成立于2016年7月益兄，趙國(guó)屏生物信息實(shí)驗(yàn)室目前主要從事人群微生物組，微生物基因組進(jìn)化和臨床微生物流行病學(xué)的生物信息學(xué)分析，包括基因組數(shù)據(jù)的管理匿醒、基因組的比較和進(jìn)化分析、微生物組數(shù)據(jù)的機(jī)器學(xué)習(xí)和微生物流行病學(xué)模型的應(yīng)用缠导。
基因組進(jìn)化和臨床微生物流行病學(xué)的生物信息學(xué)分析廉羔，包括基因組數(shù)據(jù)的管理、基因組的比較和進(jìn)化分析僻造、微生物組數(shù)據(jù)的機(jī)器學(xué)習(xí)和微生物流行病學(xué)模型的應(yīng)用憋他。
課題組負(fù)責(zé)人周豪魁，1982年9月生髓削。參與發(fā)表SCI文章十余篇竹挡，第一作者共計(jì)3篇。
2006年于上海交通大學(xué)獲得生物信息學(xué)學(xué)士學(xué)位立膛，其后在上海交通大學(xué)微生物分子生態(tài)與生態(tài)基因組學(xué)實(shí)驗(yàn)室參加腸道微生物組的研究工作揪罕。
2007年至2008年在上海生命科學(xué)院植物生理生態(tài)研究所參與環(huán)境宏基因組和能源微生物基因組挖掘的工作。
2009年至2014年師從中國(guó)科學(xué)院院士趙國(guó)屏宝泵，于香港中文大學(xué)醫(yī)學(xué)院微生物系獲得博士學(xué)位耸序。博士期間完成結(jié)核分枝桿菌的基因組進(jìn)化和致病性進(jìn)化的研究工作。隨后留校任為期2年的博士后工作鲁猩。期間參與了結(jié)直腸癌的微生物組研究坎怪。
2016年7月在中國(guó)科學(xué)院深圳先進(jìn)技術(shù)研究院生物醫(yī)藥與技術(shù)研究所合成生物學(xué)工程研究中心組建趙國(guó)屏院士生物信息課題組。致力于大規(guī)模人群腸道微生物組的數(shù)據(jù)挖掘和人群健康的研究廓握。
課題組成員搅窿，助理研究員羅明晶，2016年畢業(yè)于香港中文大學(xué)隙券，主修微生物學(xué)男应。
2010年于吉林大學(xué)獲得動(dòng)物醫(yī)學(xué)學(xué)士學(xué)位，其后在吉林大學(xué)獸醫(yī)藥理系鄧旭明教授研究組學(xué)習(xí)娱仔，并于2012年獲得獸醫(yī)碩士學(xué)位沐飘。
碩士畢業(yè)后加入香港中文大學(xué)微生物葉碧瑤教授研究組，并于2016年獲得博士學(xué)位牲迫。目前主要從事腸道微生物與疾病診斷相關(guān)研究耐朴。
課題組博士后葉羽，主修微生物學(xué)盹憎。
- 博士期間主導(dǎo)三個(gè)關(guān)于結(jié)核分枝桿菌的課題的研究工作：
- Mycobacterium tuberculosis中冗余鉬喋呤合成的功能研究以及在休眠中的作用筛峭；
- moaA, moaC and moaD等基因在維持Mycobacterium tuberculosis體內(nèi)氧化還原穩(wěn)態(tài)中作用的關(guān)聯(lián)研究；
- 結(jié)合生物信息血分鉬喋呤合成基因中moeA1基因的新功能鑒定陪每，分子進(jìn)化途徑以及其在免疫應(yīng)激壓力下的作用影晓。
- 參與數(shù)個(gè)相關(guān)課題的研究工作：
- CRISPR-CAS12a對(duì)非靶標(biāo)RNA的剪切活性的鑒定镰吵，以及相關(guān)核酸檢測(cè)產(chǎn)品的開發(fā)；
- 通過人類巨噬細(xì)胞模型THP-1及動(dòng)物模型對(duì)結(jié)核分支桿菌復(fù)合群（Mycobacterium tuberculosis complex）的細(xì)胞毒理及免疫應(yīng)答進(jìn)行研究挂签；
- 發(fā)現(xiàn)并鑒定一個(gè)微生物中全新的硝酸鹽還原酶亞型NasN疤祭，對(duì)其催化功能，生理意義和分子進(jìn)化都進(jìn)行了深入研究饵婆。
課題組成員魏予辰画株，博士生在讀，主修生物信息學(xué)啦辐。
- 流行病與生物統(tǒng)計(jì)學(xué)背景
- 研究方向：人群腸道微生物組關(guān)聯(lián)分析方法的優(yōu)化
- 具有獨(dú)立完成腸道微生物組生物信息學(xué)分析及與轉(zhuǎn)錄組、代謝組等多組學(xué)間關(guān)聯(lián)分析的項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn)
