絲狀真菌基因組DNA提取 ---- HP Fungal DNA Kit

一骚露、核酸

核酸本質(zhì)上是由3'蹬挤,5'-磷酸二酯鍵連接的dNTP多聚核苷酸長(zhǎng)鏈組成。根據(jù)核苷酸的不同核酸分為脫氧核糖核酸(DNA)和核糖核酸(RNA)棘幸。核酸提取過(guò)程中經(jīng)常涉及到的操作是基因組DNA和總RNA的提取焰扳。
DNA易溶于水,不溶于苯酚、乙醇吨悍、異丙醇扫茅、氯仿等有機(jī)溶劑。


DNA提取總的原則是:
① 提取過(guò)程中防止和抑制細(xì)胞中DNase對(duì)DNA 降解育瓜;
② 保證核酸一級(jí)結(jié)構(gòu)的完整性葫隙;
③ 核酸樣品中不應(yīng)存在對(duì)酶有抑制作用的有機(jī)溶劑和過(guò)高濃度的金屬離子;
④ 盡量去除蛋白質(zhì)躏仇、糖恋脚、脂等其他大分子的污染;
⑤ 去除其他核酸分子如RNA的污染


二焰手、HP Fungal DNA Kit — HP真菌DNA提取試劑盒

該試劑盒采用CTAB法和硅膠柱相結(jié)合的純化方式慧起,適用于從富含多糖類、酚類或DNA含量低的新鮮或干燥的真菌中提取高純度的基因組DNA册倒。新鮮或干燥的真菌組織研磨后,經(jīng)CTAB裂解液裂解磺送,氯仿抽提去除多聚糖和其他影響下游應(yīng)用的各種雜質(zhì)驻子,調(diào)節(jié)結(jié)合條件,轉(zhuǎn)移至HiBind柱子中離心吸附DNA估灿,兩次快速洗滌去除殘留的多糖類等雜質(zhì)崇呵,最后用低鹽緩沖液洗脫DNA。

十六烷基三甲基溴化銨(hexadecyltrimethyl-ammoniumbromide,CTAB)是一種陽(yáng)離子去污劑馅袁,能溶解細(xì)胞膜域慷,并具有從低離子強(qiáng)度溶液中沉淀核酸與酸性多聚糖的特性,與核酸結(jié)合汗销,使核酸便于分離犹褒。

圖片來(lái)自TSINGKE.png
試劑盒組分.png
二、實(shí)驗(yàn)前期準(zhǔn)備:

β-巰基乙醇弛针、氯仿叠骑、異戊醇、無(wú)水乙醇削茁、液氮宙枷、研缽、10/2/1.5mL離心管茧跋、液氮神器慰丛、65℃水浴鍋、渦旋振蕩器瘾杭、65℃ddH2O

三诅病、注意事項(xiàng)
注意事項(xiàng).png
五、Steps:

⒈于液氮中充分研磨新鮮菌絲,轉(zhuǎn)移至2mL離心管中睬隶,加入500μLCPL Buffer 和10μLβ-巰基乙醇锣夹,渦旋混勻,裂解樣品苏潜;
⒉在65℃水浴鍋孵育15min银萍,在孵育期間取出離心管混勻2次;
⒊加入500μL氯仿:異戊醇(24:1)混合液恤左,渦旋混勻贴唇,≥10000g離心5min;
⒋轉(zhuǎn)移300μL上清液到新的1.5離心管中飞袋;
⒌加入150CXD和300μL無(wú)水乙醇調(diào)節(jié)結(jié)合條件戳气,渦旋混勻;
⒍轉(zhuǎn)移上述混合液到HiBind DNA Column 中巧鸭,10000g離心1min瓶您;
⒎加入650μLSPW Wash Buffer,10000g離心1min纲仍,棄濾液呀袱;
⒏重復(fù)步驟7;
⒐空甩2min郑叠;
⒑200μLddH2O洗脫兩遍夜赵。


思考
Q1:氯仿的作用?
A1:加大比重乡革,使得有機(jī)相始終在下層寇僧,方便水相的回收
Q2:異戊醇的作用?
A2:異戊醇的作用主要是讓離心后上下層的界面更加清晰沸版,也方便水相的回收

流程.png

分層.jpg
四嘁傀、純度檢測(cè)
圖片來(lái)自TIANGEN.png

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