶。從2007年開始宪睹,科學(xué)家就嘗試進(jìn)行CRC的分子分型。隨著基因組學(xué)蚕钦、轉(zhuǎn)錄組學(xué)及高通量測序等技術(shù)的發(fā)展亭病,從2012年起,基于不同基因表達(dá)譜分析平臺和分析方法的多個CRC分型系統(tǒng)相繼被報道嘶居。不同的分型系統(tǒng)之間有一定的相似性罪帖,比如MSI微衛(wèi)星不穩(wěn)定性,microsatellite instability)相關(guān)的腫瘤和間質(zhì)基因高表達(dá)的腫瘤都被單獨(dú)的分了出來邮屁,但是同樣也存在很大的差異整袁,不便于使用。為了規(guī)范CRC的基因分子分型佑吝,2015年坐昙,國際結(jié)直腸癌分型協(xié)作組(The CRC Subtyping Consortium,CRCSC)綜合了六套CRC分型數(shù)據(jù)芋忿,開發(fā)了一套基于網(wǎng)絡(luò)生物學(xué)的整合性分型算法炸客,建立了4種CRC分子特征共識分型(consensus molecular subtype,CMS)——CMS1戈钢、CMS2嚷量、CMS3和CMS4(表1)。四種分型在參與分析的近4000例腫瘤中所占的比例分別是14%逆趣、37%蝶溶、13%和23%,其余的是無共有特征性腫瘤宣渗,不具有任何一致性的特征抖所,占到了全部原發(fā)性腫瘤的22%。

CMS1型又被稱為MSI免疫型痕囱,表現(xiàn)為高的MSI和CIMPCpG島甲基化表型田轧,CpG island methylator phenotype),低的CIN染色體不穩(wěn)定性鞍恢,chromosome instability)和強(qiáng)免疫原性傻粘。近70%的BRAF突變的患者都集中在這一型中每窖。雖然高M(jìn)SI的典型特征是高的基因突變率,但是除BRAF之外的其它常見CRC驅(qū)動基因弦悉,比如APC窒典、TP53、KRAS稽莉、PIK3CA等的突變頻率并不比其他類型高瀑志。這一類型腫瘤中常見的活化通路有JAK-STAT通路、Caspases通路等污秆。腫瘤中常見免疫細(xì)胞的彌漫性浸潤劈猪,主要為Th1細(xì)胞、細(xì)胞毒T細(xì)胞和NK細(xì)胞等良拼;而且CTLA4战得、PD1、PDL1等免疫檢測點(diǎn)分子高表達(dá)庸推,具有高免疫原性贡避,因此總生存和無進(jìn)展生存較好,也是免疫檢測點(diǎn)藥物治療的適宜人群予弧。但此類患者一旦復(fù)發(fā)刮吧,其預(yù)后很差。

CMS2型又被稱為經(jīng)典型掖蛤,表現(xiàn)為高CIN杀捻、低CIMP和MSI特征,因此腫瘤具有典型的上皮分化特征蚓庭,并存在大量的體細(xì)胞拷貝數(shù)改變(somatic copy number alterations致讥,SCNAs)。比較特征性的是這一類型中15%的患者都具有HNF4A基因的擴(kuò)增器赞,而且Wnt和Myc靶基因垢袱,以及很多癌基因如EGFR、ERBB2(Her2)港柜、IGF2请契、IRS2、HNF4A和cyclins等過表達(dá)夏醉。常見的活化通路有EGFR和SRC通路爽锥、Wnt和Myc通路等。另外畔柔,此類腫瘤的免疫原性較低氯夷,但患者整體預(yù)后較好,即使是在腫瘤復(fù)發(fā)以后靶擦,其預(yù)后也優(yōu)于其他類型的腫瘤腮考。


CMS3型又被稱為代謝型雇毫,表現(xiàn)為中等程度的CIN和CIMP,30%的個體還具有MSI特征踩蔚,KRAS突變的患者也在此型中相對富集棚放。此型患者最突出的特征是細(xì)胞代謝譜的改變和代謝重編程,各種糖寂纪、脂席吴、氨基酸赌结、核苷酸代謝均處于活躍狀態(tài)捞蛋,尤其是谷氨酰胺分解和脂肪生成通路異常活化柬姚。CMS3型腫瘤的免疫原性同樣較低拟杉,但患者整體預(yù)后較好。


