6.2分 生信+實(shí)驗(yàn) 經(jīng)典套路,永不過時(一篇單基因泛癌的文章可以拆分成多個腫瘤單獨(dú)發(fā))

今天給大家介紹一篇單基因生信加實(shí)驗(yàn)的SCI文章袍辞,文章發(fā)表于frontiers in oncology鞋仍,今年的影響因子應(yīng)該會在6分以上。對于單基因的分析搅吁,挑選基因最為關(guān)鍵威创。小編認(rèn)為容易發(fā)表的基因要符合以下幾點(diǎn)(符合條件越多越好):

1 在多種腫瘤中該基因高表達(dá)

2 在多種腫瘤中該基因高表達(dá)的患者預(yù)后差

3 在多種腫瘤中該基因在高分期表達(dá)較高

4 不同腫瘤中的富集分析有比較集中的幾種結(jié)果

5 在一種或者多種腫瘤中與特定免疫細(xì)胞浸潤相關(guān),如巨噬細(xì)胞谎懦,CD8T細(xì)胞等

6 最好用不同的方法證明5中的結(jié)論

7 在某一種或者幾種腫瘤中集中于一些免疫相關(guān)基因相關(guān)性高

8 該基因最好報道過肚豺,但是又研究較少,有一定新穎性

如果能篩選到這樣的基因界拦,再添加單基因的各種層面分析吸申,肯定是比較容易接收的。能再加一些實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證就更好不過了享甸。

文章名:PAFAH1B3 Expression Is Correlated With Gastric Cancer Cell Proliferation and Immune Infiltration

影響因子:6.2

像這種單基因單腫瘤干濕結(jié)合的文章截碴,我們分析出來的單基因泛癌的結(jié)果完全可以拆分成多篇文章一起補(bǔ)實(shí)驗(yàn)分開發(fā)表,而且有一些朋友就在這么做枪萄。正所謂物盡其用隐岛!

進(jìn)入正文部分:

Figure 1: 基因泛癌差異表達(dá)情況及在胃癌中的差異表達(dá)

Figure 2: 基因在TCGA數(shù)據(jù)庫中的預(yù)后分析

Figure 3:基因在胃癌中的批量相關(guān)性分析,選擇正相關(guān)的top50個基因做熱圖

Figure 4 基因在胃癌中的富集分析瓷翻,包括GO(BP MF CC)聚凹,KEGG和GSEA分析割坠。

Figure 5 基因在泛癌中與免疫浸潤的關(guān)系。A圖展示在泛癌中免疫細(xì)胞浸潤水平在基因高低表達(dá)組的差異情況妒牙。B圖展示基因與免疫細(xì)胞在胃癌中的相關(guān)性分析彼哼。

Figure 6:基因的細(xì)胞功能試驗(yàn)。作者在這里補(bǔ)充了該基因在細(xì)胞株的表達(dá)湘今,以及敲低該基因后的增殖侵襲實(shí)驗(yàn)敢朱。作者還檢測了幾個促癌的關(guān)鍵基因,作為簡單的機(jī)制研究摩瞎。

本文結(jié)束拴签。

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