Pymol簡(jiǎn)介
Pymol是一款操作簡(jiǎn)單佳吞，功能強(qiáng)大的分子以及蛋白的可視化軟件拱雏，由薛定諤公司研發(fā)，科研人員可以從官網(wǎng)申請(qǐng)最新教育版本底扳，同時(shí)pymo的開源版（https://github.com/schrodinger/pymol-open-source）铸抑，可以直接從網(wǎng)站上下載，但是版本較老衷模。所以鹊汛，根據(jù)需求選擇版本進(jìn)行下載菇爪。
本次選用版本為pymol 2.3.0，直接從官網(wǎng)申請(qǐng)的教育版本柒昏。
1：界面
pymol界面分為菜單欄，命令行框熙揍，以及蛋白操作界面职祷，蛋白展示界面。
2：Pymol 操作
內(nèi)容：導(dǎo)入蛋白届囚，并顯示不同的形態(tài)有梆。
DEMO：
（1）導(dǎo)入蛋白
a:直接命令行輸入
fetch PDBid
b:從PDB下載蛋白文件，從菜單欄file導(dǎo)入
（2）展示蛋白不同形態(tài)
此為pymol可以進(jìn)行蛋白展示的6種representation意系，
操作為：
pymol蛋白操作界面泥耀，點(diǎn)擊字母S，出現(xiàn)的框中蛔添，出現(xiàn)上述representation
3：Pymol蛋白動(dòng)畫制作
These make you look like a?master of PyMOL.
DEMO：制作一個(gè)簡(jiǎn)單的蛋白旋轉(zhuǎn)動(dòng)畫
制作一個(gè)類似的動(dòng)畫痰催，對(duì)于清楚的展示你做要表達(dá)的內(nèi)容十分重（la）要（feng）。
pymol的動(dòng)畫制作是一個(gè)比較繁瑣的流程翁迎瞧，此處教授一個(gè)簡(jiǎn)單的DEMO夸溶，方便入門。
流程：
Movie->Program->Camera->X-Roll->N Seconds
或者
Movie->Program->Camera->Y-Roll->N Seconds
導(dǎo)出流程：
File->Export Movie As -> MPEG->選擇GIF->save movie as->輸入文件名稱
So you just like a master.
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