搜索功能基因的假基因

假基因(pseudogene)

假基因也叫偽基因,是基因家族在進(jìn)化過程中形成的無功能的殘留物垃环。假基因與正常基因序列高度相似凳干,但喪失正常功能晴裹,一般情況都不被轉(zhuǎn)錄被济,且沒有明確生理意義救赐。

假基因和正常基因的結(jié)構(gòu)上的差異包括在不同部位上的程度不等的缺失或插入只磷、在內(nèi)含子和外顯子鄰接區(qū)中的順序變化经磅、在5'端啟動區(qū)域的缺陷等。這些變化往往使假基因不能轉(zhuǎn)錄并形成正常的mRNA從而不能表達(dá)钮追。


方法一:在NCBI中查詢功能基因的假基因

1.進(jìn)入NCBI主頁(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/)预厌,選擇“Gene”數(shù)據(jù)庫,輸入要查詢的功能基因官方名稱元媚。

2.點(diǎn)擊進(jìn)入基因頁面轧叽。

3.Ctrl+F,在搜索框中輸入“pseudogene”刊棕,找到“General gene information”一欄炭晒。如示例所示,NCF1有兩個假基因甥角。

4.點(diǎn)擊“Review record(s) in Gene”网严,查看詳細(xì)信息。

5.進(jìn)入詳情頁嗤无,查看“Summary”震束。

方法二:從文獻(xiàn)中查詢功能基因的假基因

Brunson T, Wang Q, Chambers I, Song Q. A copy number variation in human NCF1 and its pseudogenes. BMC Genet. 2010;11:13. Published 2010 Feb 23. doi:10.1186/1471-2156-11-13

示例基因NCF1,該基因有兩個序列相似度很高的假基因NCF1B和NCF1C当犯,NCF1B和NCF1C基因exon2存在GT缺失垢村,從而導(dǎo)致蛋白編碼提前終止。

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