文獻信息:
標題:Functional and Genomic Variation between Human-Derived Isolates of Lachnospiraceae Reveals Inter- and Intra-Species Diversity
中文:人源Lachnospiraceae分離株之間的功能和基因組變異揭示了種間和種內(nèi)多樣性
雜志:cell host and microbe
時間:2020
摘要:
屬于鉤端螺旋體科的細菌在健康人類中是微生物群落中豐富的專性厭氧成員嘶居。拉氏螺菌科通過產(chǎn)生短鏈脂肪酸澎粟,將伯膽汁酸轉(zhuǎn)化為仲膽汁酸并促進對腸道病原體的定植抗性來影響宿主辞槐。為了增進我們對該家族成員之間基因組和功能多樣性的了解通铲,我們培養(yǎng)了代表人類供體的11個屬和27個物種的273漆單藻科分離株翘瓮,并進行了全基因組測序組裝和注釋稿茉。這項分析表明歼狼,物種間和物種間的途徑存在很大差異掏导,這很可能會影響菌株對寄主健康的影響。這些差異可能會通過羊毛硫抗生素表達或腸道酸化影響定居抗性羽峰,可能通過丁酸產(chǎn)生影響宿主粘膜免疫細胞和腸上皮細胞趟咆,或者通過異質(zhì)多糖代謝促進財團內(nèi)部的協(xié)同作用。這些特定功能的鑒定可以促進益生菌菌群的發(fā)展梅屉,所述益生菌菌群驅(qū)動和/或恢復(fù)體內(nèi)微生物組功能值纱。
人體共生菌相對豐度
Lachnospiraceae分離株系統(tǒng)發(fā)生
核心基因比較分析多樣性