坦白局
原創(chuàng): 生信技能樹 生信技能樹 2月13日
春節(jié)旅途折騰辫封,所以玩了個坦白局巡李,很多人問的問題特別正能量驶冒,值得記錄一下并且分享給所有的粉絲.
Q1: 您是生信行業(yè)前沿科學工作翹楚殊轴,又致力國內(nèi)生信知識的普及—-請問怎么看未來5年嚎杨,10年中國及外國生信方向的機會和行業(yè)發(fā)展方向
不僅僅是生物學厌殉,可以說所有的科學行業(yè)都已經(jīng)信息化或處于信息化的階段食绿,那么生物信息學必然是一個高速發(fā)展的學科,或者說是方向吧公罕。谷歌的CEO施密特不是說一句話么:“如果有人給你在火箭上提供了一個位置器紧,那么,別管位置好壞楼眷,先上去再說铲汪。”
因為你跟著這個火箭罐柳,你的速度會比所有其他交通工具都快掌腰,我們這生物信息學也是一樣的。你只需要你現(xiàn)在需要做的就是先學张吉,先上車齿梁,不管是普通的R語言還是高級的NGS,這些東西你先學好一定是非常有用的,這些技能在你所有科研生涯里面是一個非常大的助力勺择,先上來再說创南。
未來五年十年,我說的也不算省核,因為我入行也就五年稿辙,依稀記得五年前測一個普通的轉(zhuǎn)錄組要兩萬多,現(xiàn)在1000塊都不到气忠,這個變化實在是太快了邻储,很有可能未來十年就全民全基因組都免費,所有人都有自己的基因組數(shù)據(jù)旧噪,這將會是醫(yī)療行業(yè)健康行業(yè)全部發(fā)生巨大變革吨娜。如果我要是能提前預測這些東西或者我能看到清晰的方向,我就自己去創(chuàng)業(yè)啦淘钟。但是我現(xiàn)在看不到萌壳,我只知道我現(xiàn)在努力肯定是對的,我努力日月,總有一天我會看到的袱瓮。
Q2: 我感到您身上有一種使命感,和凝聚力爱咬,把大家召集在一起尺借,來一起創(chuàng)造一個愿景和未來。您也特別無私的分享很多知識精拟,也帶動一個分享的氛圍燎斩。 —-請問過去在您身上是什么樣的契機和經(jīng)歷,讓您做這樣一份勇敢又堅持的創(chuàng)業(yè)和選擇呢
為什么會選擇條路并且堅持下去呢蜂绎?其實很簡單栅表,就是一個非常小的嘗試,加上持續(xù)不斷的正反饋师枣。所謂非常小的嘗試怪瓶,就是五年前選擇轉(zhuǎn)行進入生物信息領域的時候,是一個純粹的外行践美。在那個年代博客是很少了的洗贰,而且大家寫的那幾個教程非常有限,而且基本上不對我的胃口陨倡。在自行摸索的學習過程中敛滋,受到了挫折特別多,各種軟件都只有英文的說明書兴革,沒有中文的绎晃。而且蜜唾,隨便一個說明書都是200多頁的,PDF根本抓不到重點庶艾,所以我就想做一個嘗試灵妨,把軟件,精簡成三部曲落竹,如何安裝,怎么樣在測試數(shù)據(jù)上使用它货抄,最小參數(shù)使用述召,最后怎么解釋這個結(jié)果。結(jié)果很不錯蟹地,非常受歡迎积暖,陸陸續(xù)續(xù)都有人寫郵件或者留言感謝我,這樣的正反饋就促使我一直堅持下來了怪与,堅持了五年夺刑。
我并不是主動選擇五年后的自己,而是因為處于這個時代所以分别,就恰好做了這個事情遍愿。然后我覺得在接下來的過程中,會涌現(xiàn)很多和我一樣的優(yōu)秀的小伙伴耘斩,他們也會來做分享沼填。我非常歡迎大家傳承我的信念,在做分享的過程中括授,會不停的督促自己學習的坞笙。不少兩三年前跟我學習的小伙伴,他們現(xiàn)在也有自己的博客荚虚,所以我們形成了生信技能樹聯(lián)盟薛夜。然后我覺得,生物信息學和生物搭邊版述,所以其研究方向和范圍非常之廣泛梯澜,不是單獨的莫個人能夠做完的知識整理和分享,必然是一個團隊渴析。而我恰好又處于這樣的一個中心和結(jié)點腊徙,那么我覺得我恰好有這個資質(zhì),或者就像你說的這種使命感檬某,帶領大家把這件事情做好撬腾,而且我也非常享受這個角色。
Q3: 我想請教你一個問題恢恼,我覺得自己很多事情想做民傻,但老是精力不足,效率低下。我想向你請教一下漓踢,你是否有跑步的習慣牵署,堅持晨跑嗎?因為我的職業(yè)決定了一般是早晨開展的才容易堅持喧半,晚上的話時間太不固定了
你能問我這個問題奴迅,說明你認為我在檢查做生物信息學知識整理分享了,而且做得還不錯挺据!的確取具,我就是堅持寫教程了,主要是學習新的R包測評扁耐,新的軟件的用法暇检。正是因為我這五年來在不停的學新的東西,所以知識面才會這么廣闊婉称。再加上2018到現(xiàn)在的話块仆,閱讀了大量相關的文獻,原則上是每周一篇筆記王暗。一年的話就有48篇悔据,每一篇文獻背后又有十幾篇背景知識文獻,這樣的話俗壹,相當于每年的閱讀文獻量超過400篇蜜暑,所以算是一個蠻大的閱讀量的。
