由QTL到基因--到底該不該高興呢狈定？
同源克隆的話題我們討論了不少（
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）。也曾說過让蕾，如果要圖位克隆一個(gè)QTL浪规，請(qǐng)事先確定區(qū)間內(nèi)沒有已報(bào)道的與要做的性狀相關(guān)的基因，如果有探孝，就要首先確定性狀是不是由該基因控制笋婿，當(dāng)然，沒有最好了顿颅。今天我們來說一說GW2這個(gè)基因缸濒，GW2這個(gè)基因首先在水稻里被圖位克隆，該基因控制水稻粒寬、粒重并對(duì)籽粒灌漿速率也有正向效應(yīng)庇配。而在小麥里TaGW2更是被報(bào)道了不下七八次斩跌，下面列一下與TaGW2直接相關(guān)的研究論文，有興趣的可以查閱原文閱讀讨永。
1、Identification and development of a functional marker of TaGW2 associated with grain weight in bread wheat (Triticum aestivum L.)
2遇革、Homologous haplotypes, expression, genetic effects and geographic distribution of the wheat yield gene TaGW2
3卿闹、Identification of Novel SNP in Promoter Sequence of TaGW2-6A Associated with Grain Weight and Other Agronomic Traits in Wheat (Triticum aestivum L.)
4、Down-regulation of the TaGW2 gene by RNA interference results in decreased grain size and weight in wheat
5萝快、Function of TaGW2-6A and its effect on grain weight in wheat (Triticum aestivum L.)
6锻霎、TaGW2-6A allelic variation contributes to grain size possibly by regulating the expression of cytokinins and starch-related genes in wheat
7、Influence of TaGW2-6A on seed development in wheat by negatively regulating gibberellin synthesis
8揪漩、TaGW2, a Good Reflection of Wheat Polyploidization and Evolution
9旋恼、A splice acceptor site mutation in TaGW2-A1 increases thousand grain weight in tetraploid and hexaploid wheat through wider and longer grains
10、A mutation in TaGW2-A increases thousand grain weight in wheat
11奄容、Analyse fonctionnelle de TaGW2, une E3 ligase de type RING, dans le développement du grain de blé tendre (Triticum aestivum)
12冰更、Transcript suppression of TaGW2 increased grain width and weight in bread wheat
13、SNP identification and allelic-specific PCR markers development for TaGW2, a gene linked to wheat kernel weight.
這13篇論文我只看過一部分昂勒，有些是剛搜出來的蜀细，看題目的話，感覺第6和第7篇文獻(xiàn)貌似套路差不多啊戈盈。
說回今天要推薦的文章上奠衔，今天要推薦的文章發(fā)表在TAG上，文章的題目是“A novel allele of TaGW2-A1 is located in a finely mapped QTL that increases grain weight but decreases grain number in wheat (Triticum aestivum L.)”塘娶，通訊作者是中國(guó)農(nóng)大的倪中福教授归斤，第一作者是翟會(huì)杰。
先插一句
刁岸，我看著TAG的排版貌似變了脏里，摘要部分不再是左右兩欄了。
本文主要對(duì)粒重和穗粒數(shù)進(jìn)行了研究虹曙。首先利用包含191個(gè)家系的RIL群體膝宁，獲得了11組田間表型數(shù)據(jù)，結(jié)合圖譜上的10,816個(gè)SNP和SSR標(biāo)記進(jìn)行QTL掃描根吁，最終鑒定出5個(gè)基因組區(qū)段（QTL）與粒重或穗粒數(shù)有關(guān)员淫，分別位于1B,3A,3B,5B以，6A以及7A击敌。其中6A上的QTL既影響粒重也影響穗粒數(shù)介返，使用近等基因系該QTL被定位在長(zhǎng)0.538cM的區(qū)間內(nèi)，效應(yīng)評(píng)價(jià)表明該位點(diǎn)在優(yōu)異近等基因系里能增加千粒重8.33%，但穗粒數(shù)減少了3.05%圣蝎。在該區(qū)間內(nèi)有一個(gè)已報(bào)道的基因TaGW2刃宵，所以接下來就在兩個(gè)材料里克隆該基因，發(fā)現(xiàn)粒重高的材料在基因的5'端有114bp的缺失徘公，該缺失能夠影響啟動(dòng)子活性繼而下調(diào)基因表達(dá)牲证。對(duì)848份普通小麥檢測(cè)發(fā)現(xiàn)只有3份材料缺失114bp，分別是Jinan 13, Jinghua 9和Gaoyou 0551关面。
聽說這篇文章審稿的時(shí)候還挺曲折的
坦袍。穗粒數(shù)或粒重到底與GW2有沒有關(guān)系還是需要進(jìn)一步的研究來確定，這么多文章下來等太，有些結(jié)論還是沖突的捂齐，有的文章里報(bào)道是正調(diào)控，有的是負(fù)調(diào)控缩抡，還是需要進(jìn)一步的研究來闡明背后的調(diào)控機(jī)制奠宜。
這篇文章在材料與分析方法以及寫作方面都有值得借鑒的地方，有時(shí)間可以精讀瞻想。
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