2018-06-10海冬找差集&樂(lè)樂(lè)找交集

import os
import glob

root = 'out'
cazyme= '/storage/CAZYme1'
list1 = []
list2 = []
files1 = glob.glob('out/*.txt.diamond_pdb')
for one in files1:
    list1.append(one.split('.')[0].split('/')[-1])
files2 = glob.glob('/storage/CAZYme1/*.txt')
for one in files2:
    list2.append(one.split('.')[0].split('/')[-1])
print(list2)

print(len(list1))
print(len(list2))

print (set(list2).difference(set(list1)))

ps:小服務(wù)器上面的python的strip函數(shù)好像有點(diǎn)問(wèn)題,最好用別的函數(shù)比如split()

import os
import copy
mydir = 'scan_total'
fungi_dir = '../fungi'

fungi_dirs = os.listdir(fungi_dir)
list1 = []
for roots, dirs, files, in os.walk(mydir):
    files1 = copy.deepcopy(files)
    for onefile in files:
        filename = onefile.split("_all")[0]
        list1.append(filename)
print (set(fungi_dirs)^set(list1))

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