學習小組Day4筆記-鵝

學習內容

1.安裝R(基礎)和Rstudio(人性化一些的界面)

注意:所有的軟件都安裝在c盤哦独撇,然后系統(tǒng)用戶名最好是不要用中文,寫代碼最怕中文字符串哦形真!

  • 生信0基礎第一步抡砂,下載R和Rstudio并且安裝在自己的電腦上面。官網(wǎng)鏈接是
    R:下載地址
    RStudio:下載地址
  • 下載后根據(jù)提示先裝R再裝RStudio(用搜狗微信搜索:[“果子學生信 給自己一個全新的R語言環(huán)境”]查看地址
    窒篱,也可看生信技能樹(嗶哩嗶哩有教程))

2.粗略了解R語言是什么焕刮,干什么的舶沿,認識Rstudio的工作界面

  • R語言資源匯總:地址
    11.png
  • R是一種編程語言,也是統(tǒng)計計算和繪圖的環(huán)境配并,它匯集了許多函數(shù)括荡,能夠提供強大的功能。
    R語言軟件界面簡陋溉旋,通常不直接使用畸冲,而是用圖形界面的Rstudio。
    RStudio是免費提供的開源集成開發(fā)環(huán)境(IDE)观腊。RStudio提供了一個具有很多功能的環(huán)境邑闲,使R更容易使用,是在終端中使用R的絕佳選擇梧油。


    24905417-7fe7e3ee25d3e416.webp.jpg

嘗試作圖

  1. plot(rnorm(50))
  • plot() 默認做散點圖苫耸,rnorm(50) 產(chǎn)生50個服從正態(tài)分布的隨機數(shù)
  • plot()函數(shù)是R中畫x-y兩個變量的函數(shù);用runif()函數(shù)產(chǎn)生了兩列隨機數(shù):x1,y1儡陨,然后用plot()函數(shù)直接畫圖褪子。
    rnorm()函數(shù)產(chǎn)生一系列的隨機數(shù),隨機數(shù)個數(shù)骗村,均值和標準差都可以設定嫌褪。

12.png

2.boxplot(iris$Sepal.Length~iris$Species,col = c("lightblue","lightyellow","lightpink"))

  • boxplot() 用于繪制盒式圖,col 用于設置繪圖的顏色胚股,橫坐標irisSpecies笼痛,縱坐標irisSepal.Length
  • iris是一個R語言自帶的數(shù)據(jù)框,通常用作示例琅拌。iris$Sepal.Length表示iris數(shù)據(jù)框的Sepal.Length這一列數(shù)據(jù)晃痴。以此類推。
  • 具體更多詳情可見R語言boxplot繪圖函數(shù)地址
13.png

3.學會外觀設置和基本操作

  • 下載打開后在tools----global opations設置分別設置pakage和外觀


    QQ圖片20201013150244.png
QQ圖片20201013150321.png
  • 基本操作
  1. 用Rproject管理工作目錄
    所謂工作目錄就是默認的讀取和儲存位置财忽,也就是說倘核,R語言只能和一個文件夾進行互動,這個文件夾非常重要即彪,做不好就會導致你的腳本紧唱、文件、圖片各種亂跑隶校,找不到漏益。
    查看這一篇,養(yǎng)成好習慣:
    正常情況下關于工作目錄的介紹是:
    設置工作目錄:setwd()
    查看工作目錄:getwd()
    這樣的話深胳,只設置了一個工作目錄绰疤。下面介紹如何并行多個項目,也就是多個工作目錄舞终。
    第一步:綠色加號灰色底——new directory——new project——命名及路徑選擇【填好文件夾名后(其實給文件夾命名了轻庆,也就等于給project命名了癣猾,二者同名)點擊Create Project,就打開了一個新的session余爆,不干擾目前正在進行的項目】
    這個方法是從生信技能樹的R語言視頻中學來的纷宇。附上鏈接:
    第二步:打開project
    生信技能樹創(chuàng)始人jimmy推薦,只用這一個方法打開Rstudio蛾方。那么下次再要打開這個項目時像捶,只需要在文件夾中找到這個R project,雙擊打開即可桩砰。

2.顯示文件列表
直接打命令不跟路徑會顯示哪里拓春?顯示默認路徑,也就是工作目錄亚隅。
相當于linux的ls硼莽。


14.png

3.加減乘除


15.png

4.賦值


16.png
  • 賦值符號用<-,這是小于號加上減號枢步,也可以按Alt加上減號
    x<- 1+2 意思是把1+2的運算結果賦值給x, 賦值后渐尿,x會顯示在右上角的框醉途,Environment里的Value列表里
    直接輸入x 回車,就會把x的值(3)打印到控制臺上,前面的那個[1]是結果的第一個砖茸。
    5.刪除變量
    > a<-3
    > b <- 1
    > c <- 4
    > u <- 5+6
    > rm(b)
    > rm(u,c)
    > rm(list = ls())#清空所有變量
    6.列出歷史命令
    history()
    7.清空控制臺
    快捷鍵ctrl+l

結語

(如果已經(jīng)安裝或者基礎較好隘擎,可以看下R for Data Science的第一章,系統(tǒng)學習作圖凉夯。 對照原書看货葬,百度R for Data Science 第一個結果就是了,免費劲够。)

?著作權歸作者所有,轉載或內容合作請聯(lián)系作者
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