GC含量的偏好性

###分析測序原始reads的GC含量的必要性

二代測序平臺(tái)存在一定的偏好性墨闲,通過分析原始測序reads的GC含量與物種基因組的GC含量的偏差另凌,能夠判斷測序過程是否足夠隨機(jī)尾菇,平臺(tái)是否存在較大的測序偏差熬的。比如人類的基因組GC含量大約為40%咕村,如果測序原始數(shù)據(jù)的GC含量遠(yuǎn)遠(yuǎn)偏離這個(gè)比例,說明測序數(shù)據(jù)存在一定偏好性来吩,如果直接用測序數(shù)據(jù)敢辩,會(huì)影響后續(xù)的CNV和變異檢測的分析蔽莱。

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