2020-02-19
首先登陸上bioperl官網(wǎng)??https://metacpan.org/release/BioPerl
注:以下都是在我的env下進(jìn)行
一、Bioperl安裝
1、進(jìn)度對應(yīng)模塊兒(需要安裝的東西)界面
點(diǎn)擊側(cè)邊的install instructions顽悼,如圖1(這個是blastutils的模塊兒界面)
圖1(這個模塊兒和VFDB有關(guān))和這個鏈接的東西相關(guān)
https://npm.taobao.org/package/blastutils/v/1.1.15
2涉兽、按照instructions安裝
點(diǎn)擊划纽,出現(xiàn)以下提示,锁荔,如圖2(注意,圖2是bioperl的安裝黎做,不是任何其他模塊兒的安裝說明)
1)
圖2(安裝bioperl)
根據(jù)圖2在我的環(huán)境下執(zhí)行這兩個命令叉跛,安裝結(jié)束后點(diǎn)擊 q 退出perl
2)
圖3(與ARDB相關(guān)bio::seqIO)
http://blog.sciencenet.cn/blog-306699-1059379.html?
二、使用npm安裝
另一個shell執(zhí)行了
npm install blastutils
npm install node-tool-utils --save
參考https://npm.taobao.org/package/node-tool-utils
參考:
1蒸殿、bioperl安裝(無需root權(quán)限)http://www.reibang.com/p/f348464c52da?(后面執(zhí)行build不存在昧互,這個失敗)
2、https://metacpan.org/release/BioPerl? (根據(jù)官網(wǎng)安裝提示直接安裝伟桅,時間較長敞掘,中間需要y)
3、https://npm.taobao.org/package/node-tool-utils?(使用npm安裝的提示)