- 熟練使用R蜈项、python芹关、SAS、shell等工具紧卒，并用于進(jìn)行生物信息學(xué)及統(tǒng)計(jì)學(xué)分析侥衬。
課題組成員陳碩，2016年畢業(yè)于香港中文大學(xué)跑芳，主修流行病與生物統(tǒng)計(jì)學(xué)轴总。
- 2017年3月在中國(guó)科學(xué)院深圳先進(jìn)技術(shù)研究院加入趙國(guó)屏院士生物信息課題組
- 預(yù)防醫(yī)學(xué)專業(yè)，醫(yī)療及公共衛(wèi)生相關(guān)機(jī)構(gòu)的學(xué)習(xí)及工作背景博个，具有綜合醫(yī)院臨床實(shí)習(xí)經(jīng)驗(yàn)怀樟；參與并負(fù)責(zé)整個(gè)公共衛(wèi)生項(xiàng)目，從設(shè)計(jì)盆佣、實(shí)施往堡、質(zhì)控、數(shù)據(jù)收集共耍、數(shù)據(jù)分析虑灰、整合結(jié)果并報(bào)告工作的經(jīng)驗(yàn)。
- 負(fù)責(zé)參與醫(yī)院合作相關(guān)的項(xiàng)目設(shè)計(jì)痹兜、可行性報(bào)告的撰寫穆咐、查閱并整合相關(guān)文獻(xiàn)。
- 熟練掌握R字旭、熟悉python編程工具对湃，并用于微生物組16s數(shù)據(jù)分析及數(shù)據(jù)可視化。
課題組成員楊兮蘭遗淳，2019年畢業(yè)于深圳大學(xué)熟尉，主修統(tǒng)計(jì)學(xué)。
- 2018年5月在中國(guó)科學(xué)院深圳先進(jìn)技術(shù)研究院作為客座學(xué)生加入趙國(guó)屏院士生物信息課題組
- 數(shù)學(xué)專業(yè)背景洲脂，具有使用matlab進(jìn)行定位算法變成及仿真實(shí)驗(yàn)的項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn)斤儿，具有根據(jù)科學(xué)問題建立數(shù)學(xué)模型的項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn)剧包。
- 熟練掌握R及python編程工具，并用于微生物組16s數(shù)據(jù)分析及數(shù)據(jù)可視化往果。
課題組成員鄭睿琪疆液，2016年畢業(yè)于西班牙馬德里卡洛斯三世大學(xué)，主修大數(shù)據(jù)分析及生物技術(shù)專業(yè)陕贮。
- 2019年10月在中國(guó)科學(xué)院深圳先進(jìn)技術(shù)研究院加入趙國(guó)屏院士生物信息課題組
- 有二代測(cè)序數(shù)據(jù)分析堕油，轉(zhuǎn)錄組表達(dá)差異分析，實(shí)現(xiàn)TMB肮之，差異基因分析掉缺，高頻突變分析等高級(jí)分析點(diǎn)的項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn)。
- 熟練掌握R編程戈擒，熟悉python眶明。了解bwa,GATK等基因組分析軟件，能夠使用Python編寫簡(jiǎn)單爬蟲從數(shù)據(jù)庫(kù)上爬取內(nèi)容筐高，同時(shí)掌握生物實(shí)驗(yàn)技術(shù)搜囱。
課題組客座學(xué)生王亢宗, 東北林業(yè)大學(xué)在讀研究生, 植物發(fā)育學(xué)專業(yè)
- 2019年6月在中國(guó)科學(xué)院深圳先進(jìn)技術(shù)研究院作為客座學(xué)生加入趙國(guó)屏院士生物信息課題組。
- 本科期間憑借G-quadruplex對(duì)CCND1基因表達(dá)調(diào)控研究課題與同學(xué)獲得全國(guó)大學(xué)生生命科學(xué)競(jìng)賽一等獎(jiǎng)柑土。
- 在R,Python上有一些基礎(chǔ),目前正學(xué)習(xí)代謝組學(xué)數(shù)據(jù)分析技能蜀肘。
課題組成員李婕，2012年畢業(yè)于中山大學(xué)稽屏，多年生物信息學(xué)工作經(jīng)驗(yàn)扮宠。
- 2020年4月在中國(guó)科學(xué)與深圳先進(jìn)技術(shù)研究院加入趙國(guó)屏院士生物信息課題組。
- 有二代測(cè)序數(shù)據(jù)狐榔、甲基化測(cè)序數(shù)據(jù)處理合并統(tǒng)計(jì)建模的完整項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn)涵卵。
- 熟悉Python/R, 并用于微生物組學(xué)研究。