CMS4型又被稱為間質(zhì)型量承,表現(xiàn)為高CIN搬设、低MSI和CIMP,它與CMS2型的主要區(qū)別是癌旁組織中有大量的基質(zhì)細(xì)胞撕捍,如腫瘤相關(guān)成纖維細(xì)胞(cancer-associated fibroblasts拿穴,CAFs);腫瘤組織中也有大量的炎癥細(xì)胞浸潤忧风,如Treg細(xì)胞默色、髓源性抑制細(xì)胞(myeloid-derived suppressor cells,MDSCs)狮腿、單核細(xì)胞和Th17細(xì)胞等腿宰。由于CAFs分泌高水平的TGF-β,而炎癥細(xì)胞產(chǎn)生大量的炎癥和免疫抑制因子缘厢,如CXCL12吃度、CCL2、IL-23和IL-17等贴硫,因此表現(xiàn)出促轉(zhuǎn)移的免疫逃逸微環(huán)境椿每。另外,TGF-β信號通路以及上皮間葉轉(zhuǎn)換(epithelial-mesenchymal transition英遭,EMT)拖刃、整合素通路、VEGF和VEGFR通路贪绘、細(xì)胞外基質(zhì)重塑和補(bǔ)體介導(dǎo)的炎癥通路等均在此型中處于活化狀態(tài)兑牡,因此患者的預(yù)后很差。


此外税灌,這四種分型的CRC也具有較為鮮明的臨床病理特征(表1)均函。CMS1型更常見于女性患者亿虽,腫瘤多位于右半結(jié)腸,直腸癌罕見苞也,病理上多表現(xiàn)為中洛勉、低分化的實性和/或管狀或粘液型;CMS2型多位于左半結(jié)腸如迟,直腸癌所占比例較高收毫,病理上多表現(xiàn)為中、高分化的復(fù)雜管狀結(jié)構(gòu)殷勘;CMS3型多位于右半結(jié)腸此再,病理上多表現(xiàn)為中、高分化的乳頭狀腫瘤玲销;CMS4型中直腸癌所占比例較高输拇,患者診斷時多為晚期,病理上多表現(xiàn)為中贤斜、低分化策吠,并伴有高間質(zhì)結(jié)締組織增生反應(yīng)。值得一提的是瘩绒,絕大部分的直腸癌均為CMS2和CMS4型猴抹。


另外,通過對比管狀腺瘤和無蒂鋸齒狀腺瘤的基因表達(dá)譜發(fā)現(xiàn)锁荔,無蒂鋸齒狀腺瘤中蟀给,TGF-β通路活化,依TGF-β通路活化程度的不同堕战,可分別進(jìn)展為CMS1和CMS4型腫瘤坤溃。通過BRAF激活突變建立的無蒂鋸齒狀腺瘤類器官體模型中,結(jié)合微環(huán)境中的高水平TGF-β信號嘱丢,可直接驅(qū)動間質(zhì)型CMS4樣腫瘤的形成薪介。


以上內(nèi)容均來自文獻(xiàn)[1].


其他文獻(xiàn)講的有一點(diǎn)點(diǎn)小差異,比如CMS3型越驻,有文獻(xiàn)說的是SCNA低汁政、CIMP低。具體如下:

根據(jù) Guinney 等人的基于轉(zhuǎn)錄組學(xué)的分類法缀旁,CMS1(MSI 免疫型)組占 CRC 的 14%记劈,其定義是腫瘤表現(xiàn)出 MSI、CIMP 高表型并巍、BRAF 基因突變目木、疫浸潤由T助1細(xì)胞和細(xì)胞毒性T淋巴細(xì)胞,并強(qiáng)烈激活免疫逃避途徑懊渡。CMS2(經(jīng)典型)組是最大的組刽射,占 CRC 的 37%军拟。CMS2 組由特征為體細(xì)胞拷貝數(shù)改變 (SCNA) 高、WNT 和 MYC 激活的腫瘤組成誓禁。CMS3(代謝型)組代表 13% 的 CRC懈息,描述了混合 MSI 狀態(tài)的腫瘤,通常是 SCNA 低和 CIMP 低摹恰,具有 KRAS 基因突變和代謝失調(diào)辫继。CMS4(間充質(zhì))組占 CRC 的 23%,這些腫瘤通常被定義為 SCNA 高俗慈、TGF-β 激活并具有間質(zhì)浸潤和血管生成能力姑宽。


所以,如果要深究姜盈,大家可能還是得看最權(quán)威的那篇文獻(xiàn)[3]低千。



參考文獻(xiàn)

1. 孫玉琳, 趙曉航. 結(jié)直腸癌的分子分型及精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)時代展望. 中華結(jié)直腸疾病電子雜志,2018,7 (5): 412-419配阵;

2. Li X, Larsson P, Ljuslinder I, et al. A modified protein marker panel to identify four consensus molecular subtypes in colorectal cancer using immunohistochemistry[J]. Pathology-Research and Practice, 2021, 220: 153379.

3. GuinneyJ, DienstmannR, WangX, et al. The consensus molecular subtypes of colorectal cancer [J]. Nat Med, 2015, 21(11):1350-1356.



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