比如春節(jié)七天我?guī)Р⊥瓿傻奈墨I閱讀筆記的分享策肝,目錄如下:
2019年1月份第1周(總第49周)單細胞轉(zhuǎn)錄組探索CAFs的功能和空間異質(zhì)性
2019年1月份第2周(總第50周)異常CRC病人的突變時空異質(zhì)性與免疫
2019年1月份第3周(總第51周)探索PDAC癌前病變
2019年1月份第4周(總第52周)TCGA計劃的ATAC-seq數(shù)據(jù)發(fā)布
2019年2月份第1周(總第53周)胃癌類器官
2019年2月份第2周(總第54周)測173個成年人的大腦的102個基因
2019年2月份第3周(總第55周)2.5萬漢族人的GWAS乳腺癌風險基因
我這個堅持呢肛捍,主要是自找的。比較那么多粉絲看著我之众,我對自己有這個要求拙毫,而且也夸出海口了棺禾,我要讀這么多文獻并且分享缀蹄,那么我如果不做到相當于身敗名裂,可以理解為我把自己綁在這一個不得不做的戰(zhàn)車上膘婶。有點類似于你想翻墻出校園吃小吃缺前,你先把書包丟過去,然后你就不得不翻過去了悬襟,哪怕你能力不夠衅码,也會想盡全力的翻過去,因為翻不過去脊岳,你的書包就拿不回來了逝段。
至于會覺得很多事情要做垛玻,但老是精力不足,效率低下奶躯。這個問題我也有帚桩,我當然也非常忙,忙到什么程度呢嘹黔,有好幾個實習生要帶账嚎,還有員工要培養(yǎng)和談心,每天還得回復一些粉絲來信儡蔓,還有全國巡講等事情要安排郭蕉,當然會覺得自己精力經(jīng)常顧不上。但是呢浙值,目前為止,所有的事情都穩(wěn)步推進檩小,可能是因為我把事情分為輕重緩急了开呐。即使有很多事情,它可能非常重要规求,但他就是被我忽略了筐付,那也沒有辦法,因為這就是人生阻肿,沒有十全十美瓦戚。我既然做到了很多值得大家鼓勵的成果,就不會去再看那些被忽略掉的小細節(jié)丛塌,因為有一點點成功就足以推動我們繼續(xù)往前走了较解。
我并沒有覺得精力不足,至于你說的效率低下赴邻,我通常認為是印衔,你還沒有熟練掌握。就是說姥敛,你很多背景知識沒有奸焙,就被迫從事了那一些,對你來說有點挑戰(zhàn)的彤敛。有挑戰(zhàn)的与帆,其實你應該花很多時間在背景知識的學習上面,這樣的話墨榄,你在做新的東西的時候玄糟,你的效率會高一點,因為你有足夠的背景知識支撐你去袄秩,在上面進行推理茶凳,還有邏輯思考嫂拴,還有各種事情,都是在你的已有的知識水平上面思考贮喧。所以呢筒狠,關于效率問題,你不妨思考一下是不是有什么基礎知識沒有學箱沦,就接受了高級的任務辩恼、有難度的東西。
在去年谓形,乃至3年前我還有堅持晨跑的習慣灶伊,如果翻看我的朋友圈還可以看到打卡的信息。但是呢寒跳,我自從開辦公司之后聘萨,事情比較多,所以這個日常跑步打卡早就停了半年多了童太。如果我接下來的半年把公司做好之后米辐,可能我會再重啟這個晨跑的習慣吧。我其實并沒有什么很嚴格的計劃书释,我的規(guī)劃都是按照星期翘贮、按照月度來的,就是把一些事情爆惧,比如公眾號的推文的撰寫狸页,還有新的技術的學習,新的R包扯再、網(wǎng)站工具的使用芍耘,還有這些新的視頻的錄制等重要的的事情優(yōu)先級提高即可。我只需要把主線抓住熄阻,就覺得挺好的齿穗,比如說我還有單細胞課程呢,還有一些TCGA的課程繼續(xù)錄制饺律。我通常就是把主線抓住窃页,爭取每天完成一點點主線任務,其余的支線任務的話复濒,就是看能力脖卖,看緣分,可以做就做巧颈,不做的話也無關緊要畦木,因為主線任務排在我的首位。
Q4: 我們植物研究方向的碩博生畢業(yè)后出路很有限砸泛,如果想往臨床醫(yī)學方向轉(zhuǎn)十籍,該做怎么樣的努力蛆封?
因為是老熟人,所以我郵件給了他約50個癌癥研究的名詞勾栗,希望他可以整理惨篱,形成自己的知識背景。
然后給了他十幾篇癌癥研究具體的一個方向的歷年綜述围俘,希望他可以翻譯其中一篇砸讳。
然后給了他兩個代碼,希望可以把這樣的代碼套用到TCGA的所有癌癥數(shù)據(jù)集里面界牡,同樣是擴充自己的知識背景簿寂。
幾個忠告
身體是革命的本錢,努力拼搏的前提是有個健康的身體宿亡。
勇敢一點常遂,嘗試一下。